MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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63002	NC_017167	CGA	2	6	2880468	2880473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136738
63003	NC_017167	TCT	2	6	2880474	2880479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136738
63004	NC_017167	CGA	2	6	2880639	2880644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136738
63005	NC_017167	CCG	2	6	2880669	2880674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136738
63006	NC_017167	GC	4	8	2880703	2880710	0 %	0 %	50 %	50 %	384136738
63007	NC_017167	GAT	2	6	2880778	2880783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136738
63008	NC_017167	CG	3	6	2880849	2880854	0 %	0 %	50 %	50 %	384136738
63009	NC_017167	CAT	2	6	2880868	2880873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136738
63010	NC_017167	CTC	2	6	2880967	2880972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136738
63011	NC_017167	TGA	2	6	2880978	2880983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136738
63012	NC_017167	AGCTTG	2	12	2881001	2881012	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384136738
63013	NC_017167	GAT	2	6	2881036	2881041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136738
63014	NC_017167	CTT	2	6	2881045	2881050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136738
63015	NC_017167	CAC	2	6	2881060	2881065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136738
63016	NC_017167	AAT	2	6	2881104	2881109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384136738
63017	NC_017167	GCT	2	6	2881119	2881124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136738
63018	NC_017167	TCG	2	6	2881152	2881157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136738
63019	NC_017167	GCG	2	6	2881165	2881170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136738
63020	NC_017167	CTT	2	6	2881201	2881206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136738
63021	NC_017167	GAT	2	6	2881207	2881212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136738
63022	NC_017167	CGG	2	6	2881285	2881290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136738
63023	NC_017167	CCG	2	6	2881292	2881297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136738
63024	NC_017167	CGC	2	6	2881312	2881317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136738
63025	NC_017167	CGT	2	6	2881375	2881380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136738
63026	NC_017167	ACG	2	6	2881413	2881418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136738
63027	NC_017167	TGA	2	6	2881464	2881469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136738
63028	NC_017167	GC	3	6	2881530	2881535	0 %	0 %	50 %	50 %	384136738
63029	NC_017167	GAC	2	6	2881591	2881596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136738
63030	NC_017167	TGT	2	6	2881623	2881628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384136738
63031	NC_017167	GGC	2	6	2881630	2881635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136738
63032	NC_017167	CGG	2	6	2881668	2881673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136738
63033	NC_017167	GC	3	6	2881812	2881817	0 %	0 %	50 %	50 %	384136738
63034	NC_017167	CGA	2	6	2881854	2881859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136738
63035	NC_017167	TGT	2	6	2881911	2881916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384136738
63036	NC_017167	CG	3	6	2881926	2881931	0 %	0 %	50 %	50 %	384136738
63037	NC_017167	CCA	2	6	2881932	2881937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136738
63038	NC_017167	AAC	2	6	2881961	2881966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384136738
63039	NC_017167	CAC	2	6	2882020	2882025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136738
63040	NC_017167	GCCG	2	8	2882157	2882164	0 %	0 %	50 %	50 %	384136738
63041	NC_017167	CCT	2	6	2882187	2882192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136738
63042	NC_017167	GAT	2	6	2882218	2882223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136738
63043	NC_017167	GC	3	6	2882229	2882234	0 %	0 %	50 %	50 %	384136738
63044	NC_017167	GTT	2	6	2882260	2882265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384136738
63045	NC_017167	TGA	2	6	2882271	2882276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136738
63046	NC_017167	CGG	2	6	2882279	2882284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136738
63047	NC_017167	GCC	2	6	2882317	2882322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136738
63048	NC_017167	ATC	2	6	2882378	2882383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136738
63049	NC_017167	TTC	2	6	2882476	2882481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136738
63050	NC_017167	GATC	2	8	2882508	2882515	25 %	25 %	25 %	25 %	384136738
63051	NC_017167	TGCC	2	8	2882550	2882557	0 %	25 %	25 %	50 %	384136738
63052	NC_017167	CTT	2	6	2882617	2882622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136738
63053	NC_017167	GCG	2	6	2882628	2882633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136738
63054	NC_017167	ACG	2	6	2882658	2882663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136738
63055	NC_017167	GAA	2	6	2882737	2882742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136738
63056	NC_017167	GCC	2	6	2882762	2882767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136738
63057	NC_017167	CGC	2	6	2882820	2882825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136738
63058	NC_017167	CA	3	6	2882832	2882837	50 %	0 %	0 %	50 %	384136738
63059	NC_017167	CCT	2	6	2882925	2882930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136738
63060	NC_017167	CTT	2	6	2882968	2882973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136738
63061	NC_017167	GTT	2	6	2883040	2883045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384136738
63062	NC_017167	AAC	2	6	2883053	2883058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384136738
63063	NC_017167	TCG	2	6	2883074	2883079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63064	NC_017167	TCG	3	9	2883161	2883169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136739
63065	NC_017167	ATCTCG	2	12	2883182	2883193	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384136739
63066	NC_017167	TCG	2	6	2883197	2883202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136739
63067	NC_017167	TGA	2	6	2883246	2883251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136739
63068	NC_017167	CAC	2	6	2883331	2883336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136739
63069	NC_017167	GTC	2	6	2883337	2883342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136739
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63073	NC_017167	CG	3	6	2883491	2883496	0 %	0 %	50 %	50 %	384136739
63074	NC_017167	GTC	2	6	2883505	2883510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136739
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63081	NC_017167	TCG	2	6	2883944	2883949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136739
63082	NC_017167	CG	3	6	2883957	2883962	0 %	0 %	50 %	50 %	384136739
63083	NC_017167	CCG	2	6	2884074	2884079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136739
63084	NC_017167	CGA	2	6	2884113	2884118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136739
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63087	NC_017167	TCG	2	6	2884166	2884171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136739
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63089	NC_017167	CTC	2	6	2884261	2884266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136739
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63094	NC_017167	CG	3	6	2884493	2884498	0 %	0 %	50 %	50 %	384136739
63095	NC_017167	TGA	2	6	2884503	2884508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136739
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63097	NC_017167	ACG	2	6	2884598	2884603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136739
63098	NC_017167	CA	3	6	2884621	2884626	50 %	0 %	0 %	50 %	384136739
63099	NC_017167	CGC	2	6	2884642	2884647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136739
63100	NC_017167	GCG	2	6	2884674	2884679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136739
63101	NC_017167	GC	3	6	2884731	2884736	0 %	0 %	50 %	50 %	384136739
63102	NC_017167	CGT	3	9	2884743	2884751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136739
63103	NC_017167	CG	3	6	2884851	2884856	0 %	0 %	50 %	50 %	384136739
63104	NC_017167	TCC	2	6	2884934	2884939	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136739
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63107	NC_017167	TGA	2	6	2885058	2885063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136739
63108	NC_017167	AGT	2	6	2885118	2885123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136739
63109	NC_017167	CG	3	6	2885154	2885159	0 %	0 %	50 %	50 %	384136739
63110	NC_017167	GCTG	2	8	2885244	2885251	0 %	25 %	50 %	25 %	384136739
63111	NC_017167	GCG	2	6	2885307	2885312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136739
63112	NC_017167	TGGA	2	8	2885330	2885337	25 %	25 %	50 %	0 %	384136739
63113	NC_017167	GAT	2	6	2885433	2885438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136739
63114	NC_017167	GTC	2	6	2885443	2885448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136739
63115	NC_017167	CGT	2	6	2885449	2885454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136739
63116	NC_017167	CGC	2	6	2885460	2885465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136739
63117	NC_017167	GAA	2	6	2885476	2885481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136739
63118	NC_017167	GGC	2	6	2885491	2885496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136739
63119	NC_017167	GAT	2	6	2885497	2885502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136739
63120	NC_017167	CAAA	2	8	2885625	2885632	75 %	0 %	0 %	25 %	384136739
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63122	NC_017167	GAT	2	6	2885683	2885688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136739
63123	NC_017167	GCG	2	6	2885701	2885706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136739
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63145	NC_017167	GA	3	6	2886480	2886485	50 %	0 %	50 %	0 %	384136739
63146	NC_017167	GC	3	6	2886583	2886588	0 %	0 %	50 %	50 %	384136739
63147	NC_017167	GCG	2	6	2886595	2886600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136739
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63149	NC_017167	TCT	2	6	2886697	2886702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63150	NC_017167	CA	3	6	2886744	2886749	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63151	NC_017167	GAC	2	6	2886762	2886767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63152	NC_017167	GCA	2	6	2886804	2886809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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63154	NC_017167	AGG	2	6	2886898	2886903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63155	NC_017167	AAC	2	6	2886914	2886919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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63157	NC_017167	CCG	2	6	2887006	2887011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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63176	NC_017167	CTTC	2	8	2887795	2887802	0 %	50 %	0 %	50 %	384136741
63177	NC_017167	CAC	2	6	2887826	2887831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136741
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63181	NC_017167	GCC	2	6	2887950	2887955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136741
63182	NC_017167	TCA	2	6	2888047	2888052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136741
63183	NC_017167	CTC	2	6	2888060	2888065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63184	NC_017167	CGC	2	6	2888149	2888154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136742
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63187	NC_017167	CGA	2	6	2888284	2888289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136742
63188	NC_017167	CG	3	6	2888335	2888340	0 %	0 %	50 %	50 %	384136742
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63190	NC_017167	CTG	2	6	2888441	2888446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136742
63191	NC_017167	CGT	2	6	2888456	2888461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136742
63192	NC_017167	GAC	2	6	2888474	2888479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136742
63193	NC_017167	GC	5	10	2888507	2888516	0 %	0 %	50 %	50 %	384136742
63194	NC_017167	TCC	2	6	2888526	2888531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136742
63195	NC_017167	TGC	2	6	2888572	2888577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136742
63196	NC_017167	CGA	2	6	2888688	2888693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136742
63197	NC_017167	GGCA	2	8	2888751	2888758	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63198	NC_017167	CTG	2	6	2888785	2888790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63199	NC_017167	ACTC	2	8	2888852	2888859	25 %	25 %	0 %	50 %	384136743
63200	NC_017167	CCG	2	6	2888865	2888870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136743
63201	NC_017167	CG	3	6	2888869	2888874	0 %	0 %	50 %	50 %	384136743
63202	NC_017167	TGG	2	6	2888904	2888909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384136743
63203	NC_017167	GGC	2	6	2888951	2888956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136743
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63205	NC_017167	TCA	2	6	2888976	2888981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136743
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63208	NC_017167	ACG	2	6	2889018	2889023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136743
63209	NC_017167	CG	5	10	2889100	2889109	0 %	0 %	50 %	50 %	384136743
63210	NC_017167	GGCA	2	8	2889187	2889194	25 %	0 %	50 %	25 %	384136743
63211	NC_017167	CCAG	2	8	2889228	2889235	25 %	0 %	25 %	50 %	384136743
63212	NC_017167	TCT	2	6	2889246	2889251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136743
63213	NC_017167	CGA	2	6	2889270	2889275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136743
63214	NC_017167	CGCC	2	8	2889282	2889289	0 %	0 %	25 %	75 %	384136743
63215	NC_017167	GCA	2	6	2889360	2889365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136743
63216	NC_017167	CCGCG	2	10	2889369	2889378	0 %	0 %	40 %	60 %	384136743
63217	NC_017167	CTG	2	6	2889382	2889387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136743
63218	NC_017167	TGGCGG	2	12	2889447	2889458	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384136743
63219	NC_017167	TTC	2	6	2889461	2889466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136743
63220	NC_017167	CGT	2	6	2889489	2889494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136743
63221	NC_017167	TCAC	2	8	2889557	2889564	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
63222	NC_017167	TGC	2	6	2889638	2889643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136744
63223	NC_017167	GGC	2	6	2889669	2889674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136744
63224	NC_017167	TCGA	2	8	2889676	2889683	25 %	25 %	25 %	25 %	384136744
63225	NC_017167	GCA	2	6	2889685	2889690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136744
63226	NC_017167	TCT	2	6	2889704	2889709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136744
63227	NC_017167	GCC	2	6	2889793	2889798	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136744
63228	NC_017167	CGG	2	6	2889819	2889824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136744
63229	NC_017167	TTCAA	2	10	2889829	2889838	40 %	40 %	0 %	20 %	384136744
63230	NC_017167	GAC	2	6	2889870	2889875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136744
63231	NC_017167	ATG	2	6	2889934	2889939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136744
63232	NC_017167	CGG	2	6	2889975	2889980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136744
63233	NC_017167	GAC	2	6	2890026	2890031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136744
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