MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_017167	CTGCG	2	10	473601	473610	0 %	20 %	40 %	40 %	384134234
10503	NC_017167	CCG	2	6	473626	473631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134234
10504	NC_017167	GCC	3	9	473644	473652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134234
10505	NC_017167	GGC	2	6	473670	473675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134234
10506	NC_017167	GCC	2	6	473680	473685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134234
10507	NC_017167	GC	3	6	473690	473695	0 %	0 %	50 %	50 %	384134234
10508	NC_017167	TGA	2	6	473795	473800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134234
10509	NC_017167	ACG	2	6	473926	473931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134234
10510	NC_017167	CAC	2	6	474066	474071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134234
10511	NC_017167	CCA	2	6	474090	474095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134234
10512	NC_017167	CGC	2	6	474169	474174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134234
10513	NC_017167	ATG	2	6	474202	474207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134234
10514	NC_017167	CGC	2	6	474228	474233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134234
10515	NC_017167	CGACGC	2	12	474257	474268	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384134234
10516	NC_017167	GA	3	6	474313	474318	50 %	0 %	50 %	0 %	384134234
10517	NC_017167	GC	3	6	474329	474334	0 %	0 %	50 %	50 %	384134234
10518	NC_017167	CG	3	6	474370	474375	0 %	0 %	50 %	50 %	384134234
10519	NC_017167	CCT	2	6	474407	474412	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134234
10520	NC_017167	GAT	2	6	474432	474437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134234
10521	NC_017167	GAT	2	6	474462	474467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134234
10522	NC_017167	CCA	2	6	474527	474532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384134234
10523	NC_017167	TCG	2	6	474536	474541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134234
10524	NC_017167	GAC	2	6	474603	474608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134234
10525	NC_017167	GCCG	2	8	474642	474649	0 %	0 %	50 %	50 %	384134234
10526	NC_017167	GATGTT	2	12	474672	474683	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384134234
10527	NC_017167	CGG	2	6	474732	474737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134234
10528	NC_017167	CGT	2	6	474791	474796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134234
10529	NC_017167	GGC	2	6	474906	474911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134234
10530	NC_017167	CGA	2	6	474992	474997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134234
10531	NC_017167	GC	3	6	475017	475022	0 %	0 %	50 %	50 %	384134234
10532	NC_017167	ACG	2	6	475057	475062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134234
10533	NC_017167	CGA	2	6	475065	475070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134234
10534	NC_017167	CGA	2	6	475163	475168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134234
10535	NC_017167	GC	3	6	475182	475187	0 %	0 %	50 %	50 %	384134234
10536	NC_017167	CCT	2	6	475222	475227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10537	NC_017167	GGT	2	6	475380	475385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10538	NC_017167	TCG	2	6	475434	475439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10539	NC_017167	CGC	2	6	475591	475596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384134235
10540	NC_017167	ATGT	2	8	475620	475627	25 %	50 %	25 %	0 %	384134235
10541	NC_017167	CG	3	6	475639	475644	0 %	0 %	50 %	50 %	384134235
10542	NC_017167	CTG	2	6	475785	475790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134235
10543	NC_017167	GTG	2	6	475791	475796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384134235
10544	NC_017167	TCC	2	6	475804	475809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384134235
10545	NC_017167	CGT	2	6	475814	475819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384134235
10546	NC_017167	CTT	2	6	475856	475861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384134235
10547	NC_017167	TGA	2	6	475980	475985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134235
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10550	NC_017167	CAT	2	6	476057	476062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134236
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10552	NC_017167	CG	3	6	476137	476142	0 %	0 %	50 %	50 %	384134236
10553	NC_017167	TGA	2	6	476272	476277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384134236
10554	NC_017167	CCATCA	2	12	476332	476343	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384134236
10555	NC_017167	GAC	2	6	476349	476354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134236
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10557	NC_017167	CAA	2	6	476465	476470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384134236
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10560	NC_017167	CAT	2	6	476747	476752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384134236
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10563	NC_017167	CGG	2	6	476819	476824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134236
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10588	NC_017167	GCG	2	6	478279	478284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384134237
10589	NC_017167	GCAG	2	8	478292	478299	25 %	0 %	50 %	25 %	384134237
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10593	NC_017167	CGTCG	2	10	478527	478536	0 %	20 %	40 %	40 %	384134237
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10612	NC_017167	CG	3	6	479330	479335	0 %	0 %	50 %	50 %	384134237
10613	NC_017167	GAC	2	6	479376	479381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384134237
10614	NC_017167	CGGTGA	2	12	479486	479497	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384134237
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10617	NC_017167	CAAA	2	8	479530	479537	75 %	0 %	0 %	25 %	384134237
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