MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58001	NC_017167	CGC	2	6	2660373	2660378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136498
58002	NC_017167	TTC	2	6	2660379	2660384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136498
58003	NC_017167	GC	3	6	2660491	2660496	0 %	0 %	50 %	50 %	384136498
58004	NC_017167	GTG	2	6	2660574	2660579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384136498
58005	NC_017167	CAC	2	6	2660610	2660615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136498
58006	NC_017167	ATC	3	9	2660616	2660624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136498
58007	NC_017167	TTC	2	6	2660644	2660649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136498
58008	NC_017167	GCT	2	6	2660678	2660683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136498
58009	NC_017167	CTC	2	6	2660743	2660748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58010	NC_017167	CTT	2	6	2660871	2660876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136499
58011	NC_017167	TCC	2	6	2660959	2660964	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136499
58012	NC_017167	ACC	2	6	2660995	2661000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136499
58013	NC_017167	TCA	2	6	2661008	2661013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136499
58014	NC_017167	GC	3	6	2661016	2661021	0 %	0 %	50 %	50 %	384136499
58015	NC_017167	TCC	2	6	2661094	2661099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136499
58016	NC_017167	TCCC	2	8	2661158	2661165	0 %	25 %	0 %	75 %	384136499
58017	NC_017167	CTT	2	6	2661242	2661247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136499
58018	NC_017167	CG	3	6	2661300	2661305	0 %	0 %	50 %	50 %	384136499
58019	NC_017167	CGA	2	6	2661364	2661369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136499
58020	NC_017167	GTA	2	6	2661432	2661437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136499
58021	NC_017167	CGA	2	6	2661442	2661447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136499
58022	NC_017167	TC	3	6	2661455	2661460	0 %	50 %	0 %	50 %	384136499
58023	NC_017167	CCGT	2	8	2661476	2661483	0 %	25 %	25 %	50 %	384136499
58024	NC_017167	CCG	2	6	2661524	2661529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136499
58025	NC_017167	CT	3	6	2661603	2661608	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58026	NC_017167	CGC	2	6	2661677	2661682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58027	NC_017167	GA	3	6	2661704	2661709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58028	NC_017167	GTT	2	6	2661741	2661746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58029	NC_017167	TCTCT	2	10	2661763	2661772	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
58030	NC_017167	TCC	2	6	2661787	2661792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58031	NC_017167	AAC	2	6	2661797	2661802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58032	NC_017167	GCCC	2	8	2661865	2661872	0 %	0 %	25 %	75 %	384136500
58033	NC_017167	CGA	2	6	2661894	2661899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136500
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58035	NC_017167	GCTTCC	2	12	2661965	2661976	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384136500
58036	NC_017167	CCA	2	6	2662020	2662025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136500
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58038	NC_017167	GTCT	2	8	2662051	2662058	0 %	50 %	25 %	25 %	384136500
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58040	NC_017167	GC	3	6	2662130	2662135	0 %	0 %	50 %	50 %	384136500
58041	NC_017167	CG	4	8	2662248	2662255	0 %	0 %	50 %	50 %	384136500
58042	NC_017167	CTG	2	6	2662321	2662326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136500
58043	NC_017167	GAC	2	6	2662331	2662336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136500
58044	NC_017167	CGT	2	6	2662342	2662347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136500
58045	NC_017167	CGA	2	6	2662356	2662361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136500
58046	NC_017167	TGA	2	6	2662443	2662448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136500
58047	NC_017167	CG	3	6	2662574	2662579	0 %	0 %	50 %	50 %	384136500
58048	NC_017167	ACC	2	6	2662583	2662588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136500
58049	NC_017167	CAT	2	6	2662626	2662631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136500
58050	NC_017167	CA	4	8	2662732	2662739	50 %	0 %	0 %	50 %	384136500
58051	NC_017167	TCC	3	9	2662740	2662748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136500
58052	NC_017167	GCCA	2	8	2662752	2662759	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58053	NC_017167	CCTTC	2	10	2662761	2662770	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
58054	NC_017167	TCC	2	6	2662798	2662803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58055	NC_017167	T	6	6	2662867	2662872	0 %	100 %	0 %	0 %	384136501
58056	NC_017167	AGA	2	6	2662951	2662956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136501
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58061	NC_017167	TAG	2	6	2663130	2663135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136501
58062	NC_017167	GAT	3	9	2663153	2663161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136501
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58066	NC_017167	GTC	2	6	2663517	2663522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136501
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58071	NC_017167	CCG	2	6	2663880	2663885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136501
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58089	NC_017167	TC	3	6	2664439	2664444	0 %	50 %	0 %	50 %	384136501
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58091	NC_017167	TG	4	8	2664477	2664484	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58092	NC_017167	CCA	2	6	2664577	2664582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58093	NC_017167	ATG	2	6	2664591	2664596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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58095	NC_017167	TCC	2	6	2664656	2664661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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58098	NC_017167	AGG	2	6	2664888	2664893	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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58103	NC_017167	GCT	2	6	2665103	2665108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136502
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58105	NC_017167	GAA	2	6	2665193	2665198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136502
58106	NC_017167	GCTC	2	8	2665210	2665217	0 %	25 %	25 %	50 %	384136502
58107	NC_017167	CTA	2	6	2665297	2665302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136502
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58112	NC_017167	GCCG	2	8	2665483	2665490	0 %	0 %	50 %	50 %	384136502
58113	NC_017167	CGC	2	6	2665497	2665502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136502
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58116	NC_017167	TCA	2	6	2665662	2665667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136502
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58118	NC_017167	CAT	2	6	2665729	2665734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136502
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58232	NC_017167	CGTC	2	8	2670879	2670886	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58233	NC_017167	CGG	2	6	2671000	2671005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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58341	NC_017167	CCGG	2	8	2675895	2675902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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58347	NC_017167	CGA	2	6	2676211	2676216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136513
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58349	NC_017167	CGA	2	6	2676241	2676246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136513
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58351	NC_017167	GCC	2	6	2676513	2676518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136513
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