MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alistipes shahii WAL 8301 draft genome

Total Repeats: 82744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_021030	CA	4	8	673155	673162	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15002	NC_021030	ACAA	2	8	673175	673182	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15003	NC_021030	TAG	2	6	673259	673264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_021030	T	6	6	673320	673325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_021030	AAT	2	6	673340	673345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15006	NC_021030	GAC	2	6	673379	673384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15007	NC_021030	GGAC	2	8	673542	673549	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15008	NC_021030	GGA	2	6	673555	673560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15009	NC_021030	CCG	2	6	673608	673613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15010	NC_021030	CCG	2	6	673644	673649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15011	NC_021030	CG	3	6	673668	673673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15012	NC_021030	GAA	2	6	673693	673698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_021030	CTC	2	6	673794	673799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15014	NC_021030	GGC	2	6	673873	673878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15015	NC_021030	CGG	2	6	673905	673910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15016	NC_021030	GCC	2	6	673916	673921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15017	NC_021030	AGG	2	6	673965	673970	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_021030	TCA	2	6	673971	673976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15019	NC_021030	GAC	2	6	673982	673987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15020	NC_021030	CGAAGG	2	12	674002	674013	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15021	NC_021030	TCC	2	6	674046	674051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15022	NC_021030	CGA	2	6	674083	674088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15023	NC_021030	C	6	6	674161	674166	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15024	NC_021030	AGG	2	6	674169	674174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_021030	CGC	2	6	674265	674270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15026	NC_021030	CAA	2	6	674311	674316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15027	NC_021030	GC	3	6	674365	674370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15028	NC_021030	GCCCA	2	10	674381	674390	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15029	NC_021030	ATC	2	6	674420	674425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15030	NC_021030	CAT	2	6	674458	674463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15031	NC_021030	CTG	2	6	674468	674473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15032	NC_021030	CGA	2	6	674476	674481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15033	NC_021030	GAG	2	6	674489	674494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_021030	CGA	2	6	674545	674550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15035	NC_021030	ACG	2	6	674622	674627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15036	NC_021030	CTCGA	2	10	674639	674648	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15037	NC_021030	TTC	2	6	674747	674752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15038	NC_021030	GGA	2	6	674770	674775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15039	NC_021030	ATC	2	6	674792	674797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15040	NC_021030	GAG	2	6	674846	674851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_021030	CAA	2	6	674899	674904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15042	NC_021030	CGC	2	6	674945	674950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15043	NC_021030	CTG	3	9	674957	674965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15044	NC_021030	CG	3	6	674967	674972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15045	NC_021030	TGA	2	6	674976	674981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15046	NC_021030	TGC	2	6	674994	674999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15047	NC_021030	TCC	2	6	675042	675047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15048	NC_021030	GAG	2	6	675077	675082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_021030	TCT	2	6	675164	675169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185615
15050	NC_021030	ACG	2	6	675208	675213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185615
15051	NC_021030	CGA	2	6	675374	675379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185615
15052	NC_021030	CGG	2	6	675430	675435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185615
15053	NC_021030	GAG	3	9	675480	675488	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185615
15054	NC_021030	CAA	2	6	675572	675577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479185615
15055	NC_021030	TTC	2	6	675591	675596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185615
15056	NC_021030	GCA	3	9	675674	675682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185615
15057	NC_021030	GACG	2	8	675695	675702	25 %	0 %	50 %	25 %	479185615
15058	NC_021030	CGC	2	6	675719	675724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185615
15059	NC_021030	GCCG	2	8	675731	675738	0 %	0 %	50 %	50 %	479185615
15060	NC_021030	CGT	2	6	675836	675841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185615
15061	NC_021030	GCG	2	6	675859	675864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185615
15062	NC_021030	CTG	2	6	675882	675887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185615
15063	NC_021030	GCC	2	6	675926	675931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15064	NC_021030	GA	3	6	675939	675944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_021030	CGG	2	6	675946	675951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15066	NC_021030	TCA	2	6	676292	676297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15067	NC_021030	CGT	2	6	676370	676375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15068	NC_021030	CGGA	2	8	676399	676406	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15069	NC_021030	CGG	2	6	676467	676472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185616
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15071	NC_021030	GAG	2	6	676504	676509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185616
15072	NC_021030	CAG	2	6	676533	676538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185616
15073	NC_021030	TGG	2	6	676580	676585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479185616
15074	NC_021030	CCGG	2	8	676627	676634	0 %	0 %	50 %	50 %	479185616
15075	NC_021030	CGA	2	6	676635	676640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185616
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15078	NC_021030	CGG	3	9	676764	676772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185616
15079	NC_021030	CTG	2	6	676777	676782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185616
15080	NC_021030	GCG	2	6	676919	676924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185616
15081	NC_021030	CGCC	2	8	676928	676935	0 %	0 %	25 %	75 %	479185616
15082	NC_021030	CGG	2	6	677024	677029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185616
15083	NC_021030	CGTG	2	8	677097	677104	0 %	25 %	50 %	25 %	479185616
15084	NC_021030	CGC	2	6	677112	677117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185616
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15088	NC_021030	A	6	6	677246	677251	100 %	0 %	0 %	0 %	479185617
15089	NC_021030	GA	3	6	677305	677310	50 %	0 %	50 %	0 %	479185617
15090	NC_021030	CGT	2	6	677319	677324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185617
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15094	NC_021030	GCG	2	6	677452	677457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185617
15095	NC_021030	GTG	2	6	677497	677502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479185617
15096	NC_021030	CTG	2	6	677521	677526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185617
15097	NC_021030	CAT	2	6	677571	677576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185617
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15099	NC_021030	TGCC	2	8	677644	677651	0 %	25 %	25 %	50 %	479185617
15100	NC_021030	GC	3	6	677684	677689	0 %	0 %	50 %	50 %	479185617
15101	NC_021030	GCG	2	6	677744	677749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15102	NC_021030	CAAAT	2	10	677765	677774	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
15103	NC_021030	GGC	2	6	677857	677862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185618
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15106	NC_021030	GC	3	6	677900	677905	0 %	0 %	50 %	50 %	479185618
15107	NC_021030	CGA	2	6	677956	677961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185618
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15121	NC_021030	CG	3	6	678591	678596	0 %	0 %	50 %	50 %	479185618
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15125	NC_021030	GCC	2	6	678789	678794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185618
15126	NC_021030	CGG	2	6	678798	678803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185618
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15128	NC_021030	GGA	2	6	678886	678891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185618
15129	NC_021030	ACC	2	6	678963	678968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479185618
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15134	NC_021030	CGC	2	6	679300	679305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185618
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15140	NC_021030	GA	3	6	679715	679720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15141	NC_021030	CGG	2	6	679751	679756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15142	NC_021030	TGC	2	6	679811	679816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15144	NC_021030	TCG	2	6	679835	679840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15145	NC_021030	CTG	2	6	679870	679875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15146	NC_021030	CGC	2	6	679889	679894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15147	NC_021030	CGC	2	6	679902	679907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15148	NC_021030	CCG	2	6	679922	679927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15150	NC_021030	GCT	2	6	680019	680024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15151	NC_021030	CGC	2	6	680025	680030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15152	NC_021030	CGT	2	6	680031	680036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15154	NC_021030	GCC	2	6	680095	680100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15155	NC_021030	CGG	2	6	680148	680153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15182	NC_021030	CGG	2	6	681232	681237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15183	NC_021030	GC	4	8	681266	681273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15185	NC_021030	CCG	2	6	681361	681366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15187	NC_021030	AGA	2	6	681504	681509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15188	NC_021030	GCC	2	6	681531	681536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15189	NC_021030	GCA	2	6	681614	681619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15190	NC_021030	CGCAC	2	10	681636	681645	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15191	NC_021030	CA	3	6	681649	681654	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15192	NC_021030	CG	3	6	681744	681749	0 %	0 %	50 %	50 %	479185620
15193	NC_021030	TC	3	6	681764	681769	0 %	50 %	0 %	50 %	479185620
15194	NC_021030	GGC	2	6	681774	681779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185620
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15198	NC_021030	AGGTGG	2	12	681862	681873	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	479185620
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15205	NC_021030	ACCG	2	8	682113	682120	25 %	0 %	25 %	50 %	479185620
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15216	NC_021030	CGA	2	6	682442	682447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185620
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15229	NC_021030	CGA	2	6	683198	683203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185620
15230	NC_021030	ACG	2	6	683206	683211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185620
15231	NC_021030	CGC	2	6	683216	683221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185620
15232	NC_021030	AGG	2	6	683230	683235	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185620
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15235	NC_021030	CGG	2	6	683308	683313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185620
15236	NC_021030	TGCCG	2	10	683360	683369	0 %	20 %	40 %	40 %	479185620
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15238	NC_021030	CGT	2	6	683396	683401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185620
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15243	NC_021030	CTG	2	6	683532	683537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185620
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15245	NC_021030	ACT	2	6	683563	683568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185620
15246	NC_021030	CAA	2	6	683597	683602	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479185620
15247	NC_021030	GAC	2	6	683655	683660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185620
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15249	NC_021030	CGG	2	6	683713	683718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185620
15250	NC_021030	CAG	2	6	683724	683729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185620
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15261	NC_021030	GACGC	2	10	684236	684245	20 %	0 %	40 %	40 %	479185621
15262	NC_021030	CGGC	2	8	684311	684318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15263	NC_021030	CGG	2	6	684352	684357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15264	NC_021030	T	7	7	684358	684364	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15265	NC_021030	CGG	2	6	684416	684421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15266	NC_021030	CGC	2	6	684429	684434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15267	NC_021030	GGC	2	6	684472	684477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15268	NC_021030	CCG	2	6	684520	684525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15269	NC_021030	N	287	287	684531	684817	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15270	NC_021030	GGA	2	6	684819	684824	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15271	NC_021030	ACGGC	2	10	684839	684848	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15272	NC_021030	GCT	2	6	684849	684854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15273	NC_021030	GAG	2	6	684877	684882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15274	NC_021030	GCT	2	6	684948	684953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15275	NC_021030	CGG	2	6	684972	684977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15277	NC_021030	GCC	2	6	685052	685057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15278	NC_021030	GCAC	2	8	685105	685112	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15279	NC_021030	ACG	2	6	685199	685204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15281	NC_021030	CGC	2	6	685275	685280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15282	NC_021030	TCG	2	6	685310	685315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15284	NC_021030	GAC	2	6	685323	685328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15285	NC_021030	CG	3	6	685353	685358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15286	NC_021030	GA	3	6	685418	685423	50 %	0 %	50 %	0 %	479185622
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15297	NC_021030	CGGC	2	8	685751	685758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15298	NC_021030	GGC	2	6	685785	685790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15301	NC_021030	GTA	2	6	686008	686013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15308	NC_021030	TCG	2	6	686190	686195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15311	NC_021030	GGT	2	6	686367	686372	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15312	NC_021030	CCA	2	6	686481	686486	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15313	NC_021030	CGC	2	6	686523	686528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15314	NC_021030	ATC	2	6	686603	686608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15329	NC_021030	TCG	2	6	687111	687116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15351	NC_021030	GGCC	2	8	688349	688356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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15363	NC_021030	GAAA	2	8	689318	689325	75 %	0 %	25 %	0 %	479185623
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15372	NC_021030	CAA	2	6	690149	690154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479185623
15373	NC_021030	GCA	2	6	690211	690216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185623
15374	NC_021030	TAC	2	6	690252	690257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185623
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15386	NC_021030	A	6	6	690880	690885	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15387	NC_021030	CAA	2	6	690905	690910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15388	NC_021030	ATC	2	6	690959	690964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15389	NC_021030	TTA	3	9	690987	690995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15390	NC_021030	T	6	6	691044	691049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15391	NC_021030	T	6	6	691054	691059	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15392	NC_021030	TTA	2	6	691066	691071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15393	NC_021030	TA	3	6	691095	691100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15394	NC_021030	ATA	2	6	691109	691114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15395	NC_021030	ACT	2	6	691130	691135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15400	NC_021030	CTG	2	6	691326	691331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185624
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15409	NC_021030	GAT	2	6	691770	691775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185624
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15420	NC_021030	A	6	6	692845	692850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15485	NC_021030	GCA	2	6	696631	696636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15487	NC_021030	CGGG	2	8	696685	696692	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15488	NC_021030	TGGAAA	2	12	696693	696704	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15489	NC_021030	CGG	2	6	696722	696727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15490	NC_021030	ATAA	2	8	696792	696799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15491	NC_021030	A	7	7	696798	696804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15492	NC_021030	AT	3	6	696824	696829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15493	NC_021030	AT	3	6	696946	696951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15494	NC_021030	TA	3	6	697001	697006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15495	NC_021030	GTTG	2	8	697018	697025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15496	NC_021030	CGT	2	6	697116	697121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185632
15497	NC_021030	AAC	2	6	697296	697301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	479185632
15498	NC_021030	AGA	2	6	697353	697358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185632
15499	NC_021030	CGTC	2	8	697367	697374	0 %	25 %	25 %	50 %	479185632
15500	NC_021030	AGA	2	6	697397	697402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185632

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