MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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56003	NC_017167	TTC	2	6	2573087	2573092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136416
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56005	NC_017167	GTGG	2	8	2573140	2573147	0 %	25 %	75 %	0 %	384136416
56006	NC_017167	C	7	7	2573170	2573176	0 %	0 %	0 %	100 %	384136416
56007	NC_017167	TGG	2	6	2573199	2573204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384136416
56008	NC_017167	GC	3	6	2573219	2573224	0 %	0 %	50 %	50 %	384136416
56009	NC_017167	GTG	2	6	2573225	2573230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384136416
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56011	NC_017167	TGG	2	6	2573280	2573285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384136416
56012	NC_017167	CCCGA	2	10	2573336	2573345	20 %	0 %	20 %	60 %	384136416
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56017	NC_017167	GC	3	6	2573474	2573479	0 %	0 %	50 %	50 %	384136416
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56227	NC_017167	CCCGC	2	10	2583025	2583034	0 %	0 %	20 %	80 %	384136424
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56232	NC_017167	CAC	2	6	2583271	2583276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136424
56233	NC_017167	CCCA	2	8	2583305	2583312	25 %	0 %	0 %	75 %	384136424
56234	NC_017167	CCTG	2	8	2583318	2583325	0 %	25 %	25 %	50 %	384136424
56235	NC_017167	CAC	2	6	2583394	2583399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136424
56236	NC_017167	GAC	2	6	2583407	2583412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136424
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56239	NC_017167	GCC	2	6	2583531	2583536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136425
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56241	NC_017167	CGC	3	9	2583608	2583616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136425
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56321	NC_017167	CGT	2	6	2586797	2586802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136428
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56466	NC_017167	GGC	2	6	2592535	2592540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136432
56467	NC_017167	TCA	2	6	2592541	2592546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136432
56468	NC_017167	CGA	2	6	2592673	2592678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136432
56469	NC_017167	GCCA	2	8	2592681	2592688	25 %	0 %	25 %	50 %	384136432
56470	NC_017167	CG	3	6	2592703	2592708	0 %	0 %	50 %	50 %	384136432
56471	NC_017167	TCG	2	6	2592765	2592770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136432
56472	NC_017167	CG	3	6	2592769	2592774	0 %	0 %	50 %	50 %	384136432
56473	NC_017167	CGG	2	6	2592827	2592832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136432
56474	NC_017167	GCT	2	6	2592868	2592873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136432
56475	NC_017167	TCT	2	6	2592895	2592900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136432
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56477	NC_017167	AGGAG	2	10	2593012	2593021	40 %	0 %	60 %	0 %	384136432
56478	NC_017167	CG	3	6	2593031	2593036	0 %	0 %	50 %	50 %	384136432
56479	NC_017167	CG	3	6	2593047	2593052	0 %	0 %	50 %	50 %	384136432
56480	NC_017167	CCA	2	6	2593066	2593071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136432
56481	NC_017167	TGA	2	6	2593104	2593109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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56485	NC_017167	CG	3	6	2593443	2593448	0 %	0 %	50 %	50 %	384136433
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56489	NC_017167	CGG	2	6	2593637	2593642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136433
56490	NC_017167	ACG	2	6	2593696	2593701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136433
56491	NC_017167	CGT	2	6	2593745	2593750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136433
56492	NC_017167	CCG	2	6	2593763	2593768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136433
56493	NC_017167	CGC	2	6	2593848	2593853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136433
56494	NC_017167	CGT	2	6	2593865	2593870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136433
56495	NC_017167	CG	3	6	2593871	2593876	0 %	0 %	50 %	50 %	384136433
56496	NC_017167	CGAG	2	8	2593880	2593887	25 %	0 %	50 %	25 %	384136433
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56498	NC_017167	CG	3	6	2594025	2594030	0 %	0 %	50 %	50 %	384136433
56499	NC_017167	TCCC	2	8	2594118	2594125	0 %	25 %	0 %	75 %	384136434
56500	NC_017167	GCG	2	6	2594141	2594146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136434

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