MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11003	NC_017167	CGG	2	6	495990	495995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134259
11004	NC_017167	CGT	2	6	495999	496004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134259
11005	NC_017167	CG	3	6	496067	496072	0 %	0 %	50 %	50 %	384134259
11006	NC_017167	GTT	2	6	496095	496100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384134259
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11009	NC_017167	TCG	2	6	496187	496192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134259
11010	NC_017167	CGC	2	6	496211	496216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134259
11011	NC_017167	GGC	2	6	496236	496241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134259
11012	NC_017167	GC	3	6	496240	496245	0 %	0 %	50 %	50 %	384134259
11013	NC_017167	CGA	2	6	496263	496268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134259
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11017	NC_017167	CGG	2	6	496419	496424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134259
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11020	NC_017167	C	6	6	496502	496507	0 %	0 %	0 %	100 %	384134259
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11024	NC_017167	GC	3	6	496683	496688	0 %	0 %	50 %	50 %	384134260
11025	NC_017167	TGC	2	6	496710	496715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134260
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11055	NC_017167	TGG	2	6	497971	497976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134262
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11111	NC_017167	GC	3	6	499860	499865	0 %	0 %	50 %	50 %	384134265
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11115	NC_017167	CCATC	2	10	500027	500036	20 %	20 %	0 %	60 %	384134265
11116	NC_017167	GCC	2	6	500128	500133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134265
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11120	NC_017167	GGC	2	6	500228	500233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134265
11121	NC_017167	CGC	2	6	500240	500245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134265
11122	NC_017167	GC	3	6	500252	500257	0 %	0 %	50 %	50 %	384134265
11123	NC_017167	TCC	2	6	500275	500280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134265
11124	NC_017167	ACG	2	6	500350	500355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134265
11125	NC_017167	GGC	2	6	500374	500379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134265
11126	NC_017167	GCC	2	6	500382	500387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134265
11127	NC_017167	TCC	2	6	500389	500394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134265
11128	NC_017167	CGA	2	6	500462	500467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134265
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11130	NC_017167	GC	3	6	500553	500558	0 %	0 %	50 %	50 %	384134265
11131	NC_017167	CGG	3	9	500701	500709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134265
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11133	NC_017167	CTG	2	6	500784	500789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134265
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11144	NC_017167	CCG	2	6	501195	501200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134265
11145	NC_017167	TCT	2	6	501203	501208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134265
11146	NC_017167	GC	4	8	501284	501291	0 %	0 %	50 %	50 %	384134265
11147	NC_017167	GTC	2	6	501354	501359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134265
11148	NC_017167	CTT	2	6	501434	501439	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134265
11149	NC_017167	CG	3	6	501510	501515	0 %	0 %	50 %	50 %	384134265
11150	NC_017167	GCA	2	6	501536	501541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134265
11151	NC_017167	CGT	2	6	501551	501556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134265
11152	NC_017167	TACG	2	8	501593	501600	25 %	25 %	25 %	25 %	384134265
11153	NC_017167	AGC	2	6	501621	501626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11154	NC_017167	CGT	2	6	501667	501672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134266
11155	NC_017167	GTC	2	6	501738	501743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134266
11156	NC_017167	TAT	2	6	501899	501904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384134267
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11158	NC_017167	GCC	2	6	502035	502040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134267
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11160	NC_017167	TCC	2	6	502062	502067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134267
11161	NC_017167	GTCG	2	8	502069	502076	0 %	25 %	50 %	25 %	384134267
11162	NC_017167	CG	3	6	502089	502094	0 %	0 %	50 %	50 %	384134267
11163	NC_017167	GATG	2	8	502117	502124	25 %	25 %	50 %	0 %	384134267
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11167	NC_017167	ACGTC	2	10	502269	502278	20 %	20 %	20 %	40 %	384134267
11168	NC_017167	TTC	2	6	502338	502343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134267
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11170	NC_017167	GGA	2	6	502441	502446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134267
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11172	NC_017167	GCC	2	6	502481	502486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134267
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11179	NC_017167	GTC	2	6	502887	502892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134268
11180	NC_017167	GGC	2	6	502907	502912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134268
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11182	NC_017167	TGG	2	6	502964	502969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134268
11183	NC_017167	GGC	2	6	503003	503008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134268
11184	NC_017167	ATCC	2	8	503009	503016	25 %	25 %	0 %	50 %	384134268
11185	NC_017167	GT	3	6	503028	503033	0 %	50 %	50 %	0 %	384134268
11186	NC_017167	TCG	2	6	503035	503040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134268
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11191	NC_017167	CGGG	2	8	503211	503218	0 %	0 %	75 %	25 %	384134269
11192	NC_017167	GGCC	2	8	503227	503234	0 %	0 %	50 %	50 %	384134269
11193	NC_017167	CGT	2	6	503236	503241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134269
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11195	NC_017167	CGC	2	6	503374	503379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134269
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11198	NC_017167	CTC	2	6	503423	503428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134269
11199	NC_017167	GACG	2	8	503458	503465	25 %	0 %	50 %	25 %	384134269
11200	NC_017167	CGC	3	9	503512	503520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134269
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11203	NC_017167	GCC	2	6	503591	503596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134269
11204	NC_017167	GC	3	6	503597	503602	0 %	0 %	50 %	50 %	384134269
11205	NC_017167	CCGG	2	8	503677	503684	0 %	0 %	50 %	50 %	384134269
11206	NC_017167	CCGG	2	8	503689	503696	0 %	0 %	50 %	50 %	384134269
11207	NC_017167	GAGG	2	8	503719	503726	25 %	0 %	75 %	0 %	384134269
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11211	NC_017167	TCC	2	6	504014	504019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134270
11212	NC_017167	CG	3	6	504051	504056	0 %	0 %	50 %	50 %	384134270
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11220	NC_017167	CGA	2	6	504384	504389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134270
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11222	NC_017167	GCTCGT	2	12	504441	504452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134270
11223	NC_017167	G	7	7	504456	504462	0 %	0 %	100 %	0 %	384134270
11224	NC_017167	CGA	2	6	504477	504482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134270
11225	NC_017167	CGC	2	6	504507	504512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134270
11226	NC_017167	GGT	2	6	504519	504524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134270
11227	NC_017167	TGC	2	6	504542	504547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134270
11228	NC_017167	CATGCT	2	12	504555	504566	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384134270
11229	NC_017167	CGT	2	6	504629	504634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134270
11230	NC_017167	TTC	2	6	504644	504649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134270
11231	NC_017167	CG	3	6	504650	504655	0 %	0 %	50 %	50 %	384134270
11232	NC_017167	GTGG	2	8	504703	504710	0 %	25 %	75 %	0 %	384134270
11233	NC_017167	AAG	2	6	504804	504809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384134271
11234	NC_017167	CGG	2	6	504810	504815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134271
11235	NC_017167	ACG	2	6	504846	504851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134271
11236	NC_017167	CGA	2	6	504871	504876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134271
11237	NC_017167	GC	3	6	504902	504907	0 %	0 %	50 %	50 %	384134271
11238	NC_017167	GCC	2	6	504914	504919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134271
11239	NC_017167	AGG	2	6	504975	504980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384134271
11240	NC_017167	CGT	2	6	505030	505035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134271
11241	NC_017167	G	6	6	505045	505050	0 %	0 %	100 %	0 %	384134271
11242	NC_017167	GCGG	2	8	505054	505061	0 %	0 %	75 %	25 %	384134271
11243	NC_017167	GGT	2	6	505078	505083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134271
11244	NC_017167	GCT	2	6	505108	505113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134271
11245	NC_017167	CGC	2	6	505114	505119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134271
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11251	NC_017167	A	7	7	505307	505313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11252	NC_017167	CGAG	2	8	505378	505385	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11253	NC_017167	AGG	2	6	505419	505424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11254	NC_017167	CGCT	2	8	505444	505451	0 %	25 %	25 %	50 %	384134272
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11346	NC_017167	AG	3	6	509439	509444	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11347	NC_017167	TGGT	2	8	509492	509499	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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11351	NC_017167	GCT	2	6	509740	509745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134277
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11353	NC_017167	TACA	2	8	510052	510059	50 %	25 %	0 %	25 %	384134277
11354	NC_017167	ACG	2	6	510066	510071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134277
11355	NC_017167	GT	3	6	510266	510271	0 %	50 %	50 %	0 %	384134277
11356	NC_017167	CAG	2	6	510283	510288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134277
11357	NC_017167	TCA	3	9	510297	510305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134277
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