MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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59002	NC_017167	GCA	2	6	2704677	2704682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136539
59003	NC_017167	GTA	2	6	2704723	2704728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136539
59004	NC_017167	GAT	2	6	2704966	2704971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136539
59005	NC_017167	CTT	2	6	2705008	2705013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136539
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59010	NC_017167	TCTTTC	2	12	2705084	2705095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136539
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59012	NC_017167	GCGCG	2	10	2705170	2705179	0 %	0 %	60 %	40 %	384136539
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59018	NC_017167	CG	3	6	2705276	2705281	0 %	0 %	50 %	50 %	384136539
59019	NC_017167	CTT	2	6	2705317	2705322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136539
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59022	NC_017167	CCTG	2	8	2705406	2705413	0 %	25 %	25 %	50 %	384136539
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59054	NC_017167	CG	3	6	2707130	2707135	0 %	0 %	50 %	50 %	384136542
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59233	NC_017167	TGCG	2	8	2715640	2715647	0 %	25 %	50 %	25 %	384136548
59234	NC_017167	GCC	2	6	2715683	2715688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136548
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59266	NC_017167	GGC	2	6	2717456	2717461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136549
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59268	NC_017167	GCCG	2	8	2717537	2717544	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59269	NC_017167	CGGG	2	8	2717557	2717564	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59270	NC_017167	GCT	2	6	2717594	2717599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136550
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59275	NC_017167	GATGT	2	10	2717851	2717860	20 %	40 %	40 %	0 %	384136550
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59290	NC_017167	CAG	2	6	2718520	2718525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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59293	NC_017167	GC	3	6	2718725	2718730	0 %	0 %	50 %	50 %	384136551
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59331	NC_017167	GC	3	6	2721251	2721256	0 %	0 %	50 %	50 %	384136553
59332	NC_017167	GTCA	2	8	2721272	2721279	25 %	25 %	25 %	25 %	384136554
59333	NC_017167	CCA	2	6	2721302	2721307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136554
59334	NC_017167	TGC	2	6	2721361	2721366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136554
59335	NC_017167	CCGAT	2	10	2721378	2721387	20 %	20 %	20 %	40 %	384136554
59336	NC_017167	CGT	2	6	2721419	2721424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136554
59337	NC_017167	CGG	2	6	2721456	2721461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136554
59338	NC_017167	C	6	6	2721477	2721482	0 %	0 %	0 %	100 %	384136554
59339	NC_017167	TCGT	2	8	2721521	2721528	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59340	NC_017167	T	7	7	2721541	2721547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59341	NC_017167	GA	3	6	2721572	2721577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59342	NC_017167	GCA	2	6	2721598	2721603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59343	NC_017167	CAA	2	6	2721605	2721610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59344	NC_017167	GGT	2	6	2721686	2721691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384136555
59345	NC_017167	ACA	2	6	2721764	2721769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384136555
59346	NC_017167	CTG	2	6	2721857	2721862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136555
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