MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_017167	GC	3	6	849093	849098	0 %	0 %	50 %	50 %	384134590
19003	NC_017167	TCCA	2	8	849191	849198	25 %	25 %	0 %	50 %	384134591
19004	NC_017167	CCT	2	6	849318	849323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134591
19005	NC_017167	GAT	2	6	849367	849372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134591
19006	NC_017167	GAC	2	6	849430	849435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134591
19007	NC_017167	CGC	2	6	849436	849441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134591
19008	NC_017167	CTC	2	6	849457	849462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134591
19009	NC_017167	GGA	2	6	849508	849513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134591
19010	NC_017167	CTC	2	6	849561	849566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19011	NC_017167	GGCGC	2	10	849619	849628	0 %	0 %	60 %	40 %	384134592
19012	NC_017167	CGG	2	6	849743	849748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134592
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19014	NC_017167	CCGT	2	8	849796	849803	0 %	25 %	25 %	50 %	384134592
19015	NC_017167	CGA	2	6	849828	849833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134592
19016	NC_017167	CAT	2	6	849874	849879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134592
19017	NC_017167	CCGT	2	8	849926	849933	0 %	25 %	25 %	50 %	384134592
19018	NC_017167	TCG	2	6	849959	849964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134592
19019	NC_017167	CTC	2	6	849970	849975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134592
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19021	NC_017167	TCA	2	6	850032	850037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134592
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19024	NC_017167	GTCG	2	8	850345	850352	0 %	25 %	50 %	25 %	384134592
19025	NC_017167	CGA	2	6	850416	850421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134592
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19030	NC_017167	TCTTG	2	10	850793	850802	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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19033	NC_017167	GTT	2	6	850945	850950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19034	NC_017167	GTT	2	6	850990	850995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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19036	NC_017167	CCT	2	6	851145	851150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134593
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19050	NC_017167	TGC	2	6	851814	851819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134593
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19052	NC_017167	GC	3	6	851902	851907	0 %	0 %	50 %	50 %	384134593
19053	NC_017167	GAG	2	6	851927	851932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134593
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19056	NC_017167	CGACC	2	10	852004	852013	20 %	0 %	20 %	60 %	384134593
19057	NC_017167	CCT	2	6	852019	852024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134593
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19062	NC_017167	GC	3	6	852263	852268	0 %	0 %	50 %	50 %	384134593
19063	NC_017167	CGA	2	6	852271	852276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134593
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19090	NC_017167	CGTG	2	8	853335	853342	0 %	25 %	50 %	25 %	384134594
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19093	NC_017167	CCGG	2	8	853542	853549	0 %	0 %	50 %	50 %	384134594
19094	NC_017167	TCG	2	6	853595	853600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134594
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19099	NC_017167	ACA	2	6	853721	853726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134594
19100	NC_017167	ACGA	2	8	853755	853762	50 %	0 %	25 %	25 %	384134594
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19103	NC_017167	CCG	2	6	853925	853930	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134595
19104	NC_017167	TGCGCG	2	12	853951	853962	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384134595
19105	NC_017167	CG	3	6	854022	854027	0 %	0 %	50 %	50 %	384134595
19106	NC_017167	GCC	2	6	854049	854054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134595
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19109	NC_017167	ATC	2	6	854169	854174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134595
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19111	NC_017167	CG	4	8	854324	854331	0 %	0 %	50 %	50 %	384134595
19112	NC_017167	CTC	2	6	854340	854345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134595
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19119	NC_017167	CGA	2	6	854780	854785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134595
19120	NC_017167	GGC	2	6	854799	854804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134595
19121	NC_017167	CCG	2	6	854815	854820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134595
19122	NC_017167	CGA	2	6	854882	854887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134595
19123	NC_017167	CAC	2	6	854960	854965	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134595
19124	NC_017167	TCA	2	6	854968	854973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134595
19125	NC_017167	CGA	2	6	854989	854994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134595
19126	NC_017167	TCG	2	6	855037	855042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134595
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19147	NC_017167	CGG	2	6	855732	855737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134596
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19149	NC_017167	GGCA	2	8	855796	855803	25 %	0 %	50 %	25 %	384134596
19150	NC_017167	CGA	2	6	855903	855908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134596
19151	NC_017167	CCA	2	6	856095	856100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134596
19152	NC_017167	CCT	2	6	856131	856136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19153	NC_017167	CCT	2	6	856295	856300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134597
19154	NC_017167	TGG	2	6	856310	856315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134597
19155	NC_017167	ACGCG	2	10	856352	856361	20 %	0 %	40 %	40 %	384134597
19156	NC_017167	AGT	2	6	856448	856453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134597
19157	NC_017167	CGT	2	6	856494	856499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134597
19158	NC_017167	TGG	2	6	856508	856513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134597
19159	NC_017167	TGG	2	6	856523	856528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134597
19160	NC_017167	GAC	2	6	856530	856535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134597
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19162	NC_017167	GGC	2	6	856563	856568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134597
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19169	NC_017167	GAG	2	6	856812	856817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134597
19170	NC_017167	GC	4	8	856897	856904	0 %	0 %	50 %	50 %	384134597
19171	NC_017167	CGAG	2	8	856919	856926	25 %	0 %	50 %	25 %	384134597
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19183	NC_017167	CGT	2	6	857381	857386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134597
19184	NC_017167	CCG	2	6	857459	857464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134597
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19222	NC_017167	ATG	2	6	859214	859219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134598
19223	NC_017167	TTC	2	6	859220	859225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134598
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19225	NC_017167	CGAG	2	8	859275	859282	25 %	0 %	50 %	25 %	384134598
19226	NC_017167	TCGT	2	8	859400	859407	0 %	50 %	25 %	25 %	384134598
19227	NC_017167	CAT	2	6	859432	859437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134598
19228	NC_017167	CGG	2	6	859438	859443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134598
19229	NC_017167	ACG	2	6	859491	859496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134598
19230	NC_017167	GTGC	2	8	859507	859514	0 %	25 %	50 %	25 %	384134598
19231	NC_017167	GC	3	6	859534	859539	0 %	0 %	50 %	50 %	384134598
19232	NC_017167	AGG	2	6	859548	859553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134598
19233	NC_017167	GC	4	8	859558	859565	0 %	0 %	50 %	50 %	384134598
19234	NC_017167	ACA	2	6	859617	859622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134598
19235	NC_017167	GACG	2	8	859645	859652	25 %	0 %	50 %	25 %	384134598
19236	NC_017167	GGT	2	6	859726	859731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134598
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