MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_017167	TTTA	2	8	806199	806206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18002	NC_017167	ATC	2	6	806213	806218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18003	NC_017167	GAT	2	6	806220	806225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134545
18004	NC_017167	GCG	2	6	806277	806282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134545
18005	NC_017167	TTTC	2	8	806302	806309	0 %	75 %	0 %	25 %	384134545
18006	NC_017167	TGG	2	6	806351	806356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134545
18007	NC_017167	GAGGTC	2	12	806362	806373	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384134545
18008	NC_017167	CGC	2	6	806391	806396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134545
18009	NC_017167	CCGG	2	8	806439	806446	0 %	0 %	50 %	50 %	384134545
18010	NC_017167	CCT	2	6	806634	806639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134545
18011	NC_017167	ACG	2	6	806672	806677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134545
18012	NC_017167	CGGC	2	8	806693	806700	0 %	0 %	50 %	50 %	384134545
18013	NC_017167	TGC	2	6	806786	806791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134545
18014	NC_017167	GGC	2	6	806832	806837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134545
18015	NC_017167	CGA	2	6	806922	806927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134545
18016	NC_017167	GC	3	6	806942	806947	0 %	0 %	50 %	50 %	384134545
18017	NC_017167	CGC	2	6	806950	806955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134545
18018	NC_017167	CGTCGA	2	12	806985	806996	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384134545
18019	NC_017167	CTA	2	6	807084	807089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134545
18020	NC_017167	GAT	2	6	807142	807147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134545
18021	NC_017167	CGG	2	6	807170	807175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134545
18022	NC_017167	CGG	2	6	807195	807200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134545
18023	NC_017167	AGGGC	2	10	807327	807336	20 %	0 %	60 %	20 %	384134545
18024	NC_017167	GTC	2	6	807388	807393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134545
18025	NC_017167	GGA	2	6	807423	807428	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134545
18026	NC_017167	TGG	2	6	807479	807484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134545
18027	NC_017167	CGAC	2	8	807515	807522	25 %	0 %	25 %	50 %	384134545
18028	NC_017167	GCA	2	6	807533	807538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134545
18029	NC_017167	ACG	2	6	807670	807675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134546
18030	NC_017167	GGA	2	6	807710	807715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134546
18031	NC_017167	GGC	2	6	807728	807733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134546
18032	NC_017167	GATC	2	8	807785	807792	25 %	25 %	25 %	25 %	384134546
18033	NC_017167	ACAAG	2	10	807797	807806	60 %	0 %	20 %	20 %	384134546
18034	NC_017167	GC	3	6	807836	807841	0 %	0 %	50 %	50 %	384134546
18035	NC_017167	GAG	2	6	807879	807884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134546
18036	NC_017167	CA	3	6	807953	807958	50 %	0 %	0 %	50 %	384134546
18037	NC_017167	TCG	2	6	807961	807966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134546
18038	NC_017167	AC	3	6	807977	807982	50 %	0 %	0 %	50 %	384134546
18039	NC_017167	TTTCT	2	10	807986	807995	0 %	80 %	0 %	20 %	384134546
18040	NC_017167	AG	4	8	808115	808122	50 %	0 %	50 %	0 %	384134546
18041	NC_017167	ATC	2	6	808161	808166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134546
18042	NC_017167	CGA	2	6	808268	808273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134546
18043	NC_017167	CG	4	8	808383	808390	0 %	0 %	50 %	50 %	384134546
18044	NC_017167	GGA	2	6	808439	808444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134546
18045	NC_017167	TAT	2	6	808536	808541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18046	NC_017167	GAG	2	6	808542	808547	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18047	NC_017167	GGT	2	6	808605	808610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134547
18048	NC_017167	CTC	2	6	808630	808635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134547
18049	NC_017167	TCGC	2	8	808729	808736	0 %	25 %	25 %	50 %	384134547
18050	NC_017167	GCT	2	6	808764	808769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134547
18051	NC_017167	CT	3	6	808800	808805	0 %	50 %	0 %	50 %	384134547
18052	NC_017167	AGCG	2	8	808826	808833	25 %	0 %	50 %	25 %	384134547
18053	NC_017167	CGG	2	6	808841	808846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134547
18054	NC_017167	TGG	2	6	808847	808852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134547
18055	NC_017167	TCC	2	6	808934	808939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134547
18056	NC_017167	CGT	2	6	808968	808973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134547
18057	NC_017167	CGG	3	9	809043	809051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134547
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18059	NC_017167	CCCGG	2	10	809113	809122	0 %	0 %	40 %	60 %	384134547
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18061	NC_017167	CTCG	2	8	809199	809206	0 %	25 %	25 %	50 %	384134547
18062	NC_017167	GCA	2	6	809223	809228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134547
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18064	NC_017167	GGC	2	6	809329	809334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134547
18065	NC_017167	T	6	6	809373	809378	0 %	100 %	0 %	0 %	384134547
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18067	NC_017167	TCG	2	6	809438	809443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134547
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18069	NC_017167	GTC	2	6	809482	809487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134547
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18071	NC_017167	GGC	2	6	809722	809727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134547
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18074	NC_017167	GGC	2	6	809802	809807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134547
18075	NC_017167	G	6	6	809852	809857	0 %	0 %	100 %	0 %	384134547
18076	NC_017167	GAGT	2	8	809864	809871	25 %	25 %	50 %	0 %	384134547
18077	NC_017167	GGA	2	6	809884	809889	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18078	NC_017167	TGAA	2	8	809894	809901	50 %	25 %	25 %	0 %	384134548
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18085	NC_017167	ACA	2	6	810231	810236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134548
18086	NC_017167	CGT	2	6	810319	810324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134548
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18088	NC_017167	GGC	2	6	810388	810393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134548
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18092	NC_017167	CCG	2	6	810482	810487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134548
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18100	NC_017167	CGGT	2	8	810713	810720	0 %	25 %	50 %	25 %	384134548
18101	NC_017167	TGG	2	6	810765	810770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134548
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18104	NC_017167	GCC	2	6	810964	810969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134548
18105	NC_017167	CCTG	2	8	811012	811019	0 %	25 %	25 %	50 %	384134548
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18114	NC_017167	GCTC	2	8	811516	811523	0 %	25 %	25 %	50 %	384134549
18115	NC_017167	TCA	2	6	811588	811593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134549
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18118	NC_017167	CGG	2	6	811696	811701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134549
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18120	NC_017167	CTT	2	6	811807	811812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134549
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18230	NC_017167	TCG	2	6	816496	816501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134554
18231	NC_017167	GCG	2	6	816612	816617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18237	NC_017167	CAT	2	6	816808	816813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134555
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18472	NC_017167	TCG	2	6	827231	827236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18473	NC_017167	GCG	2	6	827242	827247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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18476	NC_017167	AGG	2	6	827307	827312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18477	NC_017167	GCCGAG	2	12	827325	827336	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384134566
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18482	NC_017167	TCT	2	6	827514	827519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134566
18483	NC_017167	GC	4	8	827580	827587	0 %	0 %	50 %	50 %	384134566
18484	NC_017167	GTG	2	6	827596	827601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134566
18485	NC_017167	CT	3	6	827648	827653	0 %	50 %	0 %	50 %	384134566
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18487	NC_017167	CAA	2	6	827961	827966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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