MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alistipes shahii WAL 8301 draft genome

Total Repeats: 82744

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_021030	GCG	2	6	520906	520911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185521
11502	NC_021030	ACC	2	6	520948	520953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	479185521
11503	NC_021030	GAG	2	6	520971	520976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185521
11504	NC_021030	GCGCG	2	10	520988	520997	0 %	0 %	60 %	40 %	479185521
11505	NC_021030	GCT	2	6	521012	521017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185521
11506	NC_021030	GCG	2	6	521025	521030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185521
11507	NC_021030	TTC	2	6	521031	521036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185521
11508	NC_021030	TCC	2	6	521051	521056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479185521
11509	NC_021030	GC	4	8	521058	521065	0 %	0 %	50 %	50 %	479185521
11510	NC_021030	GAT	2	6	521066	521071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185521
11511	NC_021030	GTC	2	6	521117	521122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185521
11512	NC_021030	CCG	2	6	521182	521187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185521
11513	NC_021030	CGC	2	6	521198	521203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185521
11514	NC_021030	TCGA	2	8	521301	521308	25 %	25 %	25 %	25 %	479185521
11515	NC_021030	CGC	2	6	521332	521337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185521
11516	NC_021030	GGCGA	2	10	521454	521463	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11517	NC_021030	GCG	2	6	521523	521528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11518	NC_021030	GGA	2	6	521628	521633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185522
11519	NC_021030	CTA	2	6	521682	521687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185522
11520	NC_021030	AGG	2	6	521696	521701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185522
11521	NC_021030	GCG	2	6	521726	521731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185522
11522	NC_021030	TCG	2	6	521746	521751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185522
11523	NC_021030	CGA	3	9	521787	521795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185522
11524	NC_021030	GCG	2	6	521835	521840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185522
11525	NC_021030	GCG	2	6	521864	521869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185522
11526	NC_021030	TGTCG	2	10	522054	522063	0 %	40 %	40 %	20 %	479185522
11527	NC_021030	CGG	2	6	522072	522077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185522
11528	NC_021030	GAG	2	6	522100	522105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	479185522
11529	NC_021030	GGC	2	6	522224	522229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185522
11530	NC_021030	TCT	2	6	522266	522271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185522
11531	NC_021030	GC	3	6	522288	522293	0 %	0 %	50 %	50 %	479185522
11532	NC_021030	TGCG	2	8	522320	522327	0 %	25 %	50 %	25 %	479185522
11533	NC_021030	ACG	2	6	522335	522340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185522
11534	NC_021030	CG	3	6	522347	522352	0 %	0 %	50 %	50 %	479185522
11535	NC_021030	CGG	2	6	522356	522361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185522
11536	NC_021030	CGG	2	6	522377	522382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185522
11537	NC_021030	GC	3	6	522416	522421	0 %	0 %	50 %	50 %	479185522
11538	NC_021030	CCG	2	6	522489	522494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11539	NC_021030	GTCCG	2	10	522535	522544	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11540	NC_021030	CT	3	6	522568	522573	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11541	NC_021030	TTGG	2	8	522640	522647	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11542	NC_021030	TCC	2	6	522679	522684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	479185523
11543	NC_021030	T	6	6	522702	522707	0 %	100 %	0 %	0 %	479185523
11544	NC_021030	CCG	2	6	522718	522723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185523
11545	NC_021030	CAG	2	6	522765	522770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185523
11546	NC_021030	GC	4	8	522808	522815	0 %	0 %	50 %	50 %	479185523
11547	NC_021030	CGG	2	6	522817	522822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185523
11548	NC_021030	CGC	2	6	522881	522886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185523
11549	NC_021030	GAT	2	6	522888	522893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185523
11550	NC_021030	CGG	3	9	523028	523036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185523
11551	NC_021030	GCC	2	6	523075	523080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185523
11552	NC_021030	ACG	2	6	523081	523086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185523
11553	NC_021030	GCG	2	6	523127	523132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185523
11554	NC_021030	CGT	2	6	523218	523223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185523
11555	NC_021030	CCG	2	6	523262	523267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185523
11556	NC_021030	GAT	2	6	523296	523301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185523
11557	NC_021030	GCGA	2	8	523330	523337	25 %	0 %	50 %	25 %	479185523
11558	NC_021030	CG	3	6	523428	523433	0 %	0 %	50 %	50 %	479185523
11559	NC_021030	GCG	2	6	523587	523592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11560	NC_021030	GTC	2	6	523604	523609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11561	NC_021030	CGG	2	6	523632	523637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11562	NC_021030	GGC	2	6	523648	523653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11563	NC_021030	CGG	3	9	523673	523681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11564	NC_021030	CCGG	2	8	523693	523700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11565	NC_021030	GCG	3	9	523721	523729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11566	NC_021030	AT	3	6	523760	523765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_021030	T	6	6	523792	523797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_021030	CT	3	6	523829	523834	0 %	50 %	0 %	50 %	479185524
11569	NC_021030	TCG	2	6	523837	523842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185524
11570	NC_021030	CTG	2	6	523870	523875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185524
11571	NC_021030	TCG	2	6	523894	523899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185524
11572	NC_021030	CGT	2	6	523931	523936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185524
11573	NC_021030	CTG	2	6	523957	523962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185524
11574	NC_021030	CTG	2	6	524011	524016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185524
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11577	NC_021030	GAT	2	6	524127	524132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185524
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11579	NC_021030	TCG	2	6	524189	524194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185524
11580	NC_021030	TGC	2	6	524201	524206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185524
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11585	NC_021030	CTG	2	6	524349	524354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185524
11586	NC_021030	GC	3	6	524369	524374	0 %	0 %	50 %	50 %	479185524
11587	NC_021030	TTC	2	6	524377	524382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185524
11588	NC_021030	CTG	2	6	524395	524400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185524
11589	NC_021030	GCG	2	6	524405	524410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185524
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11591	NC_021030	CTG	2	6	524623	524628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185524
11592	NC_021030	GGC	2	6	524634	524639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185524
11593	NC_021030	GTCG	2	8	524643	524650	0 %	25 %	50 %	25 %	479185524
11594	NC_021030	CGGC	2	8	524683	524690	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11595	NC_021030	GCG	2	6	524693	524698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11596	NC_021030	GTA	2	6	524845	524850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185525
11597	NC_021030	GGT	2	6	524853	524858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	479185525
11598	NC_021030	GAGCC	2	10	524877	524886	20 %	0 %	40 %	40 %	479185525
11599	NC_021030	GGTC	2	8	524910	524917	0 %	25 %	50 %	25 %	479185525
11600	NC_021030	AT	3	6	524945	524950	50 %	50 %	0 %	0 %	479185525
11601	NC_021030	CGC	2	6	524997	525002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185525
11602	NC_021030	CGA	2	6	525003	525008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185525
11603	NC_021030	AGC	2	6	525053	525058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185525
11604	NC_021030	CG	3	6	525072	525077	0 %	0 %	50 %	50 %	479185525
11605	NC_021030	GGTG	2	8	525099	525106	0 %	25 %	75 %	0 %	479185525
11606	NC_021030	AGA	2	6	525114	525119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185525
11607	NC_021030	CG	3	6	525189	525194	0 %	0 %	50 %	50 %	479185525
11608	NC_021030	AGC	2	6	525239	525244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185525
11609	NC_021030	GTA	2	6	525262	525267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	479185525
11610	NC_021030	CGT	2	6	525297	525302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185525
11611	NC_021030	GCCCAC	2	12	525307	525318	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	479185525
11612	NC_021030	TCCT	2	8	525370	525377	0 %	50 %	0 %	50 %	479185525
11613	NC_021030	CGG	2	6	525404	525409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185525
11614	NC_021030	ATC	2	6	525410	525415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	479185525
11615	NC_021030	GAC	2	6	525429	525434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185525
11616	NC_021030	CGG	2	6	525516	525521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185525
11617	NC_021030	GCT	2	6	525545	525550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11618	NC_021030	CAG	3	9	525553	525561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11619	NC_021030	TTC	2	6	525572	525577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11620	NC_021030	CAG	2	6	525686	525691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185526
11621	NC_021030	GGC	2	6	525769	525774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	479185526
11622	NC_021030	CAG	2	6	525782	525787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185526
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11755	NC_021030	TCG	2	6	530852	530857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	479185529
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11835	NC_021030	GAG	2	6	534772	534777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11841	NC_021030	GCG	2	6	535202	535207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11842	NC_021030	TCT	2	6	535220	535225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11843	NC_021030	GCC	2	6	535250	535255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11844	NC_021030	CGC	2	6	535302	535307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11845	NC_021030	CCT	2	6	535415	535420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11852	NC_021030	CGTG	2	8	535778	535785	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11853	NC_021030	T	8	8	535854	535861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11854	NC_021030	GAA	2	6	535889	535894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	479185532
11855	NC_021030	CTT	2	6	535917	535922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	479185532
11856	NC_021030	T	7	7	535957	535963	0 %	100 %	0 %	0 %	479185532
11857	NC_021030	GCC	2	6	535985	535990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185532
11858	NC_021030	AGC	2	6	535998	536003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185532
11859	NC_021030	CAG	2	6	536147	536152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	479185532
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11861	NC_021030	CCG	2	6	536200	536205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	479185532
11862	NC_021030	CG	3	6	536221	536226	0 %	0 %	50 %	50 %	479185532
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11866	NC_021030	GTC	2	6	536414	536419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11870	NC_021030	CGC	2	6	536580	536585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11980	NC_021030	GC	4	8	540634	540641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11981	NC_021030	GCC	2	6	540694	540699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11982	NC_021030	TGG	2	6	540763	540768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11983	NC_021030	TGG	2	6	540823	540828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11985	NC_021030	CTCG	2	8	540902	540909	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11986	NC_021030	CGA	3	9	540947	540955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11987	NC_021030	GCAGA	2	10	540972	540981	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11988	NC_021030	AAC	2	6	541041	541046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11989	NC_021030	GCG	2	6	541060	541065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11990	NC_021030	GAC	2	6	541095	541100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11991	NC_021030	CG	3	6	541136	541141	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11992	NC_021030	CAG	2	6	541146	541151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11993	NC_021030	ACA	2	6	541195	541200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11994	NC_021030	CTA	2	6	541211	541216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11995	NC_021030	GAG	2	6	541323	541328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11996	NC_021030	GAG	2	6	541344	541349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11997	NC_021030	AGC	2	6	541366	541371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11998	NC_021030	TGC	2	6	541420	541425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11999	NC_021030	CGC	3	9	541430	541438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12000	NC_021030	GC	3	6	541443	541448	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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