MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32118	NC_017167	TGA	2	6	1449783	1449788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135214
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32127	NC_017167	CGA	2	6	1450171	1450176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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32130	NC_017167	GGAT	2	8	1450287	1450294	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32131	NC_017167	GCG	2	6	1450315	1450320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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32136	NC_017167	AGGC	2	8	1450909	1450916	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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32154	NC_017167	GGA	2	6	1451907	1451912	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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32217	NC_017167	ATG	2	6	1455403	1455408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32218	NC_017167	GGT	2	6	1455409	1455414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32219	NC_017167	AAG	2	6	1455455	1455460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384135224
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32222	NC_017167	CG	3	6	1455675	1455680	0 %	0 %	50 %	50 %	384135224
32223	NC_017167	GTGAA	2	10	1455740	1455749	40 %	20 %	40 %	0 %	384135224
32224	NC_017167	CG	3	6	1455778	1455783	0 %	0 %	50 %	50 %	384135224
32225	NC_017167	ATC	2	6	1455784	1455789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135224
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32227	NC_017167	CGCC	2	8	1455903	1455910	0 %	0 %	25 %	75 %	384135224
32228	NC_017167	GAA	2	6	1455940	1455945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384135224
32229	NC_017167	TC	3	6	1455998	1456003	0 %	50 %	0 %	50 %	384135224
32230	NC_017167	AATG	2	8	1456062	1456069	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32231	NC_017167	TCAT	2	8	1456075	1456082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32232	NC_017167	T	7	7	1456136	1456142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32233	NC_017167	TGA	2	6	1456202	1456207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32234	NC_017167	GAA	2	6	1456223	1456228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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32236	NC_017167	CGT	2	6	1456318	1456323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135225
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32264	NC_017167	GCA	2	6	1457502	1457507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135225
32265	NC_017167	GC	3	6	1457524	1457529	0 %	0 %	50 %	50 %	384135225
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32303	NC_017167	CGT	2	6	1459005	1459010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135226
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32310	NC_017167	CGC	2	6	1459584	1459589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135226
32311	NC_017167	TGG	2	6	1459649	1459654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384135226
32312	NC_017167	TGC	2	6	1459716	1459721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135226
32313	NC_017167	AGCCTG	2	12	1459781	1459792	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384135226
32314	NC_017167	GATC	2	8	1459812	1459819	25 %	25 %	25 %	25 %	384135226
32315	NC_017167	CGC	2	6	1459821	1459826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135226
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32322	NC_017167	GCG	2	6	1460155	1460160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135226
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32324	NC_017167	TGC	2	6	1460216	1460221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135226
32325	NC_017167	GCC	2	6	1460224	1460229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135226
32326	NC_017167	GGCGTC	2	12	1460257	1460268	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384135226
32327	NC_017167	TGGCGG	2	12	1460274	1460285	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384135226
32328	NC_017167	CGC	2	6	1460302	1460307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135226
32329	NC_017167	TCGG	2	8	1460317	1460324	0 %	25 %	50 %	25 %	384135226
32330	NC_017167	GAC	2	6	1460329	1460334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135226
32331	NC_017167	CGA	2	6	1460390	1460395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135226
32332	NC_017167	GCTG	2	8	1460420	1460427	0 %	25 %	50 %	25 %	384135226
32333	NC_017167	TCG	2	6	1460444	1460449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135226
32334	NC_017167	ACG	2	6	1460453	1460458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135226
32335	NC_017167	CGC	2	6	1460519	1460524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135226
32336	NC_017167	CG	4	8	1460583	1460590	0 %	0 %	50 %	50 %	384135226
32337	NC_017167	CGG	2	6	1460675	1460680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135226
32338	NC_017167	GCA	2	6	1460769	1460774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135226
32339	NC_017167	ACG	2	6	1460818	1460823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32340	NC_017167	ACG	2	6	1460827	1460832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32341	NC_017167	GCAC	2	8	1460876	1460883	25 %	0 %	25 %	50 %	384135227
32342	NC_017167	GT	3	6	1460907	1460912	0 %	50 %	50 %	0 %	384135227
32343	NC_017167	GGA	2	6	1460929	1460934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384135227
32344	NC_017167	GC	3	6	1460941	1460946	0 %	0 %	50 %	50 %	384135227
32345	NC_017167	GC	3	6	1460953	1460958	0 %	0 %	50 %	50 %	384135227
32346	NC_017167	GC	3	6	1460968	1460973	0 %	0 %	50 %	50 %	384135227
32347	NC_017167	CCG	2	6	1460988	1460993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135227
32348	NC_017167	GTC	2	6	1461005	1461010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135227
32349	NC_017167	CAT	2	6	1461058	1461063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135227
32350	NC_017167	GCCATT	2	12	1461137	1461148	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384135227
32351	NC_017167	GCG	2	6	1461195	1461200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135227
32352	NC_017167	ACATCT	2	12	1461276	1461287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135227
32353	NC_017167	GCG	2	6	1461383	1461388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135227
32354	NC_017167	CAG	2	6	1461389	1461394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135227
32355	NC_017167	GAC	2	6	1461407	1461412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135227
32356	NC_017167	CGA	2	6	1461448	1461453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135227
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32358	NC_017167	CGGCG	2	10	1461601	1461610	0 %	0 %	60 %	40 %	384135227
32359	NC_017167	GTC	2	6	1461617	1461622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135227
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32364	NC_017167	CGG	2	6	1461868	1461873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135227
32365	NC_017167	GCG	3	9	1461943	1461951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135227
32366	NC_017167	CGG	3	9	1461952	1461960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135227
32367	NC_017167	CGT	2	6	1461967	1461972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135227
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32370	NC_017167	TCA	2	6	1462021	1462026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135227
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32372	NC_017167	TCA	2	6	1462096	1462101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135228
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32413	NC_017167	GTG	2	6	1463814	1463819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384135228
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32415	NC_017167	CCG	2	6	1463901	1463906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135229
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32419	NC_017167	TTC	2	6	1464000	1464005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384135229
32420	NC_017167	CTG	2	6	1464041	1464046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135229
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32425	NC_017167	GGA	2	6	1464218	1464223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384135229
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32427	NC_017167	G	6	6	1464380	1464385	0 %	0 %	100 %	0 %	384135229
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32435	NC_017167	ATC	2	6	1464805	1464810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135229
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32443	NC_017167	TGA	2	6	1465102	1465107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135229
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32449	NC_017167	GGC	2	6	1465307	1465312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135229
32450	NC_017167	CGA	2	6	1465403	1465408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135229
32451	NC_017167	TCC	2	6	1465495	1465500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135229
32452	NC_017167	GGA	2	6	1465514	1465519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384135229
32453	NC_017167	AGG	2	6	1465544	1465549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32454	NC_017167	AGC	2	6	1465587	1465592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135230
32455	NC_017167	GACG	2	8	1465593	1465600	25 %	0 %	50 %	25 %	384135230
32456	NC_017167	GTG	2	6	1465663	1465668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384135230
32457	NC_017167	GC	3	6	1465705	1465710	0 %	0 %	50 %	50 %	384135230
32458	NC_017167	GCT	2	6	1465737	1465742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135230
32459	NC_017167	CTC	2	6	1465759	1465764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135230
32460	NC_017167	GTG	2	6	1465792	1465797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384135230
32461	NC_017167	ACG	2	6	1465798	1465803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135230
32462	NC_017167	TTCAC	2	10	1465814	1465823	20 %	40 %	0 %	40 %	384135230
32463	NC_017167	GCGA	2	8	1465831	1465838	25 %	0 %	50 %	25 %	384135230
32464	NC_017167	CATC	2	8	1465866	1465873	25 %	25 %	0 %	50 %	384135230
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32466	NC_017167	CTT	2	6	1465970	1465975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384135230
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