MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35501	NC_017167	TGCG	2	8	1609627	1609634	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
35502	NC_017167	AGC	2	6	1609711	1609716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135384
35503	NC_017167	GCA	2	6	1609740	1609745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135384
35504	NC_017167	CTT	2	6	1609773	1609778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384135384
35505	NC_017167	CGTT	2	8	1609893	1609900	0 %	50 %	25 %	25 %	384135384
35506	NC_017167	GC	3	6	1609928	1609933	0 %	0 %	50 %	50 %	384135384
35507	NC_017167	TCC	2	6	1609976	1609981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135384
35508	NC_017167	CGG	2	6	1610000	1610005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135385
35509	NC_017167	AAC	2	6	1610006	1610011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384135385
35510	NC_017167	GCC	2	6	1610025	1610030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135385
35511	NC_017167	CGC	2	6	1610041	1610046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135385
35512	NC_017167	TGA	2	6	1610187	1610192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135385
35513	NC_017167	CCA	2	6	1610212	1610217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384135385
35514	NC_017167	GC	4	8	1610277	1610284	0 %	0 %	50 %	50 %	384135385
35515	NC_017167	TACC	2	8	1610311	1610318	25 %	25 %	0 %	50 %	384135385
35516	NC_017167	GCCA	2	8	1610331	1610338	25 %	0 %	25 %	50 %	384135385
35517	NC_017167	CAAGC	2	10	1610347	1610356	40 %	0 %	20 %	40 %	384135385
35518	NC_017167	CCA	2	6	1610493	1610498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384135385
35519	NC_017167	CTT	2	6	1610548	1610553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384135385
35520	NC_017167	GC	3	6	1610564	1610569	0 %	0 %	50 %	50 %	384135385
35521	NC_017167	CGC	2	6	1610577	1610582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135385
35522	NC_017167	AGCG	2	8	1610594	1610601	25 %	0 %	50 %	25 %	384135385
35523	NC_017167	CCT	2	6	1610658	1610663	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35524	NC_017167	CTCG	2	8	1610721	1610728	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35525	NC_017167	CCT	2	6	1610745	1610750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135386
35526	NC_017167	GGC	2	6	1610821	1610826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135386
35527	NC_017167	CAG	2	6	1610878	1610883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135386
35528	NC_017167	GTC	3	9	1611004	1611012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135386
35529	NC_017167	ATA	2	6	1611121	1611126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384135386
35530	NC_017167	TCA	2	6	1611156	1611161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135386
35531	NC_017167	CG	3	6	1611166	1611171	0 %	0 %	50 %	50 %	384135386
35532	NC_017167	GAC	2	6	1611180	1611185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135386
35533	NC_017167	CG	4	8	1611243	1611250	0 %	0 %	50 %	50 %	384135386
35534	NC_017167	GGAA	2	8	1611253	1611260	50 %	0 %	50 %	0 %	384135386
35535	NC_017167	CCG	2	6	1611333	1611338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135386
35536	NC_017167	CGA	2	6	1611360	1611365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135386
35537	NC_017167	ATG	2	6	1611377	1611382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135386
35538	NC_017167	CGCGA	2	10	1611385	1611394	20 %	0 %	40 %	40 %	384135386
35539	NC_017167	CCG	2	6	1611396	1611401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135386
35540	NC_017167	GAG	2	6	1611409	1611414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384135386
35541	NC_017167	GTG	2	6	1611436	1611441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384135386
35542	NC_017167	CG	3	6	1611500	1611505	0 %	0 %	50 %	50 %	384135386
35543	NC_017167	GCC	2	6	1611563	1611568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135386
35544	NC_017167	GCG	2	6	1611602	1611607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135386
35545	NC_017167	CCG	2	6	1611677	1611682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135386
35546	NC_017167	CCGGA	2	10	1611685	1611694	20 %	0 %	40 %	40 %	384135386
35547	NC_017167	CG	3	6	1611706	1611711	0 %	0 %	50 %	50 %	384135386
35548	NC_017167	ACG	2	6	1611767	1611772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135386
35549	NC_017167	GCC	2	6	1611809	1611814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135386
35550	NC_017167	GGCC	2	8	1611848	1611855	0 %	0 %	50 %	50 %	384135386
35551	NC_017167	GCCA	2	8	1611910	1611917	25 %	0 %	25 %	50 %	384135386
35552	NC_017167	CGC	2	6	1611960	1611965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135387
35553	NC_017167	TCG	2	6	1611982	1611987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135387
35554	NC_017167	CG	3	6	1611986	1611991	0 %	0 %	50 %	50 %	384135387
35555	NC_017167	CGA	2	6	1612007	1612012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135387
35556	NC_017167	CGT	2	6	1612049	1612054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135387
35557	NC_017167	GTA	2	6	1612059	1612064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135387
35558	NC_017167	GCC	2	6	1612171	1612176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135387
35559	NC_017167	CTC	2	6	1612185	1612190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135387
35560	NC_017167	CGG	2	6	1612208	1612213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135387
35561	NC_017167	ACC	2	6	1612264	1612269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384135387
35562	NC_017167	CACGGC	2	12	1612293	1612304	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384135387
35563	NC_017167	CAC	2	6	1612317	1612322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384135387
35564	NC_017167	CG	3	6	1612325	1612330	0 %	0 %	50 %	50 %	384135387
35565	NC_017167	CGC	2	6	1612366	1612371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135387
35566	NC_017167	CCGG	2	8	1612383	1612390	0 %	0 %	50 %	50 %	384135387
35567	NC_017167	GCAT	2	8	1612424	1612431	25 %	25 %	25 %	25 %	384135387
35568	NC_017167	TCCC	2	8	1612433	1612440	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
35569	NC_017167	GCC	2	6	1612463	1612468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135388
35570	NC_017167	CAG	2	6	1612471	1612476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135388
35571	NC_017167	GC	3	6	1612529	1612534	0 %	0 %	50 %	50 %	384135388
35572	NC_017167	CCTC	2	8	1612632	1612639	0 %	25 %	0 %	75 %	384135388
35573	NC_017167	CGT	2	6	1612656	1612661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135388
35574	NC_017167	CGT	2	6	1612683	1612688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135388
35575	NC_017167	AGG	2	6	1612700	1612705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384135388
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35577	NC_017167	GAAA	2	8	1612841	1612848	75 %	0 %	25 %	0 %	384135388
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35579	NC_017167	CG	4	8	1612935	1612942	0 %	0 %	50 %	50 %	384135388
35580	NC_017167	TAGCC	2	10	1612946	1612955	20 %	20 %	20 %	40 %	384135388
35581	NC_017167	GC	3	6	1612960	1612965	0 %	0 %	50 %	50 %	384135388
35582	NC_017167	GC	4	8	1613022	1613029	0 %	0 %	50 %	50 %	384135388
35583	NC_017167	CG	4	8	1613030	1613037	0 %	0 %	50 %	50 %	384135388
35584	NC_017167	GGA	2	6	1613038	1613043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384135388
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35586	NC_017167	CTC	2	6	1613080	1613085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135388
35587	NC_017167	ACCG	2	8	1613086	1613093	25 %	0 %	25 %	50 %	384135388
35588	NC_017167	GCC	2	6	1613118	1613123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135388
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35590	NC_017167	CGT	2	6	1613199	1613204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135388
35591	NC_017167	ATCC	2	8	1613216	1613223	25 %	25 %	0 %	50 %	384135388
35592	NC_017167	CGC	3	9	1613231	1613239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135388
35593	NC_017167	GC	3	6	1613274	1613279	0 %	0 %	50 %	50 %	384135388
35594	NC_017167	TCC	2	6	1613387	1613392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135388
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35596	NC_017167	GC	3	6	1613410	1613415	0 %	0 %	50 %	50 %	384135388
35597	NC_017167	CG	3	6	1613416	1613421	0 %	0 %	50 %	50 %	384135388
35598	NC_017167	C	6	6	1613429	1613434	0 %	0 %	0 %	100 %	384135388
35599	NC_017167	TCG	2	6	1613486	1613491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135388
35600	NC_017167	TCA	2	6	1613528	1613533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135389
35601	NC_017167	CACC	2	8	1613753	1613760	25 %	0 %	0 %	75 %	384135389
35602	NC_017167	ATC	2	6	1613772	1613777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135389
35603	NC_017167	CCCA	2	8	1613779	1613786	25 %	0 %	0 %	75 %	384135389
35604	NC_017167	CA	3	6	1613785	1613790	50 %	0 %	0 %	50 %	384135389
35605	NC_017167	ATC	2	6	1613799	1613804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135389
35606	NC_017167	GC	3	6	1613837	1613842	0 %	0 %	50 %	50 %	384135389
35607	NC_017167	GAC	2	6	1613847	1613852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135389
35608	NC_017167	CGC	3	9	1613954	1613962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135389
35609	NC_017167	AGG	2	6	1614013	1614018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384135389
35610	NC_017167	CGT	2	6	1614143	1614148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135389
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35612	NC_017167	ACTC	2	8	1614198	1614205	25 %	25 %	0 %	50 %	384135390
35613	NC_017167	GGTG	2	8	1614341	1614348	0 %	25 %	75 %	0 %	384135390
35614	NC_017167	CAC	2	6	1614359	1614364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384135390
35615	NC_017167	GTCGAC	2	12	1614413	1614424	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384135390
35616	NC_017167	ATG	2	6	1614483	1614488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135390
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35999	NC_017167	TCCA	2	8	1633077	1633084	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36000	NC_017167	TCCGC	2	10	1633107	1633116	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding

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