MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44502	NC_017167	CGA	3	9	2043456	2043464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135863
44503	NC_017167	ACA	2	6	2043486	2043491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384135863
44504	NC_017167	GTC	2	6	2043537	2043542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135863
44505	NC_017167	AAC	2	6	2043620	2043625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44506	NC_017167	GTA	2	6	2043628	2043633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44507	NC_017167	CTT	2	6	2043662	2043667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44508	NC_017167	AGC	2	6	2043681	2043686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44509	NC_017167	CTT	2	6	2043692	2043697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44510	NC_017167	GAC	2	6	2043703	2043708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44511	NC_017167	ACA	2	6	2043767	2043772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44512	NC_017167	TGA	2	6	2043808	2043813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44513	NC_017167	GTC	2	6	2043819	2043824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135864
44514	NC_017167	ACC	2	6	2043834	2043839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384135864
44515	NC_017167	GTTG	2	8	2043942	2043949	0 %	50 %	50 %	0 %	384135864
44516	NC_017167	CCA	2	6	2043967	2043972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384135864
44517	NC_017167	GCA	2	6	2043983	2043988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135864
44518	NC_017167	GCA	2	6	2044016	2044021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44519	NC_017167	GAA	2	6	2044051	2044056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44520	NC_017167	GAG	2	6	2044097	2044102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44521	NC_017167	ACA	2	6	2044157	2044162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44522	NC_017167	CGA	2	6	2044227	2044232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135865
44523	NC_017167	ATTG	2	8	2044251	2044258	25 %	50 %	25 %	0 %	384135865
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44525	NC_017167	CAT	2	6	2044283	2044288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135865
44526	NC_017167	CGC	2	6	2044292	2044297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135865
44527	NC_017167	GCG	2	6	2044324	2044329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135865
44528	NC_017167	CGTT	2	8	2044409	2044416	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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44531	NC_017167	CGC	2	6	2044553	2044558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135866
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44533	NC_017167	GACGT	2	10	2044603	2044612	20 %	20 %	40 %	20 %	384135866
44534	NC_017167	TCT	2	6	2044632	2044637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384135866
44535	NC_017167	GAT	2	6	2044651	2044656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135866
44536	NC_017167	TCCGTC	2	12	2044658	2044669	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384135866
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44540	NC_017167	CGCGT	2	10	2044925	2044934	0 %	20 %	40 %	40 %	384135866
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44544	NC_017167	CCG	2	6	2045109	2045114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135866
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44546	NC_017167	GCC	2	6	2045180	2045185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135866
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44552	NC_017167	CAC	2	6	2045485	2045490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384135866
44553	NC_017167	CGC	2	6	2045506	2045511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135866
44554	NC_017167	ATG	2	6	2045567	2045572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135866
44555	NC_017167	CA	4	8	2045634	2045641	50 %	0 %	0 %	50 %	384135866
44556	NC_017167	GTC	2	6	2045653	2045658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135866
44557	NC_017167	CG	3	6	2045697	2045702	0 %	0 %	50 %	50 %	384135866
44558	NC_017167	TCG	2	6	2045780	2045785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135866
44559	NC_017167	TCGCC	2	10	2045945	2045954	0 %	20 %	20 %	60 %	384135866
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44565	NC_017167	CG	3	6	2046223	2046228	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44566	NC_017167	CTCG	2	8	2046309	2046316	0 %	25 %	25 %	50 %	384135867
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44601	NC_017167	TCG	2	6	2047546	2047551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135867
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44612	NC_017167	ATCCG	2	10	2048077	2048086	20 %	20 %	20 %	40 %	384135868
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44969	NC_017167	CGC	2	6	2064119	2064124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135882
44970	NC_017167	GTC	2	6	2064126	2064131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135882
44971	NC_017167	GC	3	6	2064158	2064163	0 %	0 %	50 %	50 %	384135882
44972	NC_017167	AGC	2	6	2064166	2064171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135882
44973	NC_017167	CCGG	2	8	2064197	2064204	0 %	0 %	50 %	50 %	384135882
44974	NC_017167	CGT	2	6	2064227	2064232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135882
44975	NC_017167	CA	3	6	2064244	2064249	50 %	0 %	0 %	50 %	384135882
44976	NC_017167	CCG	2	6	2064263	2064268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135882
44977	NC_017167	C	7	7	2064272	2064278	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44978	NC_017167	CGG	2	6	2064346	2064351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135883
44979	NC_017167	CCA	2	6	2064392	2064397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384135883
44980	NC_017167	ATGTCG	2	12	2064421	2064432	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384135883
44981	NC_017167	CTC	2	6	2064441	2064446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135883
44982	NC_017167	CTC	2	6	2064480	2064485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135883
44983	NC_017167	TTG	2	6	2064499	2064504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384135883
44984	NC_017167	GCC	2	6	2064523	2064528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135883
44985	NC_017167	ATG	2	6	2064700	2064705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135883
44986	NC_017167	AGG	2	6	2064760	2064765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384135883
44987	NC_017167	CGC	2	6	2064801	2064806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135883
44988	NC_017167	CGA	2	6	2064821	2064826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135883
44989	NC_017167	CG	3	6	2064845	2064850	0 %	0 %	50 %	50 %	384135883
44990	NC_017167	GAT	2	6	2064861	2064866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135883
44991	NC_017167	GC	3	6	2064888	2064893	0 %	0 %	50 %	50 %	384135883
44992	NC_017167	TGA	2	6	2064902	2064907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135883
44993	NC_017167	TCG	2	6	2064949	2064954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135883
44994	NC_017167	TTC	2	6	2065000	2065005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384135883
44995	NC_017167	CG	3	6	2065046	2065051	0 %	0 %	50 %	50 %	384135883
44996	NC_017167	GCTCG	2	10	2065125	2065134	0 %	20 %	40 %	40 %	384135883
44997	NC_017167	GTGCA	2	10	2065168	2065177	20 %	20 %	40 %	20 %	384135883
44998	NC_017167	GC	4	8	2065179	2065186	0 %	0 %	50 %	50 %	384135883
44999	NC_017167	GCG	2	6	2065238	2065243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135883
45000	NC_017167	ATG	2	6	2065276	2065281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135883

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