MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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66002	NC_017167	CGC	3	9	3015657	3015665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136893
66003	NC_017167	GCC	2	6	3015682	3015687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136893
66004	NC_017167	GC	3	6	3015747	3015752	0 %	0 %	50 %	50 %	384136893
66005	NC_017167	GCG	2	6	3015779	3015784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136893
66006	NC_017167	CG	5	10	3015855	3015864	0 %	0 %	50 %	50 %	384136893
66007	NC_017167	C	6	6	3015868	3015873	0 %	0 %	0 %	100 %	384136893
66008	NC_017167	CAT	2	6	3015987	3015992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136893
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66010	NC_017167	GTG	2	6	3016089	3016094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384136894
66011	NC_017167	GC	3	6	3016145	3016150	0 %	0 %	50 %	50 %	384136894
66012	NC_017167	TCG	2	6	3016186	3016191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136894
66013	NC_017167	CTG	2	6	3016197	3016202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136894
66014	NC_017167	GTG	2	6	3016217	3016222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384136894
66015	NC_017167	CTG	2	6	3016239	3016244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136894
66016	NC_017167	CGC	2	6	3016388	3016393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136894
66017	NC_017167	CAG	2	6	3016535	3016540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136894
66018	NC_017167	CTG	2	6	3016599	3016604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136894
66019	NC_017167	GAC	2	6	3016607	3016612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136894
66020	NC_017167	GCA	2	6	3016614	3016619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136894
66021	NC_017167	CGCA	2	8	3016677	3016684	25 %	0 %	25 %	50 %	384136894
66022	NC_017167	ACTG	2	8	3016739	3016746	25 %	25 %	25 %	25 %	384136894
66023	NC_017167	ATCGAC	2	12	3016836	3016847	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384136894
66024	NC_017167	CAAA	2	8	3016853	3016860	75 %	0 %	0 %	25 %	384136894
66025	NC_017167	CGA	2	6	3016889	3016894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136894
66026	NC_017167	CGC	2	6	3016902	3016907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136894
66027	NC_017167	CAG	2	6	3016923	3016928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136894
66028	NC_017167	GC	3	6	3016953	3016958	0 %	0 %	50 %	50 %	384136894
66029	NC_017167	CGG	2	6	3016961	3016966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136894
66030	NC_017167	GGA	2	6	3016967	3016972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384136894
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66038	NC_017167	CG	3	6	3017599	3017604	0 %	0 %	50 %	50 %	384136895
66039	NC_017167	AATC	2	8	3017682	3017689	50 %	25 %	0 %	25 %	384136895
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66043	NC_017167	TCG	2	6	3017804	3017809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136895
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66045	NC_017167	ATG	2	6	3017921	3017926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136895
66046	NC_017167	GCAA	2	8	3018029	3018036	50 %	0 %	25 %	25 %	384136895
66047	NC_017167	TGA	2	6	3018050	3018055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136895
66048	NC_017167	ATGGCC	2	12	3018122	3018133	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384136895
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66050	NC_017167	GC	3	6	3018203	3018208	0 %	0 %	50 %	50 %	384136895
66051	NC_017167	GCCA	2	8	3018229	3018236	25 %	0 %	25 %	50 %	384136895
66052	NC_017167	CGTG	2	8	3018303	3018310	0 %	25 %	50 %	25 %	384136895
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66081	NC_017167	CG	3	6	3020569	3020574	0 %	0 %	50 %	50 %	384136896
66082	NC_017167	CCA	2	6	3020836	3020841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136896
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66084	NC_017167	CCCA	2	8	3020950	3020957	25 %	0 %	0 %	75 %	384136896
66085	NC_017167	GATG	2	8	3020980	3020987	25 %	25 %	50 %	0 %	384136896
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66089	NC_017167	TGC	2	6	3021307	3021312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66090	NC_017167	CA	3	6	3021313	3021318	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66091	NC_017167	TTC	2	6	3021348	3021353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136898
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66103	NC_017167	CCT	2	6	3021821	3021826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136898
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66112	NC_017167	TGC	2	6	3022103	3022108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136898
66113	NC_017167	CGCC	2	8	3022125	3022132	0 %	0 %	25 %	75 %	384136898
66114	NC_017167	GAA	2	6	3022144	3022149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136898
66115	NC_017167	GAGG	2	8	3022175	3022182	25 %	0 %	75 %	0 %	384136898
66116	NC_017167	CG	3	6	3022224	3022229	0 %	0 %	50 %	50 %	384136898
66117	NC_017167	GGT	2	6	3022242	3022247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384136898
66118	NC_017167	GTT	2	6	3022254	3022259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384136898
66119	NC_017167	TCC	2	6	3022289	3022294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136898
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66161	NC_017167	GCCA	2	8	3024303	3024310	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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