MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37002	NC_017167	CTTG	2	8	1682606	1682613	0 %	50 %	25 %	25 %	384135476
37003	NC_017167	CAT	2	6	1682619	1682624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135476
37004	NC_017167	TCCG	2	8	1682644	1682651	0 %	25 %	25 %	50 %	384135476
37005	NC_017167	CCG	2	6	1682697	1682702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135476
37006	NC_017167	CCCG	2	8	1682716	1682723	0 %	0 %	25 %	75 %	384135476
37007	NC_017167	CAA	2	6	1682736	1682741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384135476
37008	NC_017167	CAA	2	6	1682752	1682757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384135476
37009	NC_017167	CAG	2	6	1682773	1682778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135476
37010	NC_017167	GGC	2	6	1682808	1682813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135476
37011	NC_017167	CTCCC	2	10	1682871	1682880	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
37012	NC_017167	CAT	2	6	1682946	1682951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135477
37013	NC_017167	GAAC	2	8	1682955	1682962	50 %	0 %	25 %	25 %	384135477
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37015	NC_017167	CGC	2	6	1683151	1683156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135477
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37018	NC_017167	ATCC	2	8	1683342	1683349	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37019	NC_017167	GC	3	6	1683367	1683372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37020	NC_017167	AGA	2	6	1683373	1683378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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37022	NC_017167	GCGT	2	8	1683404	1683411	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37023	NC_017167	TG	3	6	1683415	1683420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37024	NC_017167	C	6	6	1683437	1683442	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37025	NC_017167	CAA	2	6	1683480	1683485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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37037	NC_017167	GGCA	2	8	1684148	1684155	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37038	NC_017167	CGAT	2	8	1684162	1684169	25 %	25 %	25 %	25 %	384135479
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37046	NC_017167	TGA	2	6	1684604	1684609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135479
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37052	NC_017167	TCCCG	2	10	1685061	1685070	0 %	20 %	20 %	60 %	384135480
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37060	NC_017167	GATC	2	8	1685371	1685378	25 %	25 %	25 %	25 %	384135481
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37064	NC_017167	GTAT	2	8	1685694	1685701	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37065	NC_017167	CT	3	6	1685716	1685721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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37088	NC_017167	ACC	2	6	1686845	1686850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37089	NC_017167	CA	3	6	1686946	1686951	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37090	NC_017167	CGA	2	6	1687028	1687033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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37103	NC_017167	CTCTT	2	10	1687979	1687988	0 %	60 %	0 %	40 %	384135483
37104	NC_017167	TCTG	2	8	1688007	1688014	0 %	50 %	25 %	25 %	384135483
37105	NC_017167	CGA	2	6	1688069	1688074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135483
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37110	NC_017167	ATT	2	6	1688470	1688475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384135484
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37116	NC_017167	CGCTC	2	10	1688581	1688590	0 %	20 %	20 %	60 %	384135484
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37473	NC_017167	CCT	2	6	1707965	1707970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37474	NC_017167	CCTC	2	8	1708134	1708141	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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37476	NC_017167	A	7	7	1708179	1708185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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37479	NC_017167	GGC	2	6	1708207	1708212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37480	NC_017167	TGT	2	6	1708229	1708234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37481	NC_017167	CGT	2	6	1708245	1708250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37482	NC_017167	GAT	2	6	1708362	1708367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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