MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alteromonas macleodii ATCC 27126 chromosome

Total Repeats: 85629

< Previous12...160161162163164165166167168169170171172Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
85501	NC_018632	TCT	2	6	4647279	4647284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598865
85502	NC_018632	CGG	2	6	4647306	4647311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406598865
85503	NC_018632	AACCT	2	10	4647324	4647333	40 %	20 %	0 %	40 %	406598865
85504	NC_018632	TTC	2	6	4647480	4647485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598865
85505	NC_018632	AC	3	6	4647490	4647495	50 %	0 %	0 %	50 %	406598865
85506	NC_018632	AC	4	8	4647504	4647511	50 %	0 %	0 %	50 %	406598865
85507	NC_018632	TCA	2	6	4647513	4647518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598865
85508	NC_018632	TGAT	2	8	4647549	4647556	25 %	50 %	25 %	0 %	406598865
85509	NC_018632	CAT	2	6	4647734	4647739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598865
85510	NC_018632	GTC	2	6	4647767	4647772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598865
85511	NC_018632	GCA	2	6	4647777	4647782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598865
85512	NC_018632	TCAGA	2	10	4647862	4647871	40 %	20 %	20 %	20 %	406598865
85513	NC_018632	T	6	6	4647899	4647904	0 %	100 %	0 %	0 %	406598865
85514	NC_018632	GCT	2	6	4647910	4647915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598865
85515	NC_018632	CTT	2	6	4647928	4647933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598865
85516	NC_018632	TTG	2	6	4648005	4648010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598865
85517	NC_018632	CTT	2	6	4648067	4648072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598866
85518	NC_018632	CCA	2	6	4648090	4648095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406598866
85519	NC_018632	ATC	2	6	4648109	4648114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598866
85520	NC_018632	TTG	2	6	4648142	4648147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598866
85521	NC_018632	CAC	2	6	4648154	4648159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406598866
85522	NC_018632	TTG	2	6	4648162	4648167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598866
85523	NC_018632	TTG	2	6	4648203	4648208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598866
85524	NC_018632	CCAA	2	8	4648258	4648265	50 %	0 %	0 %	50 %	406598866
85525	NC_018632	TCA	2	6	4648293	4648298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598866
85526	NC_018632	ATA	2	6	4648311	4648316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598866
85527	NC_018632	TTC	2	6	4648334	4648339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598866
85528	NC_018632	AAC	2	6	4648341	4648346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598866
85529	NC_018632	TTG	2	6	4648350	4648355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598866
85530	NC_018632	GAA	2	6	4648432	4648437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598866
85531	NC_018632	GGGCA	2	10	4648481	4648490	20 %	0 %	60 %	20 %	406598866
85532	NC_018632	GCT	2	6	4648510	4648515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598866
85533	NC_018632	GAC	2	6	4648534	4648539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598866
85534	NC_018632	AAT	2	6	4648584	4648589	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598866
85535	NC_018632	CGA	2	6	4648610	4648615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598866
85536	NC_018632	CGC	2	6	4648694	4648699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406598866
85537	NC_018632	CGG	2	6	4648792	4648797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406598867
85538	NC_018632	TGT	2	6	4648996	4649001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598867
85539	NC_018632	AC	3	6	4649033	4649038	50 %	0 %	0 %	50 %	406598867
85540	NC_018632	CGA	2	6	4649167	4649172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598867
85541	NC_018632	TGCT	2	8	4649184	4649191	0 %	50 %	25 %	25 %	406598867
85542	NC_018632	GTC	2	6	4649222	4649227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85543	NC_018632	CTT	2	6	4649264	4649269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85544	NC_018632	A	6	6	4649308	4649313	100 %	0 %	0 %	0 %	406598868
85545	NC_018632	TTC	2	6	4649384	4649389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598868
85546	NC_018632	AGCA	2	8	4649390	4649397	50 %	0 %	25 %	25 %	406598868
85547	NC_018632	CAT	2	6	4649413	4649418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598868
85548	NC_018632	GTT	3	9	4649422	4649430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598868
85549	NC_018632	GTC	2	6	4649476	4649481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598868
85550	NC_018632	GC	3	6	4649483	4649488	0 %	0 %	50 %	50 %	406598868
85551	NC_018632	GTA	2	6	4649508	4649513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598868
85552	NC_018632	CGC	2	6	4649557	4649562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406598868
85553	NC_018632	CTT	2	6	4649566	4649571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598868
85554	NC_018632	TTG	2	6	4649655	4649660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598868
85555	NC_018632	CAG	2	6	4649734	4649739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598868
85556	NC_018632	AAT	2	6	4649760	4649765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598868
85557	NC_018632	CG	3	6	4649795	4649800	0 %	0 %	50 %	50 %	406598868
85558	NC_018632	CTG	2	6	4649845	4649850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598868
85559	NC_018632	TAA	2	6	4649963	4649968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598868
85560	NC_018632	CAC	2	6	4650002	4650007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406598868
85561	NC_018632	CAA	2	6	4650023	4650028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598868
85562	NC_018632	TCT	2	6	4650123	4650128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598868
85563	NC_018632	GCC	2	6	4650144	4650149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406598868
85564	NC_018632	AGCG	2	8	4650219	4650226	25 %	0 %	50 %	25 %	406598868
85565	NC_018632	TGC	2	6	4650239	4650244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598868
85566	NC_018632	ATCA	2	8	4650260	4650267	50 %	25 %	0 %	25 %	406598868
85567	NC_018632	ATCA	2	8	4650377	4650384	50 %	25 %	0 %	25 %	406598868
85568	NC_018632	A	6	6	4650461	4650466	100 %	0 %	0 %	0 %	406598868
85569	NC_018632	TGT	2	6	4650493	4650498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598868
85570	NC_018632	CAA	2	6	4650505	4650510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406598868
85571	NC_018632	GTG	2	6	4650532	4650537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598868
85572	NC_018632	CGC	2	6	4650607	4650612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406598868
85573	NC_018632	TGC	2	6	4650743	4650748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598869
85574	NC_018632	ATC	2	6	4650751	4650756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598869
85575	NC_018632	TTC	2	6	4650781	4650786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598869
85576	NC_018632	TCT	2	6	4650840	4650845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598869
85577	NC_018632	GCT	2	6	4650855	4650860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598869
85578	NC_018632	CTT	2	6	4650867	4650872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598869
85579	NC_018632	ACGTT	2	10	4650944	4650953	20 %	40 %	20 %	20 %	406598869
85580	NC_018632	TTCAGC	2	12	4651000	4651011	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	406598869
85581	NC_018632	T	6	6	4651026	4651031	0 %	100 %	0 %	0 %	406598869
85582	NC_018632	CTT	2	6	4651116	4651121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598869
85583	NC_018632	ATG	2	6	4651149	4651154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406598869
85584	NC_018632	CTG	2	6	4651230	4651235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598870
85585	NC_018632	GAA	2	6	4651337	4651342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598870
85586	NC_018632	CTG	2	6	4651379	4651384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598870
85587	NC_018632	TGG	2	6	4651399	4651404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406598870
85588	NC_018632	GCA	2	6	4651453	4651458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598870
85589	NC_018632	AGA	3	9	4651572	4651580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598870
85590	NC_018632	CAT	2	6	4651628	4651633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598870
85591	NC_018632	T	6	6	4651645	4651650	0 %	100 %	0 %	0 %	406598870
85592	NC_018632	GTC	2	6	4651655	4651660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598870
85593	NC_018632	GCT	2	6	4651678	4651683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598870
85594	NC_018632	CTT	2	6	4651730	4651735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598870
85595	NC_018632	TTA	2	6	4651797	4651802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598870
85596	NC_018632	GAAG	2	8	4651813	4651820	50 %	0 %	50 %	0 %	406598870
85597	NC_018632	AAG	2	6	4651823	4651828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406598870
85598	NC_018632	CG	3	6	4651888	4651893	0 %	0 %	50 %	50 %	406598870
85599	NC_018632	ATA	2	6	4651987	4651992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598870
85600	NC_018632	CCAAC	2	10	4652094	4652103	40 %	0 %	0 %	60 %	406598870
85601	NC_018632	TCG	2	6	4652142	4652147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598870
85602	NC_018632	GCA	2	6	4652187	4652192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598870
85603	NC_018632	CGT	2	6	4652221	4652226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598870
85604	NC_018632	TGC	2	6	4652273	4652278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598870
85605	NC_018632	TTACGT	2	12	4652308	4652319	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406598870
85606	NC_018632	AGTGAA	2	12	4652333	4652344	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	406598870
85607	NC_018632	GTT	2	6	4652369	4652374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598870
85608	NC_018632	ATA	2	6	4652417	4652422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598870
85609	NC_018632	CTG	2	6	4652454	4652459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598870
85610	NC_018632	TAAG	2	8	4652569	4652576	50 %	25 %	25 %	0 %	406598870
85611	NC_018632	CTG	2	6	4652578	4652583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598870
85612	NC_018632	CGC	2	6	4652593	4652598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406598870
85613	NC_018632	AAT	2	6	4652642	4652647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598870
85614	NC_018632	GCA	2	6	4652682	4652687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406598870
85615	NC_018632	ACT	2	6	4652699	4652704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406598870
85616	NC_018632	TGT	2	6	4652766	4652771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598870
85617	NC_018632	TTG	2	6	4652910	4652915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406598871
85618	NC_018632	CCG	2	6	4652938	4652943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406598871
85619	NC_018632	AACC	2	8	4652983	4652990	50 %	0 %	0 %	50 %	406598871
85620	NC_018632	CAAGAA	2	12	4653034	4653045	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	406598871
85621	NC_018632	T	6	6	4653152	4653157	0 %	100 %	0 %	0 %	406598872
85622	NC_018632	CTT	2	6	4653184	4653189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406598872
85623	NC_018632	ATA	2	6	4653228	4653233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406598872
85624	NC_018632	T	6	6	4653323	4653328	0 %	100 %	0 %	0 %	406598872
85625	NC_018632	GAG	2	6	4653349	4653354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406598872
85626	NC_018632	T	6	6	4653366	4653371	0 %	100 %	0 %	0 %	406598872
85627	NC_018632	GTGG	2	8	4653434	4653441	0 %	25 %	75 %	0 %	406598872
85628	NC_018632	ATT	2	6	4653470	4653475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406598872
85629	NC_018632	GCT	2	6	4653537	4653542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406598873

< Previous12...160161162163164165166167168169170171172Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.