MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_017167	GCCG	2	8	1420797	1420804	0 %	0 %	50 %	50 %	384135187
31502	NC_017167	GAA	2	6	1420810	1420815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384135187
31503	NC_017167	CG	3	6	1420860	1420865	0 %	0 %	50 %	50 %	384135187
31504	NC_017167	TGG	2	6	1420895	1420900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384135187
31505	NC_017167	GC	3	6	1421001	1421006	0 %	0 %	50 %	50 %	384135187
31506	NC_017167	AGC	2	6	1421033	1421038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135187
31507	NC_017167	TCG	2	6	1421039	1421044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135187
31508	NC_017167	GCA	2	6	1421093	1421098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135187
31509	NC_017167	TCA	2	6	1421138	1421143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135187
31510	NC_017167	GGC	2	6	1421227	1421232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135187
31511	NC_017167	GC	3	6	1421231	1421236	0 %	0 %	50 %	50 %	384135187
31512	NC_017167	TTGA	2	8	1421275	1421282	25 %	50 %	25 %	0 %	384135187
31513	NC_017167	TCA	2	6	1421297	1421302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135187
31514	NC_017167	CGG	2	6	1421345	1421350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135187
31515	NC_017167	GTG	2	6	1421411	1421416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31516	NC_017167	GA	3	6	1421500	1421505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31517	NC_017167	AGG	2	6	1421537	1421542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31518	NC_017167	CGT	2	6	1421646	1421651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135188
31519	NC_017167	TGG	2	6	1421669	1421674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384135188
31520	NC_017167	AGG	2	6	1421690	1421695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384135188
31521	NC_017167	CT	3	6	1421782	1421787	0 %	50 %	0 %	50 %	384135188
31522	NC_017167	GGC	2	6	1421858	1421863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135188
31523	NC_017167	TCGA	2	8	1421864	1421871	25 %	25 %	25 %	25 %	384135188
31524	NC_017167	GAAC	2	8	1421901	1421908	50 %	0 %	25 %	25 %	384135188
31525	NC_017167	GAA	2	6	1422055	1422060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384135188
31526	NC_017167	GTG	2	6	1422064	1422069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384135188
31527	NC_017167	TGT	2	6	1422080	1422085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384135188
31528	NC_017167	GCG	3	9	1422093	1422101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135188
31529	NC_017167	TCA	2	6	1422155	1422160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135188
31530	NC_017167	CGA	2	6	1422185	1422190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135188
31531	NC_017167	GGA	2	6	1422192	1422197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384135188
31532	NC_017167	GTG	2	6	1422217	1422222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384135188
31533	NC_017167	CAT	2	6	1422249	1422254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135188
31534	NC_017167	CGGA	2	8	1422257	1422264	25 %	0 %	50 %	25 %	384135188
31535	NC_017167	ACT	2	6	1422323	1422328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135188
31536	NC_017167	CTTGC	2	10	1422343	1422352	0 %	40 %	20 %	40 %	384135188
31537	NC_017167	CCT	2	6	1422360	1422365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135188
31538	NC_017167	TTG	2	6	1422439	1422444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384135188
31539	NC_017167	CGC	2	6	1422449	1422454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135188
31540	NC_017167	GGC	2	6	1422468	1422473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135188
31541	NC_017167	ACA	2	6	1422474	1422479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384135188
31542	NC_017167	ATG	2	6	1422520	1422525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135188
31543	NC_017167	TCG	2	6	1422593	1422598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135188
31544	NC_017167	CGG	2	6	1422620	1422625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135188
31545	NC_017167	TCA	2	6	1422656	1422661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135188
31546	NC_017167	GCCC	2	8	1422696	1422703	0 %	0 %	25 %	75 %	384135188
31547	NC_017167	CG	3	6	1422720	1422725	0 %	0 %	50 %	50 %	384135188
31548	NC_017167	GCT	2	6	1422726	1422731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135188
31549	NC_017167	TC	3	6	1422817	1422822	0 %	50 %	0 %	50 %	384135188
31550	NC_017167	ATC	2	6	1422889	1422894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135188
31551	NC_017167	CG	3	6	1422895	1422900	0 %	0 %	50 %	50 %	384135188
31552	NC_017167	GTG	2	6	1422903	1422908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384135188
31553	NC_017167	GAT	2	6	1422909	1422914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135188
31554	NC_017167	CG	3	6	1422972	1422977	0 %	0 %	50 %	50 %	384135188
31555	NC_017167	CGC	2	6	1422986	1422991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135188
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31557	NC_017167	GCC	2	6	1423068	1423073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135189
31558	NC_017167	GGATT	2	10	1423241	1423250	20 %	40 %	40 %	0 %	384135189
31559	NC_017167	CGG	2	6	1423255	1423260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384135189
31560	NC_017167	GCA	2	6	1423325	1423330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135189
31561	NC_017167	CGAG	2	8	1423394	1423401	25 %	0 %	50 %	25 %	384135189
31562	NC_017167	CAGC	2	8	1423418	1423425	25 %	0 %	25 %	50 %	384135189
31563	NC_017167	TCA	2	6	1423432	1423437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135189
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31566	NC_017167	CGA	2	6	1423553	1423558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384135189
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31577	NC_017167	GTGG	2	8	1424260	1424267	0 %	25 %	75 %	0 %	384135190
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31585	NC_017167	GC	3	6	1424840	1424845	0 %	0 %	50 %	50 %	384135191
31586	NC_017167	GCC	2	6	1424870	1424875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384135191
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31593	NC_017167	CTCGC	2	10	1425043	1425052	0 %	20 %	20 %	60 %	384135191
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31599	NC_017167	GC	3	6	1425462	1425467	0 %	0 %	50 %	50 %	384135191
31600	NC_017167	CGGG	2	8	1425510	1425517	0 %	0 %	75 %	25 %	384135191
31601	NC_017167	GGA	2	6	1425583	1425588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31602	NC_017167	AGCC	2	8	1425622	1425629	25 %	0 %	25 %	50 %	384135192
31603	NC_017167	CTC	2	6	1425673	1425678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384135192
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31605	NC_017167	CAT	2	6	1425699	1425704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384135192
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31607	NC_017167	CTT	2	6	1425759	1425764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384135192
31608	NC_017167	CGT	2	6	1425777	1425782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135192
31609	NC_017167	GAG	2	6	1425856	1425861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384135192
31610	NC_017167	TCT	2	6	1425866	1425871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384135192
31611	NC_017167	GATC	2	8	1425909	1425916	25 %	25 %	25 %	25 %	384135192
31612	NC_017167	TCG	3	9	1425989	1425997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384135192
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31615	NC_017167	TGA	2	6	1426088	1426093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384135192
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31617	NC_017167	GAG	2	6	1426210	1426215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384135192
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