MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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55002	NC_017167	GTC	2	6	2533485	2533490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136378
55003	NC_017167	GC	3	6	2533515	2533520	0 %	0 %	50 %	50 %	384136378
55004	NC_017167	CGT	2	6	2533526	2533531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136378
55005	NC_017167	GC	3	6	2533539	2533544	0 %	0 %	50 %	50 %	384136378
55006	NC_017167	GTT	2	6	2533547	2533552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384136378
55007	NC_017167	GC	3	6	2533565	2533570	0 %	0 %	50 %	50 %	384136378
55008	NC_017167	CGA	2	6	2533598	2533603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136378
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55010	NC_017167	CGCC	2	8	2533703	2533710	0 %	0 %	25 %	75 %	384136378
55011	NC_017167	CGT	2	6	2533748	2533753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136378
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55013	NC_017167	GGC	2	6	2533802	2533807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136378
55014	NC_017167	GCG	2	6	2533811	2533816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136378
55015	NC_017167	GAG	2	6	2533821	2533826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384136378
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55017	NC_017167	GCG	2	6	2533906	2533911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136378
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55019	NC_017167	GC	3	6	2533925	2533930	0 %	0 %	50 %	50 %	384136378
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55033	NC_017167	TCCC	2	8	2534333	2534340	0 %	25 %	0 %	75 %	384136379
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55037	NC_017167	GC	3	6	2534475	2534480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55038	NC_017167	CG	3	6	2534481	2534486	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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55051	NC_017167	GC	3	6	2535013	2535018	0 %	0 %	50 %	50 %	384136381
55052	NC_017167	GCA	2	6	2535106	2535111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136381
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55055	NC_017167	C	6	6	2535317	2535322	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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55110	NC_017167	GGCG	2	8	2537642	2537649	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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55118	NC_017167	GTA	2	6	2538109	2538114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136384
55119	NC_017167	CG	3	6	2538135	2538140	0 %	0 %	50 %	50 %	384136384
55120	NC_017167	CGT	2	6	2538171	2538176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136384
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55231	NC_017167	CTG	2	6	2542100	2542105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136387
55232	NC_017167	TCC	2	6	2542113	2542118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136387
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55472	NC_017167	TCG	2	6	2552108	2552113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136397
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