MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_017167	TTG	2	6	1171065	1171070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134928
26003	NC_017167	CGG	2	6	1171077	1171082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134928
26004	NC_017167	TGA	2	6	1171103	1171108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134928
26005	NC_017167	GTCG	2	8	1171122	1171129	0 %	25 %	50 %	25 %	384134928
26006	NC_017167	ATG	2	6	1171240	1171245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134928
26007	NC_017167	TCG	2	6	1171274	1171279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134928
26008	NC_017167	AGC	2	6	1171299	1171304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134928
26009	NC_017167	CGGG	2	8	1171331	1171338	0 %	0 %	75 %	25 %	384134928
26010	NC_017167	AGC	2	6	1171339	1171344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134928
26011	NC_017167	TCA	2	6	1171376	1171381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134928
26012	NC_017167	CG	3	6	1171383	1171388	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26013	NC_017167	TCC	2	6	1171409	1171414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26014	NC_017167	ACCG	2	8	1171498	1171505	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26015	NC_017167	CCA	2	6	1171514	1171519	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26016	NC_017167	GTG	2	6	1171525	1171530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26017	NC_017167	GAAA	2	8	1171556	1171563	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26018	NC_017167	TAC	2	6	1171631	1171636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26019	NC_017167	GGGA	2	8	1171643	1171650	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
26020	NC_017167	TTCC	2	8	1171813	1171820	0 %	50 %	0 %	50 %	384134929
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26033	NC_017167	TGA	2	6	1172459	1172464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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26045	NC_017167	GCA	2	6	1172769	1172774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134931
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26052	NC_017167	G	6	6	1173158	1173163	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26053	NC_017167	GGA	2	6	1173176	1173181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134932
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26055	NC_017167	GC	4	8	1173314	1173321	0 %	0 %	50 %	50 %	384134932
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26108	NC_017167	CAAG	2	8	1176016	1176023	50 %	0 %	25 %	25 %	384134935
26109	NC_017167	CA	3	6	1176028	1176033	50 %	0 %	0 %	50 %	384134935
26110	NC_017167	GCG	2	6	1176053	1176058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134935
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26238	NC_017167	CG	3	6	1181555	1181560	0 %	0 %	50 %	50 %	384134940
26239	NC_017167	ACG	2	6	1181589	1181594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134940
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26241	NC_017167	GC	3	6	1181639	1181644	0 %	0 %	50 %	50 %	384134940
26242	NC_017167	CG	3	6	1181657	1181662	0 %	0 %	50 %	50 %	384134940
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26349	NC_017167	GC	3	6	1186976	1186981	0 %	0 %	50 %	50 %	384134944
26350	NC_017167	CG	3	6	1187012	1187017	0 %	0 %	50 %	50 %	384134944
26351	NC_017167	ACC	2	6	1187056	1187061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134944
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26466	NC_017167	GCG	2	6	1192170	1192175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134948
26467	NC_017167	AG	3	6	1192203	1192208	50 %	0 %	50 %	0 %	384134948
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