MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54501	NC_017167	GC	3	6	2511633	2511638	0 %	0 %	50 %	50 %	384136355
54502	NC_017167	ACC	2	6	2511685	2511690	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136355
54503	NC_017167	TCC	2	6	2511706	2511711	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136355
54504	NC_017167	TCA	2	6	2511838	2511843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136356
54505	NC_017167	CGT	2	6	2511868	2511873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136356
54506	NC_017167	TCCA	2	8	2511903	2511910	25 %	25 %	0 %	50 %	384136356
54507	NC_017167	CG	3	6	2511948	2511953	0 %	0 %	50 %	50 %	384136356
54508	NC_017167	AAC	2	6	2511978	2511983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384136356
54509	NC_017167	CTC	2	6	2512001	2512006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136356
54510	NC_017167	CGC	2	6	2512021	2512026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136356
54511	NC_017167	CCT	2	6	2512108	2512113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136356
54512	NC_017167	GC	3	6	2512125	2512130	0 %	0 %	50 %	50 %	384136356
54513	NC_017167	C	6	6	2512200	2512205	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54514	NC_017167	TAT	2	6	2512220	2512225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54515	NC_017167	GAA	2	6	2512233	2512238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54516	NC_017167	CG	3	6	2512272	2512277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54517	NC_017167	GCT	2	6	2512281	2512286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54518	NC_017167	AGG	2	6	2512328	2512333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54519	NC_017167	GCG	2	6	2512375	2512380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136357
54520	NC_017167	TCGCG	2	10	2512418	2512427	0 %	20 %	40 %	40 %	384136357
54521	NC_017167	CCG	2	6	2512455	2512460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136357
54522	NC_017167	CGG	2	6	2512511	2512516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136357
54523	NC_017167	TCCC	2	8	2512645	2512652	0 %	25 %	0 %	75 %	384136357
54524	NC_017167	CG	3	6	2512655	2512660	0 %	0 %	50 %	50 %	384136357
54525	NC_017167	GAG	2	6	2512719	2512724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384136357
54526	NC_017167	GC	3	6	2512822	2512827	0 %	0 %	50 %	50 %	384136358
54527	NC_017167	CGA	2	6	2512836	2512841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136358
54528	NC_017167	CGG	2	6	2512868	2512873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136358
54529	NC_017167	ACGC	2	8	2512885	2512892	25 %	0 %	25 %	50 %	384136358
54530	NC_017167	CGC	3	9	2512948	2512956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136358
54531	NC_017167	CAG	2	6	2512979	2512984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136358
54532	NC_017167	GGC	2	6	2513023	2513028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136358
54533	NC_017167	GCAT	2	8	2513130	2513137	25 %	25 %	25 %	25 %	384136358
54534	NC_017167	GCC	2	6	2513190	2513195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136358
54535	NC_017167	GGGAT	2	10	2513261	2513270	20 %	20 %	60 %	0 %	384136359
54536	NC_017167	CGCC	2	8	2513277	2513284	0 %	0 %	25 %	75 %	384136359
54537	NC_017167	CGC	2	6	2513325	2513330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136359
54538	NC_017167	CGC	2	6	2513340	2513345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136359
54539	NC_017167	ACG	2	6	2513355	2513360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136359
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54541	NC_017167	GCC	2	6	2513451	2513456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136359
54542	NC_017167	CGCC	2	8	2513463	2513470	0 %	0 %	25 %	75 %	384136359
54543	NC_017167	CCGG	2	8	2513514	2513521	0 %	0 %	50 %	50 %	384136359
54544	NC_017167	ACG	2	6	2513595	2513600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136359
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54547	NC_017167	C	6	6	2513707	2513712	0 %	0 %	0 %	100 %	384136359
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54549	NC_017167	CGC	2	6	2513767	2513772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136359
54550	NC_017167	C	6	6	2513886	2513891	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54551	NC_017167	CAC	2	6	2513901	2513906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54552	NC_017167	CAG	2	6	2513979	2513984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136360
54553	NC_017167	ACG	2	6	2514036	2514041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136360
54554	NC_017167	GCG	2	6	2514124	2514129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136360
54555	NC_017167	TCG	2	6	2514138	2514143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136360
54556	NC_017167	C	6	6	2514164	2514169	0 %	0 %	0 %	100 %	384136360
54557	NC_017167	CG	3	6	2514222	2514227	0 %	0 %	50 %	50 %	384136360
54558	NC_017167	GAA	2	6	2514232	2514237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136360
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54560	NC_017167	CGCT	2	8	2514252	2514259	0 %	25 %	25 %	50 %	384136360
54561	NC_017167	TATAC	2	10	2514311	2514320	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54562	NC_017167	CGG	2	6	2514383	2514388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54563	NC_017167	TTG	2	6	2514399	2514404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54564	NC_017167	CAA	2	6	2514550	2514555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54565	NC_017167	CG	3	6	2514612	2514617	0 %	0 %	50 %	50 %	384136361
54566	NC_017167	GC	3	6	2514674	2514679	0 %	0 %	50 %	50 %	384136361
54567	NC_017167	GGC	2	6	2514684	2514689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136361
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54569	NC_017167	CG	3	6	2514756	2514761	0 %	0 %	50 %	50 %	384136361
54570	NC_017167	GGGAT	2	10	2514823	2514832	20 %	20 %	60 %	0 %	384136361
54571	NC_017167	GAA	2	6	2514865	2514870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136361
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54574	NC_017167	CGGCT	2	10	2514983	2514992	0 %	20 %	40 %	40 %	384136361
54575	NC_017167	GATC	2	8	2514997	2515004	25 %	25 %	25 %	25 %	384136361
54576	NC_017167	GACG	2	8	2515027	2515034	25 %	0 %	50 %	25 %	384136361
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54578	NC_017167	GGCT	2	8	2515082	2515089	0 %	25 %	50 %	25 %	384136361
54579	NC_017167	GAC	2	6	2515132	2515137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136361
54580	NC_017167	TC	3	6	2515183	2515188	0 %	50 %	0 %	50 %	384136361
54581	NC_017167	CG	3	6	2515205	2515210	0 %	0 %	50 %	50 %	384136361
54582	NC_017167	GAC	2	6	2515214	2515219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136361
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54585	NC_017167	ATC	2	6	2515400	2515405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136361
54586	NC_017167	TCG	2	6	2515428	2515433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136361
54587	NC_017167	CGT	2	6	2515462	2515467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136361
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54589	NC_017167	AAG	2	6	2515478	2515483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136361
54590	NC_017167	CGC	2	6	2515500	2515505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136361
54591	NC_017167	GACG	2	8	2515510	2515517	25 %	0 %	50 %	25 %	384136361
54592	NC_017167	GGC	2	6	2515582	2515587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136361
54593	NC_017167	TCG	2	6	2515608	2515613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136361
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54601	NC_017167	CG	3	6	2516012	2516017	0 %	0 %	50 %	50 %	384136361
54602	NC_017167	CGG	2	6	2516220	2516225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136361
54603	NC_017167	CG	3	6	2516253	2516258	0 %	0 %	50 %	50 %	384136361
54604	NC_017167	CTG	2	6	2516273	2516278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136361
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54606	NC_017167	CGA	2	6	2516344	2516349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136361
54607	NC_017167	AAG	2	6	2516357	2516362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136361
54608	NC_017167	GTCGAA	2	12	2516365	2516376	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384136361
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54612	NC_017167	CTG	2	6	2516522	2516527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136361
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54614	NC_017167	GCCGGT	2	12	2516593	2516604	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384136361
54615	NC_017167	GC	3	6	2516639	2516644	0 %	0 %	50 %	50 %	384136361
54616	NC_017167	ACG	2	6	2516688	2516693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136361
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54618	NC_017167	GCG	2	6	2516752	2516757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136361
54619	NC_017167	GGC	2	6	2516803	2516808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136361
54620	NC_017167	CGT	2	6	2516896	2516901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136361
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54735	NC_017167	GAT	2	6	2521774	2521779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136366
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