MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017167	TCAT	2	8	516964	516971	25 %	50 %	0 %	25 %	384134283
11502	NC_017167	GA	3	6	517007	517012	50 %	0 %	50 %	0 %	384134283
11503	NC_017167	GTG	2	6	517044	517049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134283
11504	NC_017167	ATG	2	6	517066	517071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134283
11505	NC_017167	ACGG	2	8	517167	517174	25 %	0 %	50 %	25 %	384134283
11506	NC_017167	GGC	2	6	517186	517191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134283
11507	NC_017167	CGA	2	6	517205	517210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134283
11508	NC_017167	GC	4	8	517217	517224	0 %	0 %	50 %	50 %	384134283
11509	NC_017167	GCC	2	6	517254	517259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134283
11510	NC_017167	CCG	2	6	517263	517268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134283
11511	NC_017167	GC	4	8	517311	517318	0 %	0 %	50 %	50 %	384134283
11512	NC_017167	GCG	2	6	517412	517417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134283
11513	NC_017167	AGG	2	6	517451	517456	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_017167	CCT	2	6	517500	517505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134284
11515	NC_017167	GCTC	2	8	517551	517558	0 %	25 %	25 %	50 %	384134284
11516	NC_017167	GC	3	6	517560	517565	0 %	0 %	50 %	50 %	384134284
11517	NC_017167	GCC	2	6	517606	517611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134284
11518	NC_017167	CGT	2	6	517635	517640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134284
11519	NC_017167	ATGG	2	8	517644	517651	25 %	25 %	50 %	0 %	384134284
11520	NC_017167	GCC	2	6	517669	517674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134284
11521	NC_017167	CGGC	2	8	517688	517695	0 %	0 %	50 %	50 %	384134284
11522	NC_017167	GGC	2	6	517733	517738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134284
11523	NC_017167	CTGG	2	8	517753	517760	0 %	25 %	50 %	25 %	384134284
11524	NC_017167	GGC	2	6	517764	517769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134284
11525	NC_017167	CGG	2	6	517795	517800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134284
11526	NC_017167	CTC	2	6	517813	517818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134284
11527	NC_017167	GGCG	2	8	517872	517879	0 %	0 %	75 %	25 %	384134284
11528	NC_017167	TGTC	2	8	517893	517900	0 %	50 %	25 %	25 %	384134284
11529	NC_017167	CGCT	2	8	517929	517936	0 %	25 %	25 %	50 %	384134284
11530	NC_017167	GGGAGG	2	12	517937	517948	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	384134284
11531	NC_017167	GCG	2	6	518003	518008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134284
11532	NC_017167	CG	3	6	518091	518096	0 %	0 %	50 %	50 %	384134284
11533	NC_017167	GAC	2	6	518113	518118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134284
11534	NC_017167	CGG	2	6	518127	518132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134284
11535	NC_017167	CTCG	2	8	518133	518140	0 %	25 %	25 %	50 %	384134284
11536	NC_017167	GTCC	2	8	518235	518242	0 %	25 %	25 %	50 %	384134284
11537	NC_017167	CCT	2	6	518373	518378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134284
11538	NC_017167	GGC	2	6	518466	518471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134284
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11540	NC_017167	ACGC	2	8	518528	518535	25 %	0 %	25 %	50 %	384134284
11541	NC_017167	GCG	2	6	518568	518573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134284
11542	NC_017167	GC	3	6	518650	518655	0 %	0 %	50 %	50 %	384134284
11543	NC_017167	AACG	2	8	518661	518668	50 %	0 %	25 %	25 %	384134284
11544	NC_017167	CAT	2	6	518703	518708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134284
11545	NC_017167	CGC	2	6	518718	518723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134284
11546	NC_017167	ACG	2	6	518735	518740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134284
11547	NC_017167	GCC	2	6	518833	518838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134284
11548	NC_017167	TGC	2	6	518846	518851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134284
11549	NC_017167	TGGA	2	8	518982	518989	25 %	25 %	50 %	0 %	384134284
11550	NC_017167	GTC	2	6	519112	519117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134284
11551	NC_017167	GTG	2	6	519133	519138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134284
11552	NC_017167	GCG	3	9	519163	519171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134284
11553	NC_017167	CGG	2	6	519202	519207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134284
11554	NC_017167	CGC	2	6	519208	519213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134284
11555	NC_017167	TCG	2	6	519251	519256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134284
11556	NC_017167	GCG	2	6	519268	519273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134284
11557	NC_017167	GCCT	2	8	519278	519285	0 %	25 %	25 %	50 %	384134284
11558	NC_017167	GCC	2	6	519364	519369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134284
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11560	NC_017167	TGG	2	6	519716	519721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134285
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11563	NC_017167	GC	4	8	519872	519879	0 %	0 %	50 %	50 %	384134285
11564	NC_017167	TCG	2	6	519881	519886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134285
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11567	NC_017167	TCG	2	6	519908	519913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134285
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11572	NC_017167	GGCG	2	8	520069	520076	0 %	0 %	75 %	25 %	384134285
11573	NC_017167	GTAC	2	8	520092	520099	25 %	25 %	25 %	25 %	384134285
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11579	NC_017167	TCCG	2	8	520212	520219	0 %	25 %	25 %	50 %	384134285
11580	NC_017167	GC	3	6	520261	520266	0 %	0 %	50 %	50 %	384134285
11581	NC_017167	GC	3	6	520370	520375	0 %	0 %	50 %	50 %	384134285
11582	NC_017167	CGA	2	6	520403	520408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134285
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11585	NC_017167	GGT	2	6	520610	520615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11586	NC_017167	GCA	2	6	520675	520680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11587	NC_017167	AAGCGA	2	12	520697	520708	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11588	NC_017167	T	7	7	520753	520759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11589	NC_017167	TGT	2	6	520762	520767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11590	NC_017167	GCG	2	6	520789	520794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11591	NC_017167	CGC	2	6	520811	520816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11592	NC_017167	CAG	3	9	520824	520832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11593	NC_017167	GCGA	2	8	520949	520956	25 %	0 %	50 %	25 %	384134286
11594	NC_017167	TGG	2	6	521037	521042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134286
11595	NC_017167	GACG	2	8	521068	521075	25 %	0 %	50 %	25 %	384134286
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11598	NC_017167	TCT	3	9	521421	521429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134286
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11600	NC_017167	GAG	2	6	521510	521515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11601	NC_017167	GGA	2	6	521520	521525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_017167	ACGC	2	8	521735	521742	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11603	NC_017167	CGT	3	9	521770	521778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11604	NC_017167	CTT	2	6	521782	521787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11605	NC_017167	CCG	2	6	521990	521995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134287
11606	NC_017167	TCT	2	6	522029	522034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134287
11607	NC_017167	GGC	2	6	522037	522042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134287
11608	NC_017167	GC	3	6	522065	522070	0 %	0 %	50 %	50 %	384134287
11609	NC_017167	GC	3	6	522166	522171	0 %	0 %	50 %	50 %	384134287
11610	NC_017167	CGGG	2	8	522189	522196	0 %	0 %	75 %	25 %	384134287
11611	NC_017167	CACGG	2	10	522406	522415	20 %	0 %	40 %	40 %	384134287
11612	NC_017167	TCT	2	6	522417	522422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134287
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11614	NC_017167	TCCA	2	8	522490	522497	25 %	25 %	0 %	50 %	384134287
11615	NC_017167	TCG	2	6	522533	522538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134287
11616	NC_017167	CGGG	2	8	522545	522552	0 %	0 %	75 %	25 %	384134287
11617	NC_017167	TCG	2	6	522559	522564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134287
11618	NC_017167	GGC	3	9	522567	522575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134287
11619	NC_017167	TCG	2	6	522617	522622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134287
11620	NC_017167	GTG	2	6	522694	522699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134287
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11622	NC_017167	AGCGGA	2	12	522755	522766	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384134287
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11625	NC_017167	GAG	3	9	522799	522807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134287
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11643	NC_017167	GA	4	8	523524	523531	50 %	0 %	50 %	0 %	384134288
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