MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_017167	GC	3	6	2021371	2021376	0 %	0 %	50 %	50 %	384135837
44003	NC_017167	ATG	2	6	2021403	2021408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135837
44004	NC_017167	GGT	2	6	2021416	2021421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384135837
44005	NC_017167	TC	3	6	2021460	2021465	0 %	50 %	0 %	50 %	384135837
44006	NC_017167	CGG	2	6	2021471	2021476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135837
44007	NC_017167	GCC	2	6	2021494	2021499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135837
44008	NC_017167	ACG	2	6	2021520	2021525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135837
44009	NC_017167	GCG	2	6	2021544	2021549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135837
44010	NC_017167	GCCAA	2	10	2021578	2021587	40 %	0 %	20 %	40 %	384135837
44011	NC_017167	CGG	3	9	2021617	2021625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135837
44012	NC_017167	GC	3	6	2021634	2021639	0 %	0 %	50 %	50 %	384135837
44013	NC_017167	GAT	2	6	2021681	2021686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135837
44014	NC_017167	GGC	2	6	2021724	2021729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135838
44015	NC_017167	T	6	6	2021790	2021795	0 %	100 %	0 %	0 %	384135838
44016	NC_017167	AGC	2	6	2021869	2021874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135838
44017	NC_017167	CG	3	6	2021875	2021880	0 %	0 %	50 %	50 %	384135838
44018	NC_017167	TCT	2	6	2021940	2021945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384135838
44019	NC_017167	GC	3	6	2021972	2021977	0 %	0 %	50 %	50 %	384135838
44020	NC_017167	TCGCG	2	10	2022006	2022015	0 %	20 %	40 %	40 %	384135838
44021	NC_017167	GAG	2	6	2022020	2022025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384135838
44022	NC_017167	CTGA	2	8	2022063	2022070	25 %	25 %	25 %	25 %	384135838
44023	NC_017167	TTC	2	6	2022124	2022129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384135838
44024	NC_017167	CGC	2	6	2022193	2022198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135838
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44026	NC_017167	CGC	2	6	2022373	2022378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135838
44027	NC_017167	GGCCA	2	10	2022415	2022424	20 %	0 %	40 %	40 %	384135838
44028	NC_017167	AGC	2	6	2022428	2022433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135838
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44031	NC_017167	TCCC	2	8	2022673	2022680	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
44032	NC_017167	GCG	2	6	2022716	2022721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44033	NC_017167	TTTC	2	8	2022746	2022753	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44034	NC_017167	GC	3	6	2022941	2022946	0 %	0 %	50 %	50 %	384135839
44035	NC_017167	TGC	2	6	2022999	2023004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135839
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44039	NC_017167	GTT	2	6	2023225	2023230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384135839
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44041	NC_017167	GCGG	2	8	2023315	2023322	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44042	NC_017167	CCG	2	6	2023330	2023335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135840
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44055	NC_017167	CCAA	2	8	2023800	2023807	50 %	0 %	0 %	50 %	384135840
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44070	NC_017167	CCTC	2	8	2024413	2024420	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
44071	NC_017167	CAA	2	6	2024459	2024464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384135842
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44073	NC_017167	GC	3	6	2024578	2024583	0 %	0 %	50 %	50 %	384135842
44074	NC_017167	CG	3	6	2024608	2024613	0 %	0 %	50 %	50 %	384135842
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44092	NC_017167	GC	4	8	2025354	2025361	0 %	0 %	50 %	50 %	384135843
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44108	NC_017167	CGCGA	2	10	2026050	2026059	20 %	0 %	40 %	40 %	384135844
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44237	NC_017167	GCT	2	6	2031689	2031694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135850
44238	NC_017167	CGC	2	6	2031741	2031746	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135850
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44241	NC_017167	CG	3	6	2032071	2032076	0 %	0 %	50 %	50 %	384135850
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44263	NC_017167	CTCG	2	8	2032906	2032913	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
44264	NC_017167	GC	4	8	2032962	2032969	0 %	0 %	50 %	50 %	384135853
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44354	NC_017167	ATG	2	6	2036830	2036835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135854
44355	NC_017167	CGA	2	6	2036909	2036914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135854
44356	NC_017167	GATA	2	8	2036915	2036922	50 %	25 %	25 %	0 %	384135854
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