MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017167	GGGC	2	8	561719	561726	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12502	NC_017167	CAT	2	6	561754	561759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134317
12503	NC_017167	CTG	2	6	561760	561765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134317
12504	NC_017167	CGC	3	9	561890	561898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134317
12505	NC_017167	TCA	2	6	561936	561941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134317
12506	NC_017167	AGCC	2	8	561952	561959	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12507	NC_017167	CGG	2	6	561989	561994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12508	NC_017167	AGG	2	6	562020	562025	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_017167	GCAC	2	8	562043	562050	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12510	NC_017167	GAA	2	6	562057	562062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_017167	CA	3	6	562077	562082	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12512	NC_017167	CAG	2	6	562177	562182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134318
12513	NC_017167	TAC	2	6	562207	562212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134318
12514	NC_017167	CGC	2	6	562238	562243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134318
12515	NC_017167	CCG	2	6	562305	562310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134318
12516	NC_017167	CG	4	8	562309	562316	0 %	0 %	50 %	50 %	384134318
12517	NC_017167	GGT	2	6	562338	562343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134318
12518	NC_017167	CGG	2	6	562356	562361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134318
12519	NC_017167	GGA	2	6	562371	562376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134318
12520	NC_017167	GAG	2	6	562510	562515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134318
12521	NC_017167	GTT	2	6	562649	562654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134318
12522	NC_017167	GCG	2	6	562681	562686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134318
12523	NC_017167	GC	3	6	562690	562695	0 %	0 %	50 %	50 %	384134318
12524	NC_017167	CGC	2	6	562738	562743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134318
12525	NC_017167	TGG	2	6	562754	562759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134318
12526	NC_017167	CG	3	6	562772	562777	0 %	0 %	50 %	50 %	384134318
12527	NC_017167	GCG	2	6	562797	562802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134318
12528	NC_017167	GAGG	2	8	562807	562814	25 %	0 %	75 %	0 %	384134318
12529	NC_017167	TGCC	2	8	562838	562845	0 %	25 %	25 %	50 %	384134318
12530	NC_017167	CGA	2	6	562854	562859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134318
12531	NC_017167	TCG	2	6	562861	562866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134318
12532	NC_017167	CA	3	6	562922	562927	50 %	0 %	0 %	50 %	384134318
12533	NC_017167	GGT	2	6	562956	562961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134318
12534	NC_017167	TGGAC	2	10	563003	563012	20 %	20 %	40 %	20 %	384134318
12535	NC_017167	GTGG	2	8	563091	563098	0 %	25 %	75 %	0 %	384134318
12536	NC_017167	GAG	2	6	563104	563109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134318
12537	NC_017167	TG	3	6	563121	563126	0 %	50 %	50 %	0 %	384134318
12538	NC_017167	AACAGG	2	12	563195	563206	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384134318
12539	NC_017167	GGT	2	6	563220	563225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_017167	GCA	2	6	563234	563239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134319
12541	NC_017167	GT	3	6	563275	563280	0 %	50 %	50 %	0 %	384134319
12542	NC_017167	CTCG	2	8	563297	563304	0 %	25 %	25 %	50 %	384134319
12543	NC_017167	GGCCGG	2	12	563309	563320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134319
12544	NC_017167	TGG	2	6	563326	563331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134319
12545	NC_017167	GAT	2	6	563384	563389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134319
12546	NC_017167	AC	3	6	563413	563418	50 %	0 %	0 %	50 %	384134319
12547	NC_017167	GTTCAC	2	12	563441	563452	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384134319
12548	NC_017167	CGG	2	6	563542	563547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134319
12549	NC_017167	TGG	2	6	563557	563562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134319
12550	NC_017167	CGG	2	6	563606	563611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134319
12551	NC_017167	TGA	2	6	563617	563622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134319
12552	NC_017167	GCT	2	6	563636	563641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134319
12553	NC_017167	TGG	2	6	563653	563658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134319
12554	NC_017167	GCA	2	6	563682	563687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134319
12555	NC_017167	AGC	2	6	563776	563781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134319
12556	NC_017167	TCA	2	6	563818	563823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134319
12557	NC_017167	CCTGTT	2	12	563825	563836	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384134319
12558	NC_017167	GCG	2	6	563863	563868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134319
12559	NC_017167	GCG	2	6	563886	563891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12560	NC_017167	T	7	7	563921	563927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_017167	GCTGG	2	10	563932	563941	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12562	NC_017167	GGC	2	6	564015	564020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12563	NC_017167	AGG	2	6	564041	564046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_017167	AAG	2	6	564246	564251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134320
12565	NC_017167	TTC	2	6	564268	564273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134320
12566	NC_017167	GCCG	2	8	564302	564309	0 %	0 %	50 %	50 %	384134320
12567	NC_017167	ACGGA	2	10	564351	564360	40 %	0 %	40 %	20 %	384134320
12568	NC_017167	GAA	2	6	564387	564392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134320
12569	NC_017167	GGT	2	6	564560	564565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134320
12570	NC_017167	GCT	2	6	564571	564576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134320
12571	NC_017167	CGC	2	6	564603	564608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134320
12572	NC_017167	CTG	2	6	564654	564659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134320
12573	NC_017167	GC	3	6	564707	564712	0 %	0 %	50 %	50 %	384134320
12574	NC_017167	ACG	2	6	564763	564768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134320
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12577	NC_017167	ACG	2	6	565075	565080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134320
12578	NC_017167	TCG	2	6	565120	565125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134320
12579	NC_017167	GGT	2	6	565127	565132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134320
12580	NC_017167	GAA	2	6	565226	565231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134320
12581	NC_017167	GGC	2	6	565250	565255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134320
12582	NC_017167	CGG	2	6	565273	565278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134320
12583	NC_017167	CGCC	2	8	565307	565314	0 %	0 %	25 %	75 %	384134320
12584	NC_017167	CACCGG	2	12	565427	565438	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384134320
12585	NC_017167	CGC	2	6	565444	565449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134320
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12587	NC_017167	TCGT	2	8	565464	565471	0 %	50 %	25 %	25 %	384134320
12588	NC_017167	ACC	2	6	565476	565481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134320
12589	NC_017167	GCG	2	6	565492	565497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134320
12590	NC_017167	CG	3	6	565597	565602	0 %	0 %	50 %	50 %	384134320
12591	NC_017167	CGG	2	6	565640	565645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134320
12592	NC_017167	CTG	2	6	565668	565673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134320
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12598	NC_017167	CG	3	6	565922	565927	0 %	0 %	50 %	50 %	384134320
12599	NC_017167	CGT	2	6	565990	565995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134320
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12601	NC_017167	CGG	2	6	566062	566067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134320
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12603	NC_017167	AGG	2	6	566113	566118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134320
12604	NC_017167	ACG	2	6	566245	566250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134320
12605	NC_017167	AGG	2	6	566344	566349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134320
12606	NC_017167	CG	3	6	566354	566359	0 %	0 %	50 %	50 %	384134320
12607	NC_017167	GTC	2	6	566406	566411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134320
12608	NC_017167	GGA	2	6	566539	566544	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134321
12609	NC_017167	GCAG	2	8	566550	566557	25 %	0 %	50 %	25 %	384134321
12610	NC_017167	GC	3	6	566658	566663	0 %	0 %	50 %	50 %	384134321
12611	NC_017167	TCG	2	6	566679	566684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134321
12612	NC_017167	ACGGG	2	10	566694	566703	20 %	0 %	60 %	20 %	384134321
12613	NC_017167	ACGT	2	8	566705	566712	25 %	25 %	25 %	25 %	384134321
12614	NC_017167	CGC	2	6	566752	566757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134321
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12616	NC_017167	TCG	2	6	566790	566795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134321
12617	NC_017167	CGCA	2	8	566874	566881	25 %	0 %	25 %	50 %	384134321
12618	NC_017167	CGC	2	6	566901	566906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134321
12619	NC_017167	AGG	2	6	567006	567011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134321
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