MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_017167	GGC	2	6	872239	872244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134610
19503	NC_017167	GGC	2	6	872248	872253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134610
19504	NC_017167	CGA	2	6	872261	872266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134610
19505	NC_017167	TCG	2	6	872271	872276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134610
19506	NC_017167	GAC	2	6	872297	872302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134610
19507	NC_017167	CGT	2	6	872331	872336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134610
19508	NC_017167	GC	3	6	872340	872345	0 %	0 %	50 %	50 %	384134610
19509	NC_017167	GC	3	6	872383	872388	0 %	0 %	50 %	50 %	384134610
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19512	NC_017167	T	6	6	872679	872684	0 %	100 %	0 %	0 %	384134611
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19515	NC_017167	CGA	2	6	872741	872746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134611
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19517	NC_017167	GAAA	2	8	872822	872829	75 %	0 %	25 %	0 %	384134611
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19520	NC_017167	GAAA	2	8	873070	873077	75 %	0 %	25 %	0 %	384134611
19521	NC_017167	CGG	2	6	873093	873098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134611
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19535	NC_017167	GCA	2	6	874092	874097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134612
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19537	NC_017167	GAG	2	6	874257	874262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19538	NC_017167	AGGGCG	2	12	874317	874328	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384134613
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19552	NC_017167	TCG	2	6	875139	875144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134613
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19555	NC_017167	GGCGCA	2	12	875290	875301	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384134613
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19567	NC_017167	GC	3	6	875985	875990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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19585	NC_017167	GATCT	2	10	876826	876835	20 %	40 %	20 %	20 %	384134614
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19592	NC_017167	CGG	2	6	877241	877246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134614
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19599	NC_017167	CG	3	6	877503	877508	0 %	0 %	50 %	50 %	384134615
19600	NC_017167	GCT	2	6	877529	877534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19602	NC_017167	AGGCG	2	10	877578	877587	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
19603	NC_017167	AGG	2	6	877596	877601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19604	NC_017167	CTC	2	6	877694	877699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134616
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19607	NC_017167	GAG	2	6	877844	877849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134616
19608	NC_017167	TCGC	2	8	877934	877941	0 %	25 %	25 %	50 %	384134616
19609	NC_017167	CCG	2	6	877997	878002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134616
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19612	NC_017167	TCCA	3	12	878154	878165	25 %	25 %	0 %	50 %	384134616
19613	NC_017167	CCGT	2	8	878171	878178	0 %	25 %	25 %	50 %	384134616
19614	NC_017167	CG	3	6	878196	878201	0 %	0 %	50 %	50 %	384134616
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19618	NC_017167	TCGC	2	8	878291	878298	0 %	25 %	25 %	50 %	384134616
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