MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Anabaena sp. 90 plasmid pANA03

Total Repeats: 406

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019440	ATT	2	6	97	102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019440	GGA	2	6	265	270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079805
3	NC_019440	CAA	2	6	309	314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079805
4	NC_019440	GCT	2	6	367	372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_019440	AGA	2	6	579	584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079806
6	NC_019440	TAC	2	6	645	650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079807
7	NC_019440	GTT	2	6	814	819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079807
8	NC_019440	ATT	2	6	842	847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079807
9	NC_019440	ATTT	2	8	872	879	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019440	T	8	8	877	884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_019440	A	7	7	927	933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_019440	A	7	7	1007	1013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019440	T	6	6	1024	1029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019440	AAT	2	6	1046	1051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019440	ATA	2	6	1076	1081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_019440	ATT	2	6	1083	1088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_019440	CATTGT	2	12	1167	1178	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_019440	TAG	2	6	1232	1237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_019440	AAT	2	6	1257	1262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_019440	CAAA	2	8	1299	1306	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_019440	A	6	6	1338	1343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_019440	TGTA	2	8	1514	1521	25 %	50 %	25 %	0 %	414079808
23	NC_019440	TTA	2	6	1536	1541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_019440	CTTT	2	8	1581	1588	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_019440	T	6	6	1610	1615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_019440	AGT	2	6	1661	1666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_019440	CAGA	2	8	1710	1717	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_019440	TGCT	2	8	1749	1756	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_019440	T	8	8	1798	1805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_019440	ATT	2	6	1828	1833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_019440	TGA	2	6	1915	1920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079809
32	NC_019440	A	6	6	1922	1927	100 %	0 %	0 %	0 %	414079809
33	NC_019440	CATA	2	8	1984	1991	50 %	25 %	0 %	25 %	414079809
34	NC_019440	GCA	2	6	2018	2023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079809
35	NC_019440	TAA	2	6	2024	2029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079809
36	NC_019440	A	8	8	2109	2116	100 %	0 %	0 %	0 %	414079810
37	NC_019440	TA	3	6	2207	2212	50 %	50 %	0 %	0 %	414079810
38	NC_019440	CTA	2	6	2213	2218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079810
39	NC_019440	GTA	2	6	2231	2236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079810
40	NC_019440	TCAA	2	8	2240	2247	50 %	25 %	0 %	25 %	414079810
41	NC_019440	T	7	7	2249	2255	0 %	100 %	0 %	0 %	414079810
42	NC_019440	AAGA	2	8	2305	2312	75 %	0 %	25 %	0 %	414079811
43	NC_019440	ATT	2	6	2409	2414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079811
44	NC_019440	AAC	2	6	2467	2472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
45	NC_019440	G	6	6	2528	2533	0 %	0 %	100 %	0 %	414079812
46	NC_019440	AT	3	6	2550	2555	50 %	50 %	0 %	0 %	414079812
47	NC_019440	CAG	2	6	2684	2689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079812
48	NC_019440	T	6	6	2699	2704	0 %	100 %	0 %	0 %	414079812
49	NC_019440	TTA	2	6	2869	2874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079812
50	NC_019440	CAA	2	6	2946	2951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
51	NC_019440	AAT	2	6	2979	2984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079812
52	NC_019440	A	7	7	2997	3003	100 %	0 %	0 %	0 %	414079812
53	NC_019440	AC	3	6	3005	3010	50 %	0 %	0 %	50 %	414079812
54	NC_019440	CGG	2	6	3022	3027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	414079812
55	NC_019440	CAG	2	6	3044	3049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079812
56	NC_019440	ATC	2	6	3084	3089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079812
57	NC_019440	GTA	2	6	3158	3163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
58	NC_019440	TGA	2	6	3264	3269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
59	NC_019440	C	7	7	3287	3293	0 %	0 %	0 %	100 %	414079812
60	NC_019440	ATT	2	6	3316	3321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414079812
61	NC_019440	AGCA	2	8	3330	3337	50 %	0 %	25 %	25 %	414079812
62	NC_019440	GAT	2	6	3364	3369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
63	NC_019440	CAA	2	6	3427	3432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
64	NC_019440	CAAAA	2	10	3437	3446	80 %	0 %	0 %	20 %	414079812
65	NC_019440	AACTA	2	10	3471	3480	60 %	20 %	0 %	20 %	414079812
66	NC_019440	GA	3	6	3600	3605	50 %	0 %	50 %	0 %	414079812
67	NC_019440	TCA	2	6	3617	3622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079812
68	NC_019440	AGGAAC	2	12	3632	3643	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	414079812
69	NC_019440	A	6	6	3649	3654	100 %	0 %	0 %	0 %	414079812
70	NC_019440	A	6	6	3662	3667	100 %	0 %	0 %	0 %	414079812
71	NC_019440	A	7	7	3694	3700	100 %	0 %	0 %	0 %	414079812
72	NC_019440	T	6	6	3720	3725	0 %	100 %	0 %	0 %	414079812
73	NC_019440	GGA	2	6	3736	3741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079812
74	NC_019440	AGC	2	6	3747	3752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079812
75	NC_019440	CAA	2	6	3848	3853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
76	NC_019440	GGA	2	6	3966	3971	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079812
77	NC_019440	AG	3	6	3988	3993	50 %	0 %	50 %	0 %	414079812
78	NC_019440	A	6	6	4042	4047	100 %	0 %	0 %	0 %	414079812
79	NC_019440	ACA	2	6	4058	4063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
80	NC_019440	GAT	2	6	4225	4230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
81	NC_019440	GGA	2	6	4258	4263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079812
82	NC_019440	TAA	2	6	4323	4328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079812
83	NC_019440	TTC	2	6	4364	4369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414079812
84	NC_019440	TGA	2	6	4383	4388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
85	NC_019440	GGT	2	6	4409	4414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414079812
86	NC_019440	TTTG	2	8	4452	4459	0 %	75 %	25 %	0 %	414079812
87	NC_019440	TA	4	8	4508	4515	50 %	50 %	0 %	0 %	414079812
88	NC_019440	A	7	7	4563	4569	100 %	0 %	0 %	0 %	414079812
89	NC_019440	GAC	2	6	4598	4603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079812
90	NC_019440	AAT	2	6	4606	4611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079812
91	NC_019440	GAT	2	6	4731	4736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
92	NC_019440	CTA	2	6	4798	4803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079812
93	NC_019440	A	6	6	4826	4831	100 %	0 %	0 %	0 %	414079812
94	NC_019440	ACT	2	6	4859	4864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079812
95	NC_019440	TAGA	2	8	4865	4872	50 %	25 %	25 %	0 %	414079812
96	NC_019440	AAG	2	6	4882	4887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079812
97	NC_019440	AAG	2	6	4923	4928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079812
98	NC_019440	CTG	2	6	4937	4942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079812
99	NC_019440	AAG	2	6	4948	4953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079812
100	NC_019440	GGA	2	6	4992	4997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079812
101	NC_019440	A	6	6	4997	5002	100 %	0 %	0 %	0 %	414079812
102	NC_019440	TTG	2	6	5021	5026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079812
103	NC_019440	A	8	8	5057	5064	100 %	0 %	0 %	0 %	414079812
104	NC_019440	AC	3	6	5069	5074	50 %	0 %	0 %	50 %	414079812
105	NC_019440	A	7	7	5111	5117	100 %	0 %	0 %	0 %	414079812
106	NC_019440	TTG	2	6	5132	5137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079812
107	NC_019440	TTG	2	6	5143	5148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079812
108	NC_019440	GACCC	2	10	5227	5236	20 %	0 %	20 %	60 %	414079812
109	NC_019440	CAA	2	6	5309	5314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
110	NC_019440	CAA	2	6	5378	5383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
111	NC_019440	T	6	6	5451	5456	0 %	100 %	0 %	0 %	414079812
112	NC_019440	CAA	2	6	5466	5471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
113	NC_019440	CAA	2	6	5476	5481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
114	NC_019440	CAA	2	6	5486	5491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
115	NC_019440	CAA	2	6	5537	5542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079812
116	NC_019440	TAA	2	6	5556	5561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079812
117	NC_019440	A	7	7	5643	5649	100 %	0 %	0 %	0 %	414079812
118	NC_019440	CTG	2	6	5660	5665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079812
119	NC_019440	G	6	6	5673	5678	0 %	0 %	100 %	0 %	414079812
120	NC_019440	TGA	2	6	5685	5690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414079812
121	NC_019440	GTT	2	6	5694	5699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079812
122	NC_019440	TGC	2	6	5779	5784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_019440	AGTA	2	8	5853	5860	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_019440	A	7	7	5946	5952	100 %	0 %	0 %	0 %	414079813
125	NC_019440	ACA	2	6	5988	5993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079813
126	NC_019440	GCTCAA	2	12	6013	6024	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	414079813
127	NC_019440	A	6	6	6104	6109	100 %	0 %	0 %	0 %	414079813
128	NC_019440	AGC	2	6	6127	6132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079813
129	NC_019440	GCT	2	6	6212	6217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079813
130	NC_019440	TGC	2	6	6335	6340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079813
131	NC_019440	A	6	6	6358	6363	100 %	0 %	0 %	0 %	414079813
132	NC_019440	AAC	2	6	6425	6430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079813
133	NC_019440	AAC	2	6	6434	6439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414079813
134	NC_019440	GGA	2	6	6444	6449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079813
135	NC_019440	GA	3	6	6481	6486	50 %	0 %	50 %	0 %	414079813
136	NC_019440	CAG	2	6	6497	6502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079813
137	NC_019440	GAAAG	2	10	6555	6564	60 %	0 %	40 %	0 %	414079813
138	NC_019440	AATG	2	8	6571	6578	50 %	25 %	25 %	0 %	414079813
139	NC_019440	GAT	2	6	6607	6612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_019440	AG	3	6	6732	6737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019440	GCTT	2	8	6792	6799	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_019440	AGT	2	6	6839	6844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_019440	AGT	2	6	6944	6949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019440	TAA	2	6	6964	6969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_019440	A	6	6	6986	6991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_019440	AGG	2	6	7265	7270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	414079814
147	NC_019440	GTT	2	6	7280	7285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079814
148	NC_019440	GTT	2	6	7415	7420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079814
149	NC_019440	CAG	2	6	7444	7449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414079814
150	NC_019440	ATA	2	6	7493	7498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_019440	AT	3	6	7504	7509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_019440	ATA	2	6	7516	7521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_019440	TACAA	2	10	7578	7587	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NC_019440	AAT	2	6	7621	7626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_019440	TTG	2	6	7730	7735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414079815
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158	NC_019440	TAA	2	6	7843	7848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414079815
159	NC_019440	ACGTC	2	10	7913	7922	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
160	NC_019440	TAA	2	6	7998	8003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_019440	AGTC	2	8	8121	8128	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
162	NC_019440	ACC	2	6	8167	8172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_019440	CGTC	2	8	8207	8214	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
164	NC_019440	GTCC	3	12	8220	8231	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
165	NC_019440	CAT	2	6	8254	8259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
166	NC_019440	GAA	2	6	8306	8311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
167	NC_019440	TGA	2	6	8317	8322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
168	NC_019440	ATA	2	6	8324	8329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_019440	TA	3	6	8334	8339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_019440	AAG	2	6	8428	8433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414079816
171	NC_019440	TA	3	6	8456	8461	50 %	50 %	0 %	0 %	414079816
172	NC_019440	A	6	6	8495	8500	100 %	0 %	0 %	0 %	414079816
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176	NC_019440	A	7	7	8573	8579	100 %	0 %	0 %	0 %	414079816
177	NC_019440	AAAT	2	8	8599	8606	75 %	25 %	0 %	0 %	414079816
178	NC_019440	A	6	6	8634	8639	100 %	0 %	0 %	0 %	414079816
179	NC_019440	TGTT	2	8	8644	8651	0 %	75 %	25 %	0 %	414079816
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182	NC_019440	GAAG	2	8	8896	8903	50 %	0 %	50 %	0 %	414079816
183	NC_019440	A	6	6	8907	8912	100 %	0 %	0 %	0 %	414079816
184	NC_019440	T	6	6	8955	8960	0 %	100 %	0 %	0 %	414079816
185	NC_019440	TACA	2	8	9036	9043	50 %	25 %	0 %	25 %	414079816
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252	NC_019440	TAC	2	6	12608	12613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_019440	ATT	2	6	12618	12623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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255	NC_019440	TAC	2	6	12717	12722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
256	NC_019440	ATT	2	6	12728	12733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_019440	AGT	2	6	12741	12746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_019440	GTG	2	6	13000	13005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
264	NC_019440	C	6	6	13023	13028	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
265	NC_019440	TGC	2	6	13077	13082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414079819
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268	NC_019440	TGAA	2	8	13232	13239	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
269	NC_019440	GTC	2	6	13272	13277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_019440	TTTTG	2	10	13278	13287	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
271	NC_019440	AAT	2	6	13341	13346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_019440	GAT	2	6	13362	13367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
273	NC_019440	TA	3	6	13378	13383	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_019440	ATA	2	6	13396	13401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_019440	TGT	2	6	13416	13421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
276	NC_019440	AAAC	2	8	13521	13528	75 %	0 %	0 %	25 %	414079820
277	NC_019440	AT	3	6	13553	13558	50 %	50 %	0 %	0 %	414079820
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404	NC_019440	CAT	2	6	19784	19789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414079826
405	NC_019440	ATAG	2	8	19815	19822	50 %	25 %	25 %	0 %	414079826
406	NC_019440	GCAA	2	8	19888	19895	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.