MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_017167	GCG	2	6	720180	720185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134473
16003	NC_017167	GCG	2	6	720192	720197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134473
16004	NC_017167	CGT	2	6	720212	720217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134473
16005	NC_017167	AGG	2	6	720231	720236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134473
16006	NC_017167	CG	4	8	720280	720287	0 %	0 %	50 %	50 %	384134473
16007	NC_017167	CG	3	6	720306	720311	0 %	0 %	50 %	50 %	384134473
16008	NC_017167	GC	4	8	720359	720366	0 %	0 %	50 %	50 %	384134473
16009	NC_017167	CGA	2	6	720374	720379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134473
16010	NC_017167	TCG	2	6	720409	720414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134473
16011	NC_017167	GC	3	6	720447	720452	0 %	0 %	50 %	50 %	384134473
16012	NC_017167	TTC	2	6	720460	720465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134473
16013	NC_017167	CG	4	8	720503	720510	0 %	0 %	50 %	50 %	384134473
16014	NC_017167	CA	3	6	720590	720595	50 %	0 %	0 %	50 %	384134473
16015	NC_017167	TCGG	2	8	720781	720788	0 %	25 %	50 %	25 %	384134473
16016	NC_017167	GC	3	6	720806	720811	0 %	0 %	50 %	50 %	384134473
16017	NC_017167	CAC	2	6	720845	720850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134473
16018	NC_017167	GCAC	2	8	720889	720896	25 %	0 %	25 %	50 %	384134473
16019	NC_017167	GCG	2	6	720913	720918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134473
16020	NC_017167	CGG	2	6	720925	720930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134473
16021	NC_017167	CTA	2	6	720968	720973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134473
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16023	NC_017167	TGG	2	6	721090	721095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134473
16024	NC_017167	TTTC	2	8	721143	721150	0 %	75 %	0 %	25 %	384134473
16025	NC_017167	CG	3	6	721244	721249	0 %	0 %	50 %	50 %	384134473
16026	NC_017167	CGG	2	6	721255	721260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134473
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16030	NC_017167	CG	3	6	721293	721298	0 %	0 %	50 %	50 %	384134474
16031	NC_017167	CG	3	6	721300	721305	0 %	0 %	50 %	50 %	384134474
16032	NC_017167	CGGA	2	8	721354	721361	25 %	0 %	50 %	25 %	384134474
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16041	NC_017167	GCC	2	6	721738	721743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134474
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16046	NC_017167	GGC	2	6	722037	722042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134474
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16053	NC_017167	CG	3	6	722423	722428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16054	NC_017167	CG	4	8	722433	722440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16055	NC_017167	GCG	2	6	722450	722455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16056	NC_017167	GGGGC	2	10	722460	722469	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
16057	NC_017167	TCA	2	6	722491	722496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16058	NC_017167	GCA	2	6	722502	722507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16062	NC_017167	G	6	6	722685	722690	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16063	NC_017167	CG	3	6	722748	722753	0 %	0 %	50 %	50 %	384134475
16064	NC_017167	AGCG	2	8	722757	722764	25 %	0 %	50 %	25 %	384134475
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16069	NC_017167	CGGC	2	8	723064	723071	0 %	0 %	50 %	50 %	384134475
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16083	NC_017167	CG	4	8	723580	723587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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16089	NC_017167	CATCA	2	10	723745	723754	40 %	20 %	0 %	40 %	384134476
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16107	NC_017167	CG	3	6	724423	724428	0 %	0 %	50 %	50 %	384134476
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16114	NC_017167	GGCG	2	8	724737	724744	0 %	0 %	75 %	25 %	384134476
16115	NC_017167	GCG	3	9	724775	724783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134476
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16123	NC_017167	TG	3	6	725235	725240	0 %	50 %	50 %	0 %	384134477
16124	NC_017167	TCG	2	6	725252	725257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134477
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16129	NC_017167	CG	3	6	725432	725437	0 %	0 %	50 %	50 %	384134477
16130	NC_017167	CGG	2	6	725491	725496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134477
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