MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alpha proteobacterium HIMB59 chromosome

Total Repeats: 35939

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_018644	TTC	2	6	140129	140134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707184
3502	NC_018644	TG	4	8	140158	140165	0 %	50 %	50 %	0 %	406707184
3503	NC_018644	A	6	6	140168	140173	100 %	0 %	0 %	0 %	406707184
3504	NC_018644	GTA	2	6	140249	140254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707184
3505	NC_018644	AAG	3	9	140291	140299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707184
3506	NC_018644	AAG	2	6	140303	140308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707184
3507	NC_018644	TAAA	2	8	140320	140327	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_018644	ATT	2	6	140338	140343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_018644	ATCA	2	8	140408	140415	50 %	25 %	0 %	25 %	406707185
3510	NC_018644	T	6	6	140447	140452	0 %	100 %	0 %	0 %	406707185
3511	NC_018644	TGAC	3	12	140456	140467	25 %	25 %	25 %	25 %	406707185
3512	NC_018644	TGGA	2	8	140491	140498	25 %	25 %	50 %	0 %	406707185
3513	NC_018644	GTT	2	6	140503	140508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406707185
3514	NC_018644	TAA	2	6	140540	140545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707185
3515	NC_018644	TTG	2	6	140577	140582	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406707185
3516	NC_018644	ATA	2	6	140583	140588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707185
3517	NC_018644	TTC	2	6	140609	140614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707185
3518	NC_018644	TGT	2	6	140657	140662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406707185
3519	NC_018644	TGC	2	6	140720	140725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707185
3520	NC_018644	AGG	2	6	140729	140734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406707185
3521	NC_018644	ATA	2	6	140738	140743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707185
3522	NC_018644	AGC	2	6	140768	140773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406707185
3523	NC_018644	AAGC	2	8	140779	140786	50 %	0 %	25 %	25 %	406707185
3524	NC_018644	ATCC	2	8	140808	140815	25 %	25 %	0 %	50 %	406707185
3525	NC_018644	TTC	2	6	140891	140896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707185
3526	NC_018644	ATC	2	6	140912	140917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707185
3527	NC_018644	TCT	2	6	140958	140963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707185
3528	NC_018644	GAAA	2	8	141000	141007	75 %	0 %	25 %	0 %	406707185
3529	NC_018644	TTA	2	6	141033	141038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707185
3530	NC_018644	T	9	9	141058	141066	0 %	100 %	0 %	0 %	406707185
3531	NC_018644	TC	3	6	141178	141183	0 %	50 %	0 %	50 %	406707185
3532	NC_018644	A	6	6	141195	141200	100 %	0 %	0 %	0 %	406707185
3533	NC_018644	TGA	2	6	141222	141227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707185
3534	NC_018644	TCA	2	6	141291	141296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707185
3535	NC_018644	AT	3	6	141321	141326	50 %	50 %	0 %	0 %	406707185
3536	NC_018644	T	6	6	141347	141352	0 %	100 %	0 %	0 %	406707185
3537	NC_018644	GTT	2	6	141446	141451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406707185
3538	NC_018644	TGA	2	6	141540	141545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707185
3539	NC_018644	GA	3	6	141576	141581	50 %	0 %	50 %	0 %	406707185
3540	NC_018644	AAT	2	6	141695	141700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707185
3541	NC_018644	GAA	3	9	141714	141722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707185
3542	NC_018644	TCTT	2	8	141726	141733	0 %	75 %	0 %	25 %	406707185
3543	NC_018644	T	8	8	141765	141772	0 %	100 %	0 %	0 %	406707185
3544	NC_018644	TCA	2	6	141854	141859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707186
3545	NC_018644	CA	3	6	141858	141863	50 %	0 %	0 %	50 %	406707186
3546	NC_018644	ATC	2	6	141874	141879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707186
3547	NC_018644	ACTA	2	8	141936	141943	50 %	25 %	0 %	25 %	406707186
3548	NC_018644	ATG	2	6	142039	142044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707186
3549	NC_018644	TAG	2	6	142046	142051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707186
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3552	NC_018644	AAG	2	6	142265	142270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707186
3553	NC_018644	GAA	2	6	142317	142322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707186
3554	NC_018644	CAT	2	6	142368	142373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707186
3555	NC_018644	GA	3	6	142483	142488	50 %	0 %	50 %	0 %	406707186
3556	NC_018644	AAT	2	6	142497	142502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707186
3557	NC_018644	AT	3	6	142533	142538	50 %	50 %	0 %	0 %	406707186
3558	NC_018644	TAA	2	6	142574	142579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707187
3559	NC_018644	AT	3	6	142588	142593	50 %	50 %	0 %	0 %	406707187
3560	NC_018644	CTT	2	6	142651	142656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707187
3561	NC_018644	ATT	2	6	142848	142853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707187
3562	NC_018644	AAT	2	6	142922	142927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707187
3563	NC_018644	CAC	2	6	142955	142960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406707187
3564	NC_018644	CCA	2	6	143073	143078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406707187
3565	NC_018644	T	6	6	143102	143107	0 %	100 %	0 %	0 %	406707187
3566	NC_018644	T	6	6	143134	143139	0 %	100 %	0 %	0 %	406707187
3567	NC_018644	ATC	2	6	143247	143252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707187
3568	NC_018644	TAA	2	6	143275	143280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707187
3569	NC_018644	AAG	2	6	143375	143380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406707187
3570	NC_018644	TTATA	2	10	143509	143518	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_018644	ATC	2	6	143598	143603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707188
3572	NC_018644	AAT	2	6	143621	143626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707188
3573	NC_018644	GAT	2	6	143684	143689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707188
3574	NC_018644	TCC	2	6	143933	143938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406707188
3575	NC_018644	GAT	3	9	143963	143971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707188
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3577	NC_018644	TGAT	2	8	143990	143997	25 %	50 %	25 %	0 %	406707188
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3579	NC_018644	AATA	2	8	144018	144025	75 %	25 %	0 %	0 %	406707188
3580	NC_018644	TAA	2	6	144056	144061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707188
3581	NC_018644	T	6	6	144076	144081	0 %	100 %	0 %	0 %	406707188
3582	NC_018644	AATA	2	8	144089	144096	75 %	25 %	0 %	0 %	406707188
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3585	NC_018644	A	6	6	144368	144373	100 %	0 %	0 %	0 %	406707188
3586	NC_018644	AAAG	2	8	144409	144416	75 %	0 %	25 %	0 %	406707188
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3591	NC_018644	TGA	2	6	144705	144710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707189
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3593	NC_018644	ATA	2	6	144799	144804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707189
3594	NC_018644	ATA	2	6	144819	144824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707189
3595	NC_018644	GGT	2	6	144861	144866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406707189
3596	NC_018644	CAAT	2	8	144869	144876	50 %	25 %	0 %	25 %	406707189
3597	NC_018644	T	6	6	144969	144974	0 %	100 %	0 %	0 %	406707189
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3601	NC_018644	T	6	6	145053	145058	0 %	100 %	0 %	0 %	406707189
3602	NC_018644	TCC	2	6	145061	145066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406707189
3603	NC_018644	TAAA	2	8	145111	145118	75 %	25 %	0 %	0 %	406707189
3604	NC_018644	T	6	6	145122	145127	0 %	100 %	0 %	0 %	406707189
3605	NC_018644	CT	3	6	145129	145134	0 %	50 %	0 %	50 %	406707190
3606	NC_018644	ATA	2	6	145209	145214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707190
3607	NC_018644	ATG	2	6	145249	145254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707190
3608	NC_018644	GAT	2	6	145275	145280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707190
3609	NC_018644	GTT	2	6	145324	145329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406707191
3610	NC_018644	T	7	7	145349	145355	0 %	100 %	0 %	0 %	406707191
3611	NC_018644	CTT	2	6	145552	145557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707191
3612	NC_018644	ATC	3	9	145562	145570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707191
3613	NC_018644	T	6	6	145601	145606	0 %	100 %	0 %	0 %	406707191
3614	NC_018644	T	7	7	145644	145650	0 %	100 %	0 %	0 %	406707191
3615	NC_018644	ATA	2	6	145716	145721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707191
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3618	NC_018644	CTA	2	6	145912	145917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707191
3619	NC_018644	ATAG	2	8	145978	145985	50 %	25 %	25 %	0 %	406707191
3620	NC_018644	ATC	2	6	145994	145999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707191
3621	NC_018644	GAAA	2	8	146065	146072	75 %	0 %	25 %	0 %	406707191
3622	NC_018644	ACT	2	6	146124	146129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707191
3623	NC_018644	GGGTT	2	10	146180	146189	0 %	40 %	60 %	0 %	406707191
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3625	NC_018644	TCA	2	6	146259	146264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707191
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3750	NC_018644	AG	3	6	151196	151201	50 %	0 %	50 %	0 %	406707196
3751	NC_018644	TTC	2	6	151221	151226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707196
3752	NC_018644	TGA	2	6	151234	151239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707196
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3765	NC_018644	TTA	2	6	152348	152353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707198
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3767	NC_018644	GAG	2	6	152420	152425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406707198
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3772	NC_018644	TCT	2	6	152736	152741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406707198
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3781	NC_018644	AGG	2	6	153264	153269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406707199
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3806	NC_018644	TC	3	6	154186	154191	0 %	50 %	0 %	50 %	406707199
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3816	NC_018644	AAAG	2	8	154533	154540	75 %	0 %	25 %	0 %	406707199
3817	NC_018644	TA	3	6	154620	154625	50 %	50 %	0 %	0 %	406707199
3818	NC_018644	ATA	2	6	154660	154665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707199
3819	NC_018644	AATG	2	8	154728	154735	50 %	25 %	25 %	0 %	406707199
3820	NC_018644	GA	4	8	154784	154791	50 %	0 %	50 %	0 %	406707199
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3839	NC_018644	AG	3	6	155627	155632	50 %	0 %	50 %	0 %	406707200
3840	NC_018644	TCA	2	6	155664	155669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707200
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3842	NC_018644	GAT	2	6	155714	155719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707200
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3846	NC_018644	A	8	8	155938	155945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3847	NC_018644	GCC	2	6	155957	155962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3854	NC_018644	ACC	2	6	156457	156462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406707201
3855	NC_018644	ATATGG	2	12	156538	156549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406707201
3856	NC_018644	ATT	2	6	156559	156564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406707201
3857	NC_018644	CTG	2	6	156597	156602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707201
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3864	NC_018644	ACC	2	6	156817	156822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406707201
3865	NC_018644	AGCA	2	8	156823	156830	50 %	0 %	25 %	25 %	406707201
3866	NC_018644	ACA	2	6	156926	156931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406707201
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3868	NC_018644	TCA	2	6	157008	157013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406707201
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3996	NC_018644	GTC	2	6	164133	164138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406707207
3997	NC_018644	TACT	2	8	164248	164255	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3998	NC_018644	C	6	6	164260	164265	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3999	NC_018644	TCCA	2	8	164281	164288	25 %	25 %	0 %	50 %	406707208
4000	NC_018644	TAA	3	9	164363	164371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406707208

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