MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_017167	CG	3	6	1536187	1536192	0 %	0 %	50 %	50 %	384135297
34003	NC_017167	GATG	2	8	1536199	1536206	25 %	25 %	50 %	0 %	384135297
34004	NC_017167	CGGCA	2	10	1536218	1536227	20 %	0 %	40 %	40 %	384135297
34005	NC_017167	GC	3	6	1536253	1536258	0 %	0 %	50 %	50 %	384135297
34006	NC_017167	CGA	2	6	1536360	1536365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135297
34007	NC_017167	CCG	2	6	1536387	1536392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135297
34008	NC_017167	GATG	2	8	1536481	1536488	25 %	25 %	50 %	0 %	384135298
34009	NC_017167	CGA	2	6	1536580	1536585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135298
34010	NC_017167	AGCG	2	8	1536637	1536644	25 %	0 %	50 %	25 %	384135298
34011	NC_017167	ATG	2	6	1536798	1536803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135298
34012	NC_017167	GAG	2	6	1536890	1536895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384135298
34013	NC_017167	TGCG	2	8	1536913	1536920	0 %	25 %	50 %	25 %	384135298
34014	NC_017167	GAA	2	6	1536928	1536933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384135298
34015	NC_017167	CTT	2	6	1537036	1537041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384135298
34016	NC_017167	CCT	2	6	1537089	1537094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135298
34017	NC_017167	GC	4	8	1537125	1537132	0 %	0 %	50 %	50 %	384135298
34018	NC_017167	CAG	2	6	1537139	1537144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135298
34019	NC_017167	CG	3	6	1537150	1537155	0 %	0 %	50 %	50 %	384135298
34020	NC_017167	CGA	2	6	1537201	1537206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135298
34021	NC_017167	GTC	2	6	1537232	1537237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135298
34022	NC_017167	GGC	2	6	1537249	1537254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135298
34023	NC_017167	CCA	2	6	1537282	1537287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384135298
34024	NC_017167	CCGA	2	8	1537374	1537381	25 %	0 %	25 %	50 %	384135298
34025	NC_017167	CGAT	2	8	1537425	1537432	25 %	25 %	25 %	25 %	384135298
34026	NC_017167	CCT	2	6	1537450	1537455	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135298
34027	NC_017167	GAC	2	6	1537460	1537465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135298
34028	NC_017167	TC	4	8	1537476	1537483	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34029	NC_017167	CGC	2	6	1537580	1537585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135299
34030	NC_017167	GCT	2	6	1537633	1537638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135299
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34032	NC_017167	GCAG	3	12	1537748	1537759	25 %	0 %	50 %	25 %	384135299
34033	NC_017167	GACGA	2	10	1537775	1537784	40 %	0 %	40 %	20 %	384135299
34034	NC_017167	CTG	2	6	1537811	1537816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135299
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34038	NC_017167	CGA	2	6	1537912	1537917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135299
34039	NC_017167	CGGCCG	2	12	1537945	1537956	0 %	0 %	50 %	50 %	384135299
34040	NC_017167	CCT	2	6	1537969	1537974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135299
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34042	NC_017167	GCTCC	2	10	1538038	1538047	0 %	20 %	20 %	60 %	384135299
34043	NC_017167	ACGT	2	8	1538067	1538074	25 %	25 %	25 %	25 %	384135299
34044	NC_017167	CGA	2	6	1538080	1538085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135299
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34049	NC_017167	TCCC	2	8	1538370	1538377	0 %	25 %	0 %	75 %	384135300
34050	NC_017167	CGC	2	6	1538405	1538410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135300
34051	NC_017167	GAC	4	12	1538424	1538435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135300
34052	NC_017167	ATG	2	6	1538506	1538511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135300
34053	NC_017167	A	6	6	1538532	1538537	100 %	0 %	0 %	0 %	384135300
34054	NC_017167	TCG	2	6	1538551	1538556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135300
34055	NC_017167	GC	3	6	1538578	1538583	0 %	0 %	50 %	50 %	384135300
34056	NC_017167	AATGG	2	10	1538643	1538652	40 %	20 %	40 %	0 %	384135300
34057	NC_017167	CG	4	8	1538723	1538730	0 %	0 %	50 %	50 %	384135300
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34071	NC_017167	CG	3	6	1539169	1539174	0 %	0 %	50 %	50 %	384135300
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34085	NC_017167	CCGC	2	8	1539610	1539617	0 %	0 %	25 %	75 %	384135301
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34089	NC_017167	CCG	2	6	1539962	1539967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135301
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34101	NC_017167	TTG	2	6	1540474	1540479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384135302
34102	NC_017167	TCGGC	2	10	1540493	1540502	0 %	20 %	40 %	40 %	384135302
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34105	NC_017167	CG	4	8	1540565	1540572	0 %	0 %	50 %	50 %	384135302
34106	NC_017167	ATCT	2	8	1540656	1540663	25 %	50 %	0 %	25 %	384135302
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34109	NC_017167	CGTC	2	8	1540760	1540767	0 %	25 %	25 %	50 %	384135302
34110	NC_017167	GCC	2	6	1540788	1540793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135302
34111	NC_017167	GC	3	6	1540810	1540815	0 %	0 %	50 %	50 %	384135302
34112	NC_017167	CGG	2	6	1540817	1540822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135302
34113	NC_017167	AGCG	2	8	1540918	1540925	25 %	0 %	50 %	25 %	384135302
34114	NC_017167	CGTT	2	8	1540935	1540942	0 %	50 %	25 %	25 %	384135302
34115	NC_017167	ACGA	2	8	1540959	1540966	50 %	0 %	25 %	25 %	384135302
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34117	NC_017167	CGA	2	6	1541077	1541082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135303
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34232	NC_017167	TCG	2	6	1545996	1546001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135308
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34234	NC_017167	GC	3	6	1546142	1546147	0 %	0 %	50 %	50 %	384135308
34235	NC_017167	CAC	2	6	1546232	1546237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384135308
34236	NC_017167	CGA	2	6	1546264	1546269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135308
34237	NC_017167	CGT	2	6	1546270	1546275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135308
34238	NC_017167	GCGATG	2	12	1546296	1546307	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384135308
34239	NC_017167	CGC	3	9	1546325	1546333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135308
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34241	NC_017167	TCC	2	6	1546356	1546361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135308
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34245	NC_017167	CGT	2	6	1546537	1546542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135308
34246	NC_017167	CGATGT	2	12	1546558	1546569	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384135308
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34329	NC_017167	TAC	2	6	1550619	1550624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135312
34330	NC_017167	CGG	2	6	1550691	1550696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135313
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34332	NC_017167	CGT	2	6	1550748	1550753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135313
34333	NC_017167	CGA	2	6	1550805	1550810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135313
34334	NC_017167	TCGC	2	8	1550825	1550832	0 %	25 %	25 %	50 %	384135313
34335	NC_017167	ACG	2	6	1550834	1550839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135313
34336	NC_017167	CG	3	6	1550881	1550886	0 %	0 %	50 %	50 %	384135313
34337	NC_017167	CCTC	2	8	1550903	1550910	0 %	25 %	0 %	75 %	384135313
34338	NC_017167	TCAC	2	8	1550936	1550943	25 %	25 %	0 %	50 %	384135313
34339	NC_017167	CCAT	2	8	1550949	1550956	25 %	25 %	0 %	50 %	384135313
34340	NC_017167	GC	3	6	1550983	1550988	0 %	0 %	50 %	50 %	384135313
34341	NC_017167	CGC	2	6	1551004	1551009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135313
34342	NC_017167	GC	3	6	1551057	1551062	0 %	0 %	50 %	50 %	384135313
34343	NC_017167	CG	3	6	1551069	1551074	0 %	0 %	50 %	50 %	384135313
34344	NC_017167	ACG	2	6	1551089	1551094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135313
34345	NC_017167	ACG	2	6	1551165	1551170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135313
34346	NC_017167	GC	3	6	1551179	1551184	0 %	0 %	50 %	50 %	384135313
34347	NC_017167	CTT	2	6	1551210	1551215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384135313
34348	NC_017167	CGT	2	6	1551276	1551281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135313
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34350	NC_017167	ACGCG	2	10	1551330	1551339	20 %	0 %	40 %	40 %	384135313
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34460	NC_017167	GC	3	6	1557228	1557233	0 %	0 %	50 %	50 %	384135322
34461	NC_017167	GT	3	6	1557234	1557239	0 %	50 %	50 %	0 %	384135322
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34463	NC_017167	A	6	6	1557289	1557294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34464	NC_017167	ACG	2	6	1557421	1557426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135323
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34466	NC_017167	CAT	2	6	1557498	1557503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135323
34467	NC_017167	CGCA	2	8	1557504	1557511	25 %	0 %	25 %	50 %	384135323
34468	NC_017167	CGA	2	6	1557558	1557563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135323
34469	NC_017167	TGA	2	6	1557566	1557571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135323
34470	NC_017167	AAG	2	6	1557589	1557594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384135323
34471	NC_017167	CGA	2	6	1557662	1557667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135323
34472	NC_017167	CGA	2	6	1557707	1557712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135323
34473	NC_017167	TTG	2	6	1557791	1557796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34474	NC_017167	CCT	3	9	1558024	1558032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135324
34475	NC_017167	GAC	2	6	1558086	1558091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135324
34476	NC_017167	GCT	2	6	1558161	1558166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135324
34477	NC_017167	GTC	2	6	1558184	1558189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135324
34478	NC_017167	CG	3	6	1558227	1558232	0 %	0 %	50 %	50 %	384135324
34479	NC_017167	CG	3	6	1558246	1558251	0 %	0 %	50 %	50 %	384135324
34480	NC_017167	CCA	2	6	1558264	1558269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384135324
34481	NC_017167	AGC	2	6	1558299	1558304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135324
34482	NC_017167	GCG	2	6	1558322	1558327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135324
34483	NC_017167	TCA	2	6	1558336	1558341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135324
34484	NC_017167	CA	3	6	1558390	1558395	50 %	0 %	0 %	50 %	384135324
34485	NC_017167	AGC	2	6	1558452	1558457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135324
34486	NC_017167	GCGA	2	8	1558466	1558473	25 %	0 %	50 %	25 %	384135324
34487	NC_017167	AGT	2	6	1558477	1558482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135324
34488	NC_017167	GCCT	2	8	1558531	1558538	0 %	25 %	25 %	50 %	384135324
34489	NC_017167	CGT	2	6	1558564	1558569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135324
34490	NC_017167	ATC	2	6	1558593	1558598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135324
34491	NC_017167	AGC	2	6	1558701	1558706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135324
34492	NC_017167	GTCC	2	8	1558707	1558714	0 %	25 %	25 %	50 %	384135324
34493	NC_017167	CG	4	8	1558739	1558746	0 %	0 %	50 %	50 %	384135324
34494	NC_017167	AGA	2	6	1558794	1558799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384135324
34495	NC_017167	CTC	2	6	1558828	1558833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135325
34496	NC_017167	GCGG	2	8	1558873	1558880	0 %	0 %	75 %	25 %	384135325
34497	NC_017167	CAC	2	6	1558988	1558993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384135325
34498	NC_017167	GTAAAA	2	12	1559021	1559032	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384135325
34499	NC_017167	GTA	2	6	1559033	1559038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135325
34500	NC_017167	GCC	2	6	1559041	1559046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135325

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