MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35003	NC_017167	CGAA	2	8	1585527	1585534	50 %	0 %	25 %	25 %	384135350
35004	NC_017167	GC	3	6	1585603	1585608	0 %	0 %	50 %	50 %	384135351
35005	NC_017167	GCCC	2	8	1585634	1585641	0 %	0 %	25 %	75 %	384135351
35006	NC_017167	AC	3	6	1585812	1585817	50 %	0 %	0 %	50 %	384135351
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35009	NC_017167	CCA	2	6	1585860	1585865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384135351
35010	NC_017167	CTT	2	6	1585911	1585916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384135351
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35013	NC_017167	CCG	2	6	1586169	1586174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35014	NC_017167	CCA	2	6	1586194	1586199	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35015	NC_017167	TCC	2	6	1586215	1586220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35016	NC_017167	AGT	2	6	1586262	1586267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35017	NC_017167	CG	3	6	1586297	1586302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35018	NC_017167	GAG	2	6	1586358	1586363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35019	NC_017167	AGG	2	6	1586364	1586369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35020	NC_017167	AGC	2	6	1586415	1586420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135352
35021	NC_017167	AG	3	6	1586551	1586556	50 %	0 %	50 %	0 %	384135352
35022	NC_017167	TCG	3	9	1586562	1586570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135352
35023	NC_017167	CAT	2	6	1586576	1586581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135352
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35030	NC_017167	CCA	2	6	1587050	1587055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384135353
35031	NC_017167	CGA	2	6	1587161	1587166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135353
35032	NC_017167	A	6	6	1587333	1587338	100 %	0 %	0 %	0 %	384135353
35033	NC_017167	CGA	2	6	1587380	1587385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135353
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35035	NC_017167	CGC	2	6	1587604	1587609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135354
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35039	NC_017167	CGT	2	6	1587840	1587845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135355
35040	NC_017167	GAGG	2	8	1587913	1587920	25 %	0 %	75 %	0 %	384135355
35041	NC_017167	CGA	2	6	1588038	1588043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135355
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35043	NC_017167	CGG	2	6	1588167	1588172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135355
35044	NC_017167	ATCC	2	8	1588189	1588196	25 %	25 %	0 %	50 %	384135355
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35068	NC_017167	GC	3	6	1589390	1589395	0 %	0 %	50 %	50 %	384135357
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35099	NC_017167	TC	3	6	1591297	1591302	0 %	50 %	0 %	50 %	384135360
35100	NC_017167	GGCG	2	8	1591324	1591331	0 %	0 %	75 %	25 %	384135360
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35103	NC_017167	TCG	2	6	1591623	1591628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135360
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35106	NC_017167	CG	3	6	1591684	1591689	0 %	0 %	50 %	50 %	384135360
35107	NC_017167	GAG	2	6	1591733	1591738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384135360
35108	NC_017167	ATC	2	6	1591811	1591816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135360
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35110	NC_017167	AGA	2	6	1591830	1591835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384135360
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35113	NC_017167	CGT	2	6	1591970	1591975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135360
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35118	NC_017167	G	6	6	1592162	1592167	0 %	0 %	100 %	0 %	384135360
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35233	NC_017167	GCC	2	6	1597378	1597383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135367
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35471	NC_017167	CGA	2	6	1608117	1608122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135382
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35475	NC_017167	GGCC	2	8	1608269	1608276	0 %	0 %	50 %	50 %	384135382
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35499	NC_017167	GA	3	6	1609557	1609562	50 %	0 %	50 %	0 %	384135383
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