MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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57002	NC_017167	CG	3	6	2616261	2616266	0 %	0 %	50 %	50 %	384136453
57003	NC_017167	CTG	2	6	2616451	2616456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136453
57004	NC_017167	GC	3	6	2616465	2616470	0 %	0 %	50 %	50 %	384136453
57005	NC_017167	TCTCG	2	10	2616495	2616504	0 %	40 %	20 %	40 %	384136453
57006	NC_017167	GGA	2	6	2616522	2616527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384136453
57007	NC_017167	TGCCGC	2	12	2616578	2616589	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384136453
57008	NC_017167	CCG	2	6	2616603	2616608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136453
57009	NC_017167	GGA	2	6	2616656	2616661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384136453
57010	NC_017167	CGG	2	6	2616758	2616763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136453
57011	NC_017167	GAGG	2	8	2616775	2616782	25 %	0 %	75 %	0 %	384136453
57012	NC_017167	AAC	2	6	2616844	2616849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384136453
57013	NC_017167	CG	3	6	2616871	2616876	0 %	0 %	50 %	50 %	384136453
57014	NC_017167	ACG	2	6	2616967	2616972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136453
57015	NC_017167	GAA	2	6	2616988	2616993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136453
57016	NC_017167	GCG	2	6	2617006	2617011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136453
57017	NC_017167	CGT	2	6	2617017	2617022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136453
57018	NC_017167	CG	4	8	2617082	2617089	0 %	0 %	50 %	50 %	384136453
57019	NC_017167	CCG	2	6	2617145	2617150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57020	NC_017167	GTC	2	6	2617323	2617328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136454
57021	NC_017167	GAA	2	6	2617382	2617387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136454
57022	NC_017167	ACG	2	6	2617462	2617467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136454
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57024	NC_017167	GCG	2	6	2617498	2617503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136454
57025	NC_017167	CAT	2	6	2617549	2617554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136454
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57027	NC_017167	CCT	2	6	2617641	2617646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57028	NC_017167	GCC	2	6	2617756	2617761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136455
57029	NC_017167	TGG	2	6	2617821	2617826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384136455
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57034	NC_017167	CGTC	2	8	2617957	2617964	0 %	25 %	25 %	50 %	384136455
57035	NC_017167	GC	3	6	2617965	2617970	0 %	0 %	50 %	50 %	384136455
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57039	NC_017167	G	6	6	2618115	2618120	0 %	0 %	100 %	0 %	384136455
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57042	NC_017167	GGAG	2	8	2618332	2618339	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
57043	NC_017167	ACC	2	6	2618344	2618349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57044	NC_017167	TCG	2	6	2618377	2618382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136456
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57047	NC_017167	GC	3	6	2618518	2618523	0 %	0 %	50 %	50 %	384136456
57048	NC_017167	TCCA	2	8	2618532	2618539	25 %	25 %	0 %	50 %	384136456
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57054	NC_017167	CGC	2	6	2618718	2618723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136456
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