MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37502	NC_017167	CCG	2	6	1709600	1709605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37503	NC_017167	TCG	2	6	1709614	1709619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37504	NC_017167	C	7	7	1709633	1709639	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37505	NC_017167	TCG	2	6	1709684	1709689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37506	NC_017167	CGC	2	6	1709715	1709720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37507	NC_017167	CGC	2	6	1709751	1709756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37508	NC_017167	GAA	2	6	1709804	1709809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37509	NC_017167	TGT	2	6	1709906	1709911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37510	NC_017167	CGCC	2	8	1709942	1709949	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37511	NC_017167	AAC	2	6	1709950	1709955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37512	NC_017167	CAA	2	6	1710018	1710023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37513	NC_017167	GGCACC	2	12	1710069	1710080	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37514	NC_017167	CAA	2	6	1710102	1710107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37515	NC_017167	CGT	3	9	1710119	1710127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37516	NC_017167	GTA	2	6	1710138	1710143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37517	NC_017167	GTC	2	6	1710253	1710258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37518	NC_017167	GTGCCG	2	12	1710277	1710288	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
37519	NC_017167	TTG	2	6	1710292	1710297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37520	NC_017167	TGCCG	2	10	1710309	1710318	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
37521	NC_017167	ATG	3	9	1710319	1710327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37522	NC_017167	TCGC	2	8	1710412	1710419	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37523	NC_017167	CGA	2	6	1710512	1710517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37524	NC_017167	TGT	2	6	1710551	1710556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37525	NC_017167	GTT	3	9	1710600	1710608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37526	NC_017167	CTGG	2	8	1710635	1710642	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37527	NC_017167	CTG	2	6	1710662	1710667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37528	NC_017167	GGTG	2	8	1710747	1710754	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
37529	NC_017167	GTT	2	6	1710852	1710857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37530	NC_017167	CGT	2	6	1710941	1710946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37531	NC_017167	TAG	2	6	1710949	1710954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37532	NC_017167	CGTG	2	8	1711013	1711020	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37533	NC_017167	GCC	2	6	1711045	1711050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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37538	NC_017167	A	7	7	1711256	1711262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37539	NC_017167	TCG	2	6	1711279	1711284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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37553	NC_017167	CCGCC	2	10	1712422	1712431	0 %	0 %	20 %	80 %	384135501
37554	NC_017167	CA	3	6	1712461	1712466	50 %	0 %	0 %	50 %	384135501
37555	NC_017167	GC	3	6	1712482	1712487	0 %	0 %	50 %	50 %	384135501
37556	NC_017167	CCT	3	9	1712525	1712533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37557	NC_017167	GAAA	2	8	1712615	1712622	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37558	NC_017167	TCG	2	6	1712666	1712671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135502
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37562	NC_017167	TTCG	2	8	1712795	1712802	0 %	50 %	25 %	25 %	384135502
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37569	NC_017167	TGA	2	6	1713163	1713168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135502
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37573	NC_017167	ACA	2	6	1713431	1713436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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37588	NC_017167	A	7	7	1713912	1713918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37589	NC_017167	AAGAA	2	10	1713931	1713940	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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37595	NC_017167	CA	4	8	1714301	1714308	50 %	0 %	0 %	50 %	384135503
37596	NC_017167	A	6	6	1714382	1714387	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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37607	NC_017167	CGCTGC	2	12	1714919	1714930	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384135504
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37612	NC_017167	G	6	6	1715057	1715062	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
37613	NC_017167	TTC	2	6	1715076	1715081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384135505
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37618	NC_017167	GC	3	6	1715302	1715307	0 %	0 %	50 %	50 %	384135505
37619	NC_017167	TTC	2	6	1715326	1715331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384135505
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