MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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58502	NC_017167	GTG	2	6	2683289	2683294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384136520
58503	NC_017167	CG	3	6	2683298	2683303	0 %	0 %	50 %	50 %	384136520
58504	NC_017167	CGT	2	6	2683309	2683314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136520
58505	NC_017167	GGA	2	6	2683357	2683362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384136520
58506	NC_017167	CTT	2	6	2683387	2683392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136520
58507	NC_017167	GC	3	6	2683434	2683439	0 %	0 %	50 %	50 %	384136520
58508	NC_017167	CCGC	2	8	2683459	2683466	0 %	0 %	25 %	75 %	384136520
58509	NC_017167	ACGTGC	2	12	2683473	2683484	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384136520
58510	NC_017167	CGAG	2	8	2683543	2683550	25 %	0 %	50 %	25 %	384136520
58511	NC_017167	GAG	2	6	2683577	2683582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384136520
58512	NC_017167	CTG	2	6	2683616	2683621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136520
58513	NC_017167	CAGACG	2	12	2683622	2683633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136520
58514	NC_017167	GC	3	6	2683639	2683644	0 %	0 %	50 %	50 %	384136520
58515	NC_017167	ACGC	2	8	2683714	2683721	25 %	0 %	25 %	50 %	384136520
58516	NC_017167	GC	3	6	2683774	2683779	0 %	0 %	50 %	50 %	384136520
58517	NC_017167	CGC	2	6	2683789	2683794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136520
58518	NC_017167	CGGA	2	8	2683824	2683831	25 %	0 %	50 %	25 %	384136520
58519	NC_017167	CGCC	2	8	2683852	2683859	0 %	0 %	25 %	75 %	384136520
58520	NC_017167	GGGA	2	8	2683860	2683867	25 %	0 %	75 %	0 %	384136520
58521	NC_017167	CGG	2	6	2683885	2683890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136520
58522	NC_017167	GAG	3	9	2683958	2683966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384136520
58523	NC_017167	CGG	2	6	2683981	2683986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136520
58524	NC_017167	CGAT	2	8	2684043	2684050	25 %	25 %	25 %	25 %	384136520
58525	NC_017167	GC	4	8	2684062	2684069	0 %	0 %	50 %	50 %	384136520
58526	NC_017167	GCC	2	6	2684086	2684091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136520
58527	NC_017167	CGA	2	6	2684102	2684107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136520
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58534	NC_017167	CG	4	8	2684381	2684388	0 %	0 %	50 %	50 %	384136520
58535	NC_017167	GAG	2	6	2684405	2684410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384136520
58536	NC_017167	CG	3	6	2684427	2684432	0 %	0 %	50 %	50 %	384136520
58537	NC_017167	GCG	2	6	2684459	2684464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136520
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58539	NC_017167	AGGGCG	2	12	2684578	2684589	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384136521
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58545	NC_017167	GTCG	2	8	2684865	2684872	0 %	25 %	50 %	25 %	384136521
58546	NC_017167	CGC	2	6	2684913	2684918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136521
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58548	NC_017167	GAC	2	6	2684964	2684969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136521
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58551	NC_017167	TGA	2	6	2685104	2685109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136521
58552	NC_017167	GGC	2	6	2685219	2685224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136521
58553	NC_017167	GGC	2	6	2685336	2685341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136521
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58555	NC_017167	CCG	2	6	2685425	2685430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136521
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58560	NC_017167	GTC	2	6	2685570	2685575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136521
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58562	NC_017167	TGGCC	2	10	2685641	2685650	0 %	20 %	40 %	40 %	384136521
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58567	NC_017167	GC	3	6	2685903	2685908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58568	NC_017167	CGCGC	2	10	2685932	2685941	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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58570	NC_017167	GCTCG	2	10	2686204	2686213	0 %	20 %	40 %	40 %	384136522
58571	NC_017167	GCG	2	6	2686214	2686219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136522
58572	NC_017167	GGA	2	6	2686228	2686233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384136522
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58587	NC_017167	CAT	3	9	2686800	2686808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136522
58588	NC_017167	CGTC	2	8	2686913	2686920	0 %	25 %	25 %	50 %	384136522
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58598	NC_017167	CCAA	2	8	2687296	2687303	50 %	0 %	0 %	50 %	384136523
58599	NC_017167	CG	3	6	2687358	2687363	0 %	0 %	50 %	50 %	384136523
58600	NC_017167	CG	3	6	2687458	2687463	0 %	0 %	50 %	50 %	384136523
58601	NC_017167	CGA	2	6	2687470	2687475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136523
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58607	NC_017167	TCG	2	6	2687619	2687624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136523
58608	NC_017167	CG	3	6	2687623	2687628	0 %	0 %	50 %	50 %	384136523
58609	NC_017167	GCG	2	6	2687641	2687646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136523
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58612	NC_017167	GCCGC	2	10	2687725	2687734	0 %	0 %	40 %	60 %	384136523
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