MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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20502	NC_017167	ACA	2	6	918484	918489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134659
20503	NC_017167	CGG	3	9	918491	918499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134659
20504	NC_017167	GGC	2	6	918530	918535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134659
20505	NC_017167	CGC	2	6	918572	918577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134659
20506	NC_017167	TCG	2	6	918583	918588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134659
20507	NC_017167	CAT	2	6	918659	918664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134659
20508	NC_017167	GCT	2	6	918785	918790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134659
20509	NC_017167	GAT	2	6	918791	918796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134659
20510	NC_017167	GC	3	6	918832	918837	0 %	0 %	50 %	50 %	384134659
20511	NC_017167	GCTCGG	2	12	918875	918886	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384134659
20512	NC_017167	TGA	2	6	918901	918906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134659
20513	NC_017167	CAA	2	6	918932	918937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134659
20514	NC_017167	GGC	2	6	919001	919006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134659
20515	NC_017167	GGGC	2	8	919015	919022	0 %	0 %	75 %	25 %	384134659
20516	NC_017167	CCG	2	6	919029	919034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134659
20517	NC_017167	CGC	2	6	919058	919063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134659
20518	NC_017167	GGA	2	6	919082	919087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134659
20519	NC_017167	CGC	2	6	919094	919099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134659
20520	NC_017167	GCC	2	6	919104	919109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134659
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20523	NC_017167	CAT	2	6	919187	919192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134659
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20525	NC_017167	TCG	2	6	919315	919320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134659
20526	NC_017167	GGGC	2	8	919321	919328	0 %	0 %	75 %	25 %	384134659
20527	NC_017167	GCC	2	6	919335	919340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134659
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20529	NC_017167	GCA	2	6	919406	919411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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20533	NC_017167	TTC	2	6	919584	919589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134660
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20535	NC_017167	CCTG	2	8	919633	919640	0 %	25 %	25 %	50 %	384134660
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20542	NC_017167	CG	4	8	919877	919884	0 %	0 %	50 %	50 %	384134660
20543	NC_017167	ATC	2	6	919935	919940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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20545	NC_017167	CGA	2	6	919977	919982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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20547	NC_017167	TGGA	2	8	920124	920131	25 %	25 %	50 %	0 %	384134661
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20555	NC_017167	ATC	2	6	920487	920492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134661
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20557	NC_017167	CGG	2	6	920606	920611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134661
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20565	NC_017167	GC	3	6	920935	920940	0 %	0 %	50 %	50 %	384134661
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20590	NC_017167	GCACC	2	10	922211	922220	20 %	0 %	20 %	60 %	384134662
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20609	NC_017167	ATCTG	2	10	922923	922932	20 %	40 %	20 %	20 %	384134663
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