MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_017167	GCG	2	6	940389	940394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21002	NC_017167	CGC	2	6	940429	940434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21003	NC_017167	CACGG	2	10	940462	940471	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21004	NC_017167	CAC	2	6	940483	940488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21005	NC_017167	GCC	2	6	940616	940621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21006	NC_017167	GC	4	8	940646	940653	0 %	0 %	50 %	50 %	384134679
21007	NC_017167	GGC	2	6	940838	940843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134679
21008	NC_017167	CAC	2	6	940844	940849	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134679
21009	NC_017167	ACACG	2	10	940876	940885	40 %	0 %	20 %	40 %	384134679
21010	NC_017167	CAG	2	6	940937	940942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134679
21011	NC_017167	GTCGA	2	10	941036	941045	20 %	20 %	40 %	20 %	384134679
21012	NC_017167	CGT	2	6	941056	941061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134679
21013	NC_017167	CTC	2	6	941075	941080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134679
21014	NC_017167	TGA	2	6	941100	941105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134679
21015	NC_017167	GC	4	8	941121	941128	0 %	0 %	50 %	50 %	384134679
21016	NC_017167	CGA	2	6	941260	941265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134679
21017	NC_017167	TCG	2	6	941271	941276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134679
21018	NC_017167	GCT	2	6	941323	941328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134679
21019	NC_017167	GCGA	2	8	941363	941370	25 %	0 %	50 %	25 %	384134679
21020	NC_017167	GAC	2	6	941426	941431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134679
21021	NC_017167	GGT	2	6	941437	941442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134679
21022	NC_017167	TGA	2	6	941449	941454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134679
21023	NC_017167	CTCG	2	8	941462	941469	0 %	25 %	25 %	50 %	384134679
21024	NC_017167	GCG	2	6	941528	941533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134679
21025	NC_017167	TGC	2	6	941550	941555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134679
21026	NC_017167	GCC	2	6	941587	941592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134679
21027	NC_017167	TCG	2	6	941598	941603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134679
21028	NC_017167	CAT	2	6	941642	941647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134680
21029	NC_017167	TCA	2	6	941659	941664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134680
21030	NC_017167	GC	3	6	941707	941712	0 %	0 %	50 %	50 %	384134680
21031	NC_017167	GTGG	2	8	941801	941808	0 %	25 %	75 %	0 %	384134680
21032	NC_017167	CTG	2	6	941901	941906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134680
21033	NC_017167	CGG	2	6	942010	942015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134680
21034	NC_017167	CG	3	6	942142	942147	0 %	0 %	50 %	50 %	384134680
21035	NC_017167	CGGC	2	8	942208	942215	0 %	0 %	50 %	50 %	384134680
21036	NC_017167	GTC	2	6	942240	942245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134680
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21040	NC_017167	CTTCGG	2	12	942536	942547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134680
21041	NC_017167	GGCG	2	8	942560	942567	0 %	0 %	75 %	25 %	384134680
21042	NC_017167	GCC	2	6	942609	942614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134680
21043	NC_017167	TG	3	6	942627	942632	0 %	50 %	50 %	0 %	384134680
21044	NC_017167	CG	3	6	942644	942649	0 %	0 %	50 %	50 %	384134680
21045	NC_017167	GT	3	6	942686	942691	0 %	50 %	50 %	0 %	384134680
21046	NC_017167	AGC	2	6	942709	942714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134680
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21048	NC_017167	TAC	2	6	942783	942788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134680
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21051	NC_017167	GC	4	8	942890	942897	0 %	0 %	50 %	50 %	384134680
21052	NC_017167	CGACGG	2	12	942926	942937	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384134680
21053	NC_017167	GCA	2	6	943178	943183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134680
21054	NC_017167	CTGG	2	8	943187	943194	0 %	25 %	50 %	25 %	384134680
21055	NC_017167	CG	4	8	943307	943314	0 %	0 %	50 %	50 %	384134680
21056	NC_017167	CTG	2	6	943326	943331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134680
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21058	NC_017167	GGTC	2	8	943414	943421	0 %	25 %	50 %	25 %	384134680
21059	NC_017167	GGA	2	6	943475	943480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134680
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21062	NC_017167	GCG	3	9	943623	943631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134680
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21064	NC_017167	CGC	2	6	943678	943683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134680
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21067	NC_017167	TGG	2	6	943813	943818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134680
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21099	NC_017167	CGG	2	6	945227	945232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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21101	NC_017167	CCG	3	9	945247	945255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21102	NC_017167	AGG	2	6	945262	945267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21103	NC_017167	GTG	2	6	945339	945344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134682
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21107	NC_017167	GTG	3	9	945564	945572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134682
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21115	NC_017167	GAG	2	6	945879	945884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134682
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21118	NC_017167	TCG	2	6	945973	945978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134682
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21357	NC_017167	CG	3	6	955778	955783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21358	NC_017167	GGCG	2	8	955807	955814	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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21483	NC_017167	GTC	2	6	960845	960850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134696
21484	NC_017167	CGG	2	6	960904	960909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134696
21485	NC_017167	TCG	2	6	960918	960923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134696
21486	NC_017167	GGCT	2	8	960962	960969	0 %	25 %	50 %	25 %	384134696
21487	NC_017167	ATCTGG	2	12	961080	961091	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384134696
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21491	NC_017167	CGT	2	6	961156	961161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134696
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