MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_017167	CCA	2	6	1490993	1490998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384135252
33003	NC_017167	TCA	2	6	1491023	1491028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135252
33004	NC_017167	GC	3	6	1491060	1491065	0 %	0 %	50 %	50 %	384135252
33005	NC_017167	TCC	2	6	1491067	1491072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135252
33006	NC_017167	TG	3	6	1491106	1491111	0 %	50 %	50 %	0 %	384135252
33007	NC_017167	GC	3	6	1491145	1491150	0 %	0 %	50 %	50 %	384135252
33008	NC_017167	CGA	2	6	1491191	1491196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135252
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33010	NC_017167	CCG	2	6	1491280	1491285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135252
33011	NC_017167	GC	3	6	1491335	1491340	0 %	0 %	50 %	50 %	384135252
33012	NC_017167	CCG	2	6	1491464	1491469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135253
33013	NC_017167	CG	3	6	1491490	1491495	0 %	0 %	50 %	50 %	384135253
33014	NC_017167	TTC	2	6	1491498	1491503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384135253
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33016	NC_017167	ATG	2	6	1491529	1491534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135253
33017	NC_017167	CCTCGA	2	12	1491575	1491586	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384135253
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33019	NC_017167	TCC	2	6	1491718	1491723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135253
33020	NC_017167	CCG	2	6	1491764	1491769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135253
33021	NC_017167	GAT	3	9	1491777	1491785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135253
33022	NC_017167	GC	5	10	1491821	1491830	0 %	0 %	50 %	50 %	384135253
33023	NC_017167	TCG	2	6	1491847	1491852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135253
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33028	NC_017167	CG	3	6	1492043	1492048	0 %	0 %	50 %	50 %	384135253
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33032	NC_017167	ATC	2	6	1492249	1492254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135253
33033	NC_017167	ATC	2	6	1492291	1492296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135253
33034	NC_017167	CGA	2	6	1492322	1492327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135253
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33037	NC_017167	GCG	2	6	1492483	1492488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135254
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33044	NC_017167	CGA	2	6	1492795	1492800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135254
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33049	NC_017167	CTCAT	2	10	1493136	1493145	20 %	40 %	0 %	40 %	384135254
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33052	NC_017167	CGCC	2	8	1493295	1493302	0 %	0 %	25 %	75 %	384135255
33053	NC_017167	GC	4	8	1493325	1493332	0 %	0 %	50 %	50 %	384135255
33054	NC_017167	TCC	2	6	1493402	1493407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135255
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33079	NC_017167	GC	3	6	1494470	1494475	0 %	0 %	50 %	50 %	384135255
33080	NC_017167	CCTC	2	8	1494476	1494483	0 %	25 %	0 %	75 %	384135255
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33086	NC_017167	GC	3	6	1494764	1494769	0 %	0 %	50 %	50 %	384135256
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33098	NC_017167	TCCC	2	8	1495434	1495441	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
33099	NC_017167	GGC	2	6	1495456	1495461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33100	NC_017167	CGC	2	6	1495585	1495590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33101	NC_017167	TC	3	6	1495674	1495679	0 %	50 %	0 %	50 %	384135257
33102	NC_017167	GAG	2	6	1495793	1495798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384135257
33103	NC_017167	CGG	2	6	1495837	1495842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135257
33104	NC_017167	CAT	3	9	1495843	1495851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135257
33105	NC_017167	GAG	2	6	1495892	1495897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384135257
33106	NC_017167	CGA	2	6	1495912	1495917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135257
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33108	NC_017167	CCAC	2	8	1495998	1496005	25 %	0 %	0 %	75 %	384135257
33109	NC_017167	GCC	2	6	1496010	1496015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135257
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33112	NC_017167	CCG	2	6	1496271	1496276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135257
33113	NC_017167	GCCG	2	8	1496281	1496288	0 %	0 %	50 %	50 %	384135257
33114	NC_017167	TCGC	2	8	1496315	1496322	0 %	25 %	25 %	50 %	384135257
33115	NC_017167	CTA	2	6	1496368	1496373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135257
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33349	NC_017167	CG	3	6	1508275	1508280	0 %	0 %	50 %	50 %	384135269
33350	NC_017167	GA	3	6	1508314	1508319	50 %	0 %	50 %	0 %	384135269
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