MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_017167	TGC	2	6	674620	674625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134433
15003	NC_017167	ACG	2	6	674650	674655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134433
15004	NC_017167	GGGC	2	8	674693	674700	0 %	0 %	75 %	25 %	384134433
15005	NC_017167	GTCC	2	8	674738	674745	0 %	25 %	25 %	50 %	384134433
15006	NC_017167	GTC	2	6	674784	674789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134433
15007	NC_017167	CGC	2	6	674795	674800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134433
15008	NC_017167	CTC	2	6	674835	674840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134433
15009	NC_017167	GCT	2	6	674849	674854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134433
15010	NC_017167	CTCG	2	8	674873	674880	0 %	25 %	25 %	50 %	384134433
15011	NC_017167	CG	4	8	674907	674914	0 %	0 %	50 %	50 %	384134433
15012	NC_017167	GCC	2	6	675000	675005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134433
15013	NC_017167	TCG	2	6	675037	675042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134433
15014	NC_017167	CG	3	6	675050	675055	0 %	0 %	50 %	50 %	384134433
15015	NC_017167	G	6	6	675065	675070	0 %	0 %	100 %	0 %	384134433
15016	NC_017167	TGC	2	6	675098	675103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134433
15017	NC_017167	TCA	2	6	675112	675117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134433
15018	NC_017167	G	6	6	675140	675145	0 %	0 %	100 %	0 %	384134433
15019	NC_017167	CGCT	2	8	675147	675154	0 %	25 %	25 %	50 %	384134433
15020	NC_017167	CCG	2	6	675190	675195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134433
15021	NC_017167	GC	4	8	675288	675295	0 %	0 %	50 %	50 %	384134433
15022	NC_017167	ATG	2	6	675339	675344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134433
15023	NC_017167	GC	3	6	675438	675443	0 %	0 %	50 %	50 %	384134433
15024	NC_017167	TCT	2	6	675464	675469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134433
15025	NC_017167	TCT	2	6	675514	675519	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134433
15026	NC_017167	CTGGT	2	10	675556	675565	0 %	40 %	40 %	20 %	384134433
15027	NC_017167	CA	3	6	675599	675604	50 %	0 %	0 %	50 %	384134433
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15034	NC_017167	AC	3	6	675948	675953	50 %	0 %	0 %	50 %	384134434
15035	NC_017167	CGC	2	6	675955	675960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134434
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15038	NC_017167	CGT	2	6	676126	676131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134434
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15040	NC_017167	GAG	2	6	676157	676162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134434
15041	NC_017167	CCG	2	6	676334	676339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15042	NC_017167	TGA	2	6	676393	676398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_017167	ACA	2	6	676430	676435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15044	NC_017167	GGA	2	6	676588	676593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134435
15045	NC_017167	GTC	2	6	676640	676645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134435
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15048	NC_017167	TTC	2	6	676881	676886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134435
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15053	NC_017167	TCG	2	6	677277	677282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134435
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15059	NC_017167	CCAT	2	8	677528	677535	25 %	25 %	0 %	50 %	384134435
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15099	NC_017167	CG	3	6	679296	679301	0 %	0 %	50 %	50 %	384134436
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15107	NC_017167	TGG	2	6	679622	679627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134436
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15114	NC_017167	GAG	2	6	679873	679878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134436
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15118	NC_017167	CGC	3	9	680016	680024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134436
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15362	NC_017167	TGT	2	6	692095	692100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15363	NC_017167	AC	5	10	692104	692113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15364	NC_017167	CCTA	2	8	692114	692121	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
15365	NC_017167	TGA	2	6	692146	692151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15491	NC_017167	CGT	2	6	698460	698465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134454
15492	NC_017167	GGC	2	6	698466	698471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134454
15493	NC_017167	TCG	2	6	698498	698503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134454
15494	NC_017167	ACCG	2	8	698555	698562	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15495	NC_017167	TGC	2	6	698564	698569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134455
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15499	NC_017167	CTG	2	6	698632	698637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134455
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