MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_017167	TGT	2	6	608280	608285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134359
13502	NC_017167	TGG	2	6	608304	608309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134359
13503	NC_017167	AGG	2	6	608346	608351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134359
13504	NC_017167	TGGC	2	8	608358	608365	0 %	25 %	50 %	25 %	384134359
13505	NC_017167	CG	4	8	608369	608376	0 %	0 %	50 %	50 %	384134359
13506	NC_017167	GCT	2	6	608548	608553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134360
13507	NC_017167	GCT	2	6	608556	608561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134360
13508	NC_017167	CG	3	6	608578	608583	0 %	0 %	50 %	50 %	384134360
13509	NC_017167	TC	3	6	608761	608766	0 %	50 %	0 %	50 %	384134361
13510	NC_017167	A	6	6	608878	608883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13511	NC_017167	GTC	2	6	608920	608925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134362
13512	NC_017167	GACG	2	8	608943	608950	25 %	0 %	50 %	25 %	384134362
13513	NC_017167	GGT	2	6	609043	609048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134362
13514	NC_017167	TCA	2	6	609090	609095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134362
13515	NC_017167	CT	3	6	609136	609141	0 %	50 %	0 %	50 %	384134362
13516	NC_017167	GGT	2	6	609181	609186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134362
13517	NC_017167	CGC	2	6	609267	609272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134362
13518	NC_017167	GAG	3	9	609364	609372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134362
13519	NC_017167	GAC	2	6	609388	609393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134362
13520	NC_017167	GC	3	6	609434	609439	0 %	0 %	50 %	50 %	384134362
13521	NC_017167	TGTT	2	8	609625	609632	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_017167	GCGTG	2	10	609658	609667	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13523	NC_017167	GGT	2	6	609726	609731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13524	NC_017167	GCG	2	6	609776	609781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13525	NC_017167	ACA	2	6	609790	609795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13526	NC_017167	ATCC	2	8	609826	609833	25 %	25 %	0 %	50 %	384134363
13527	NC_017167	GGCAGC	2	12	609850	609861	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384134363
13528	NC_017167	AAC	2	6	609902	609907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134363
13529	NC_017167	GTG	2	6	609918	609923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134363
13530	NC_017167	GTC	2	6	610006	610011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134363
13531	NC_017167	GGC	2	6	610018	610023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134363
13532	NC_017167	GTC	2	6	610036	610041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134363
13533	NC_017167	GGC	2	6	610085	610090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134363
13534	NC_017167	GC	3	6	610089	610094	0 %	0 %	50 %	50 %	384134363
13535	NC_017167	AAG	2	6	610166	610171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134363
13536	NC_017167	CAG	2	6	610181	610186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134363
13537	NC_017167	GCA	2	6	610200	610205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134363
13538	NC_017167	GGT	2	6	610282	610287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134363
13539	NC_017167	CTCGG	2	10	610493	610502	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13540	NC_017167	AGC	2	6	610561	610566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13541	NC_017167	GGGA	2	8	610600	610607	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_017167	TCG	2	6	610723	610728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134364
13543	NC_017167	CGG	3	9	610736	610744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134364
13544	NC_017167	TCG	2	6	610762	610767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134364
13545	NC_017167	CGG	2	6	610872	610877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134364
13546	NC_017167	CTT	2	6	610886	610891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134364
13547	NC_017167	GGC	2	6	610907	610912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134364
13548	NC_017167	ACC	2	6	610965	610970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134364
13549	NC_017167	GGGC	2	8	611000	611007	0 %	0 %	75 %	25 %	384134364
13550	NC_017167	GGGCTC	2	12	611097	611108	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384134364
13551	NC_017167	GAA	2	6	611124	611129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134364
13552	NC_017167	CTG	2	6	611133	611138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134364
13553	NC_017167	TCG	2	6	611146	611151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134364
13554	NC_017167	CGTT	2	8	611171	611178	0 %	50 %	25 %	25 %	384134364
13555	NC_017167	GGA	2	6	611210	611215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134364
13556	NC_017167	ACG	2	6	611220	611225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134364
13557	NC_017167	GC	3	6	611272	611277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13558	NC_017167	AGA	2	6	611278	611283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13559	NC_017167	GCC	2	6	611373	611378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13560	NC_017167	CG	4	8	611438	611445	0 %	0 %	50 %	50 %	384134365
13561	NC_017167	GGA	2	6	611574	611579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134365
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13563	NC_017167	GC	4	8	611640	611647	0 %	0 %	50 %	50 %	384134365
13564	NC_017167	GTC	2	6	611682	611687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134365
13565	NC_017167	ACG	2	6	611705	611710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134365
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13570	NC_017167	TCG	2	6	612042	612047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134366
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13572	NC_017167	CGGA	2	8	612177	612184	25 %	0 %	50 %	25 %	384134366
13573	NC_017167	CGC	2	6	612195	612200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134366
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13580	NC_017167	CGA	2	6	612505	612510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134366
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13582	NC_017167	TGC	2	6	612540	612545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134366
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13584	NC_017167	GTC	2	6	612563	612568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134366
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13587	NC_017167	CTG	2	6	612668	612673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134366
13588	NC_017167	CG	3	6	612751	612756	0 %	0 %	50 %	50 %	384134366
13589	NC_017167	TC	3	6	612761	612766	0 %	50 %	0 %	50 %	384134366
13590	NC_017167	CGGA	2	8	612774	612781	25 %	0 %	50 %	25 %	384134366
13591	NC_017167	TAC	2	6	612834	612839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13592	NC_017167	ATCT	2	8	612842	612849	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13593	NC_017167	CGC	2	6	612914	612919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134367
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13595	NC_017167	GAC	2	6	613039	613044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134367
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13597	NC_017167	GC	3	6	613097	613102	0 %	0 %	50 %	50 %	384134367
13598	NC_017167	CGA	2	6	613128	613133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134367
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13601	NC_017167	CGA	2	6	613335	613340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134367
13602	NC_017167	GCGG	2	8	613350	613357	0 %	0 %	75 %	25 %	384134367
13603	NC_017167	TCG	2	6	613358	613363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134367
13604	NC_017167	CATT	2	8	613413	613420	25 %	50 %	0 %	25 %	384134367
13605	NC_017167	TCA	2	6	613464	613469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134367
13606	NC_017167	CGG	2	6	613508	613513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134367
13607	NC_017167	CG	3	6	613608	613613	0 %	0 %	50 %	50 %	384134367
13608	NC_017167	GTCGA	2	10	613657	613666	20 %	20 %	40 %	20 %	384134367
13609	NC_017167	TCG	2	6	613679	613684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134367
13610	NC_017167	CG	3	6	613683	613688	0 %	0 %	50 %	50 %	384134367
13611	NC_017167	GC	3	6	613738	613743	0 %	0 %	50 %	50 %	384134367
13612	NC_017167	ATT	2	6	613826	613831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384134367
13613	NC_017167	AGGA	2	8	613839	613846	50 %	0 %	50 %	0 %	384134367
13614	NC_017167	CCG	2	6	613877	613882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134367
13615	NC_017167	CGT	2	6	613911	613916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134367
13616	NC_017167	CG	3	6	613922	613927	0 %	0 %	50 %	50 %	384134367
13617	NC_017167	TGG	2	6	613952	613957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134367
13618	NC_017167	GCG	2	6	613979	613984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134367
13619	NC_017167	CCGTGC	2	12	613994	614005	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384134367
13620	NC_017167	GAA	2	6	614023	614028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134367
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13983	NC_017167	CG	3	6	629419	629424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13984	NC_017167	CTC	2	6	629445	629450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134382
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13986	NC_017167	AGG	2	6	629521	629526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134382
13987	NC_017167	TCC	2	6	629533	629538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134382
13988	NC_017167	TCG	3	9	629539	629547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134382
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13990	NC_017167	CCG	2	6	629694	629699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13991	NC_017167	GGC	2	6	629778	629783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134383
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