MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_017167	GGCG	2	8	630207	630214	0 %	0 %	75 %	25 %	384134383
14002	NC_017167	CTG	2	6	630229	630234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134383
14003	NC_017167	CGA	2	6	630242	630247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134383
14004	NC_017167	CGG	2	6	630268	630273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134383
14005	NC_017167	CGGC	2	8	630309	630316	0 %	0 %	50 %	50 %	384134383
14006	NC_017167	GGA	2	6	630345	630350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134383
14007	NC_017167	GGC	2	6	630388	630393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134383
14008	NC_017167	GAAG	2	8	630480	630487	50 %	0 %	50 %	0 %	384134383
14009	NC_017167	GAC	2	6	630562	630567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134383
14010	NC_017167	CAT	2	6	630579	630584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134383
14011	NC_017167	TCG	2	6	630604	630609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134383
14012	NC_017167	TCG	2	6	630644	630649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134383
14013	NC_017167	GAC	2	6	630664	630669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134383
14014	NC_017167	AG	3	6	630678	630683	50 %	0 %	50 %	0 %	384134383
14015	NC_017167	G	6	6	630683	630688	0 %	0 %	100 %	0 %	384134383
14016	NC_017167	TGT	2	6	630772	630777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134384
14017	NC_017167	CCT	2	6	630794	630799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134384
14018	NC_017167	CGGC	2	8	630815	630822	0 %	0 %	50 %	50 %	384134384
14019	NC_017167	CGT	2	6	630884	630889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134384
14020	NC_017167	GAC	2	6	630992	630997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134384
14021	NC_017167	GTG	3	9	631014	631022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134384
14022	NC_017167	CGCCAT	3	18	631025	631042	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384134384
14023	NC_017167	GCCG	2	8	631082	631089	0 %	0 %	50 %	50 %	384134384
14024	NC_017167	TGCGG	2	10	631104	631113	0 %	20 %	60 %	20 %	384134384
14025	NC_017167	GC	3	6	631126	631131	0 %	0 %	50 %	50 %	384134384
14026	NC_017167	GGT	2	6	631170	631175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134384
14027	NC_017167	GCGG	2	8	631227	631234	0 %	0 %	75 %	25 %	384134384
14028	NC_017167	CCG	2	6	631260	631265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134384
14029	NC_017167	TC	3	6	631323	631328	0 %	50 %	0 %	50 %	384134384
14030	NC_017167	TTC	2	6	631366	631371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134384
14031	NC_017167	GGC	2	6	631400	631405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134384
14032	NC_017167	GTTC	2	8	631431	631438	0 %	50 %	25 %	25 %	384134384
14033	NC_017167	CCG	2	6	631499	631504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134385
14034	NC_017167	GAT	2	6	631520	631525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134385
14035	NC_017167	CTT	3	9	631526	631534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134385
14036	NC_017167	TTG	2	6	631562	631567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134385
14037	NC_017167	GGC	2	6	631588	631593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134385
14038	NC_017167	GCC	2	6	631610	631615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134386
14039	NC_017167	CGT	2	6	631630	631635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134386
14040	NC_017167	CGC	2	6	631647	631652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134386
14041	NC_017167	TTC	2	6	631679	631684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134386
14042	NC_017167	TCC	2	6	631698	631703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134386
14043	NC_017167	GCC	2	6	631715	631720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134386
14044	NC_017167	GC	3	6	631827	631832	0 %	0 %	50 %	50 %	384134386
14045	NC_017167	CAT	2	6	631853	631858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134386
14046	NC_017167	CGG	2	6	631906	631911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134386
14047	NC_017167	ATG	2	6	631928	631933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134386
14048	NC_017167	GCG	2	6	631943	631948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134386
14049	NC_017167	CG	3	6	631963	631968	0 %	0 %	50 %	50 %	384134386
14050	NC_017167	GGC	2	6	631975	631980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134386
14051	NC_017167	GC	3	6	632021	632026	0 %	0 %	50 %	50 %	384134386
14052	NC_017167	CCA	2	6	632056	632061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134386
14053	NC_017167	TCA	2	6	632070	632075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134386
14054	NC_017167	GC	3	6	632132	632137	0 %	0 %	50 %	50 %	384134386
14055	NC_017167	CG	3	6	632168	632173	0 %	0 %	50 %	50 %	384134386
14056	NC_017167	GC	3	6	632188	632193	0 %	0 %	50 %	50 %	384134386
14057	NC_017167	GC	3	6	632209	632214	0 %	0 %	50 %	50 %	384134386
14058	NC_017167	GC	3	6	632236	632241	0 %	0 %	50 %	50 %	384134386
14059	NC_017167	GAA	2	6	632246	632251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134386
14060	NC_017167	AACG	2	8	632353	632360	50 %	0 %	25 %	25 %	384134386
14061	NC_017167	GCG	2	6	632373	632378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134386
14062	NC_017167	GTG	2	6	632420	632425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134386
14063	NC_017167	GAC	2	6	632438	632443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134386
14064	NC_017167	CGA	2	6	632466	632471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134386
14065	NC_017167	GCG	2	6	632481	632486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134386
14066	NC_017167	GC	3	6	632506	632511	0 %	0 %	50 %	50 %	384134386
14067	NC_017167	GCGA	2	8	632538	632545	25 %	0 %	50 %	25 %	384134386
14068	NC_017167	GGGAC	2	10	632548	632557	20 %	0 %	60 %	20 %	384134386
14069	NC_017167	CGA	2	6	632567	632572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134386
14070	NC_017167	GTG	2	6	632609	632614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134386
14071	NC_017167	GGA	2	6	632676	632681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14072	NC_017167	CTC	2	6	632713	632718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134387
14073	NC_017167	GAG	2	6	632764	632769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134387
14074	NC_017167	CGC	2	6	632847	632852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134387
14075	NC_017167	GC	3	6	632854	632859	0 %	0 %	50 %	50 %	384134387
14076	NC_017167	CAC	2	6	632898	632903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134387
14077	NC_017167	CG	3	6	632907	632912	0 %	0 %	50 %	50 %	384134387
14078	NC_017167	GC	3	6	632928	632933	0 %	0 %	50 %	50 %	384134387
14079	NC_017167	AGC	2	6	632981	632986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134387
14080	NC_017167	CAT	2	6	633006	633011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134387
14081	NC_017167	TGA	2	6	633041	633046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134387
14082	NC_017167	GGC	2	6	633048	633053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134387
14083	NC_017167	GC	3	6	633079	633084	0 %	0 %	50 %	50 %	384134387
14084	NC_017167	TGC	2	6	633095	633100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134387
14085	NC_017167	CAC	2	6	633120	633125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134387
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14087	NC_017167	GAC	2	6	633238	633243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134387
14088	NC_017167	GCC	2	6	633262	633267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14089	NC_017167	ACC	2	6	633304	633309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134388
14090	NC_017167	GGGGA	2	10	633312	633321	20 %	0 %	80 %	0 %	384134388
14091	NC_017167	GT	3	6	633465	633470	0 %	50 %	50 %	0 %	384134388
14092	NC_017167	GTC	2	6	633478	633483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134388
14093	NC_017167	CGA	2	6	633516	633521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134388
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14097	NC_017167	GAG	2	6	633583	633588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134388
14098	NC_017167	GCT	3	9	633648	633656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134388
14099	NC_017167	AGG	2	6	633659	633664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134388
14100	NC_017167	CACGC	2	10	633694	633703	20 %	0 %	20 %	60 %	384134388
14101	NC_017167	TGG	2	6	633722	633727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134388
14102	NC_017167	GC	3	6	633779	633784	0 %	0 %	50 %	50 %	384134388
14103	NC_017167	GTC	2	6	633844	633849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134388
14104	NC_017167	ACG	2	6	633956	633961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134388
14105	NC_017167	ACG	2	6	633983	633988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134388
14106	NC_017167	CGG	2	6	634001	634006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134388
14107	NC_017167	TGA	2	6	634013	634018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134388
14108	NC_017167	CGCGC	2	10	634030	634039	0 %	0 %	40 %	60 %	384134388
14109	NC_017167	GC	3	6	634125	634130	0 %	0 %	50 %	50 %	384134389
14110	NC_017167	TGT	2	6	634140	634145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134389
14111	NC_017167	ACG	2	6	634146	634151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134389
14112	NC_017167	GAA	2	6	634207	634212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134389
14113	NC_017167	TGCG	2	8	634349	634356	0 %	25 %	50 %	25 %	384134389
14114	NC_017167	CG	3	6	634404	634409	0 %	0 %	50 %	50 %	384134389
14115	NC_017167	GCC	2	6	634418	634423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134389
14116	NC_017167	TCA	2	6	634446	634451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134389
14117	NC_017167	TTC	2	6	634499	634504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134389
14118	NC_017167	TGG	2	6	634560	634565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134389
14119	NC_017167	GC	3	6	634587	634592	0 %	0 %	50 %	50 %	384134389
14120	NC_017167	CGT	2	6	634708	634713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134389
14121	NC_017167	GC	3	6	634762	634767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14122	NC_017167	CGC	2	6	634854	634859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14123	NC_017167	AGG	2	6	634863	634868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14125	NC_017167	GC	3	6	634950	634955	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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14358	NC_017167	CG	3	6	645328	645333	0 %	0 %	50 %	50 %	384134400
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14361	NC_017167	CG	3	6	645502	645507	0 %	0 %	50 %	50 %	384134400
14362	NC_017167	TCC	2	6	645518	645523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134400
14363	NC_017167	CG	3	6	645525	645530	0 %	0 %	50 %	50 %	384134400
14364	NC_017167	CG	3	6	645545	645550	0 %	0 %	50 %	50 %	384134400
14365	NC_017167	GCAGG	2	10	645574	645583	20 %	0 %	60 %	20 %	384134400
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14372	NC_017167	CGGG	2	8	645900	645907	0 %	0 %	75 %	25 %	384134400
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14393	NC_017167	TGA	2	6	646528	646533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134401
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14429	NC_017167	GTTC	2	8	647959	647966	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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