MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40004	NC_017167	GCC	2	6	1838920	1838925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135652
40005	NC_017167	CG	3	6	1838929	1838934	0 %	0 %	50 %	50 %	384135652
40006	NC_017167	C	6	6	1838960	1838965	0 %	0 %	0 %	100 %	384135652
40007	NC_017167	GCTT	2	8	1838993	1839000	0 %	50 %	25 %	25 %	384135652
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40009	NC_017167	GC	3	6	1839034	1839039	0 %	0 %	50 %	50 %	384135653
40010	NC_017167	CAGC	2	8	1839049	1839056	25 %	0 %	25 %	50 %	384135653
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40015	NC_017167	GCC	3	9	1839164	1839172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135653
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40053	NC_017167	CG	3	6	1840674	1840679	0 %	0 %	50 %	50 %	384135654
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40110	NC_017167	CG	3	6	1843167	1843172	0 %	0 %	50 %	50 %	384135657
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40118	NC_017167	GCG	2	6	1843353	1843358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135657
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40232	NC_017167	GC	3	6	1848517	1848522	0 %	0 %	50 %	50 %	384135660
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40235	NC_017167	TGC	2	6	1848589	1848594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135660
40236	NC_017167	GC	4	8	1848600	1848607	0 %	0 %	50 %	50 %	384135660
40237	NC_017167	CGT	2	6	1848612	1848617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135660
40238	NC_017167	GAT	2	6	1848625	1848630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135660
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40244	NC_017167	CCG	2	6	1848930	1848935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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40340	NC_017167	GGAC	2	8	1853475	1853482	25 %	0 %	50 %	25 %	384135665
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40345	NC_017167	CGA	2	6	1853657	1853662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135665
40346	NC_017167	TCGC	2	8	1853755	1853762	0 %	25 %	25 %	50 %	384135665
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40348	NC_017167	AGC	2	6	1853872	1853877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135665
40349	NC_017167	GCG	2	6	1854003	1854008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135665
40350	NC_017167	C	6	6	1854033	1854038	0 %	0 %	0 %	100 %	384135665
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40471	NC_017167	CGA	2	6	1860057	1860062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135672
40472	NC_017167	CGGC	2	8	1860075	1860082	0 %	0 %	50 %	50 %	384135672
40473	NC_017167	TCCC	2	8	1860128	1860135	0 %	25 %	0 %	75 %	384135672
40474	NC_017167	CTC	2	6	1860232	1860237	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40475	NC_017167	ACGG	2	8	1860282	1860289	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40476	NC_017167	GC	3	6	1860358	1860363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40477	NC_017167	GGAGAT	2	12	1860381	1860392	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
40478	NC_017167	GGA	2	6	1860405	1860410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40479	NC_017167	GCC	2	6	1860442	1860447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135673
40480	NC_017167	CGG	2	6	1860461	1860466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135673
40481	NC_017167	GC	3	6	1860555	1860560	0 %	0 %	50 %	50 %	384135673
40482	NC_017167	AAGCC	2	10	1860592	1860601	40 %	0 %	20 %	40 %	384135673
40483	NC_017167	CTG	2	6	1860618	1860623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135673
40484	NC_017167	GGA	2	6	1860651	1860656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384135673
40485	NC_017167	GTC	2	6	1860671	1860676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135673
40486	NC_017167	TCG	2	6	1860796	1860801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135673
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40489	NC_017167	TCG	2	6	1861015	1861020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135673
40490	NC_017167	CGC	2	6	1861037	1861042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135673
40491	NC_017167	CGA	2	6	1861046	1861051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135673
40492	NC_017167	GCG	2	6	1861079	1861084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135673
40493	NC_017167	CG	3	6	1861089	1861094	0 %	0 %	50 %	50 %	384135673
40494	NC_017167	CGG	2	6	1861242	1861247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135673
40495	NC_017167	GATC	2	8	1861262	1861269	25 %	25 %	25 %	25 %	384135673
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40497	NC_017167	GGC	2	6	1861545	1861550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135674
40498	NC_017167	CGA	2	6	1861602	1861607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135674
40499	NC_017167	GCTG	2	8	1861616	1861623	0 %	25 %	50 %	25 %	384135674
40500	NC_017167	GGA	2	6	1861674	1861679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384135674

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