MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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62321	NC_017167	CTC	2	6	2850256	2850261	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62322	NC_017167	GC	3	6	2850351	2850356	0 %	0 %	50 %	50 %	384136691
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62336	NC_017167	CGAC	2	8	2851007	2851014	25 %	0 %	25 %	50 %	384136691
62337	NC_017167	CGAGC	2	10	2851053	2851062	20 %	0 %	40 %	40 %	384136691
62338	NC_017167	CTGG	2	8	2851086	2851093	0 %	25 %	50 %	25 %	384136691
62339	NC_017167	ACG	2	6	2851102	2851107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136691
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62341	NC_017167	CGA	2	6	2851259	2851264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136691
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62345	NC_017167	CCG	2	6	2851364	2851369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136691
62346	NC_017167	GCCA	2	8	2851453	2851460	25 %	0 %	25 %	50 %	384136691
62347	NC_017167	GAT	2	6	2851485	2851490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136691
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62350	NC_017167	CAT	2	6	2851524	2851529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136691
62351	NC_017167	AGAA	2	8	2851552	2851559	75 %	0 %	25 %	0 %	384136692
62352	NC_017167	TCT	2	6	2851570	2851575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136692
62353	NC_017167	AGC	2	6	2851584	2851589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136692
62354	NC_017167	TCG	2	6	2851617	2851622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136692
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62356	NC_017167	CG	3	6	2851724	2851729	0 %	0 %	50 %	50 %	384136692
62357	NC_017167	GCA	2	6	2851777	2851782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136692
62358	NC_017167	CGT	2	6	2851828	2851833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136692
62359	NC_017167	GCG	2	6	2851837	2851842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136692
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62362	NC_017167	CGATGA	2	12	2851939	2851950	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384136692
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62385	NC_017167	CCT	2	6	2853127	2853132	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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62389	NC_017167	CGG	2	6	2853315	2853320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136694
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62455	NC_017167	AC	3	6	2856026	2856031	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62456	NC_017167	AC	3	6	2856040	2856045	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
62457	NC_017167	CAT	2	6	2856066	2856071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136697
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62462	NC_017167	GCGG	2	8	2856220	2856227	0 %	0 %	75 %	25 %	384136697
62463	NC_017167	GAC	2	6	2856237	2856242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136697
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62465	NC_017167	GGA	2	6	2856310	2856315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384136697
62466	NC_017167	CG	3	6	2856416	2856421	0 %	0 %	50 %	50 %	384136697
62467	NC_017167	GCG	2	6	2856423	2856428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136697
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62469	NC_017167	CGC	3	9	2856522	2856530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62470	NC_017167	GCC	2	6	2856560	2856565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136698
62471	NC_017167	CTG	2	6	2856578	2856583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136698
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62473	NC_017167	GC	5	10	2856664	2856673	0 %	0 %	50 %	50 %	384136698
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62481	NC_017167	GAC	2	6	2857028	2857033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136698
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62493	NC_017167	CG	3	6	2857457	2857462	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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62498	NC_017167	C	6	6	2857735	2857740	0 %	0 %	0 %	100 %	384136699
62499	NC_017167	CGT	2	6	2857761	2857766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136699
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