MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53501	NC_017167	TCCT	2	8	2468658	2468665	0 %	50 %	0 %	50 %	384136309
53502	NC_017167	GTC	2	6	2468681	2468686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136309
53503	NC_017167	GC	3	6	2468777	2468782	0 %	0 %	50 %	50 %	384136309
53504	NC_017167	CTC	2	6	2468801	2468806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136309
53505	NC_017167	CCT	2	6	2468923	2468928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136309
53506	NC_017167	AGC	2	6	2469018	2469023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136309
53507	NC_017167	AGA	2	6	2469073	2469078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136309
53508	NC_017167	GTC	2	6	2469131	2469136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136309
53509	NC_017167	GCC	2	6	2469148	2469153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136309
53510	NC_017167	CAGC	2	8	2469167	2469174	25 %	0 %	25 %	50 %	384136309
53511	NC_017167	CAC	2	6	2469203	2469208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136309
53512	NC_017167	AAG	2	6	2469325	2469330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136309
53513	NC_017167	TCC	2	6	2469432	2469437	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136309
53514	NC_017167	GGAT	2	8	2469438	2469445	25 %	25 %	50 %	0 %	384136309
53515	NC_017167	CTG	2	6	2469480	2469485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136309
53516	NC_017167	GCGT	2	8	2469507	2469514	0 %	25 %	50 %	25 %	384136309
53517	NC_017167	CGC	2	6	2469524	2469529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136309
53518	NC_017167	CTT	2	6	2469568	2469573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136309
53519	NC_017167	TCC	2	6	2469607	2469612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53520	NC_017167	GGT	2	6	2469645	2469650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53521	NC_017167	ATG	2	6	2469696	2469701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53522	NC_017167	GGC	2	6	2469730	2469735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53523	NC_017167	ACG	2	6	2469864	2469869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136310
53524	NC_017167	CAT	2	6	2469889	2469894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136310
53525	NC_017167	ACA	2	6	2469918	2469923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384136310
53526	NC_017167	CGA	2	6	2469999	2470004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136310
53527	NC_017167	CGAAG	2	10	2470039	2470048	40 %	0 %	40 %	20 %	384136310
53528	NC_017167	CGGGAG	2	12	2470067	2470078	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384136310
53529	NC_017167	GAC	3	9	2470160	2470168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136310
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53531	NC_017167	CGG	2	6	2470270	2470275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136310
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53533	NC_017167	CAT	2	6	2470321	2470326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136310
53534	NC_017167	CGG	3	9	2470332	2470340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136310
53535	NC_017167	GTC	2	6	2470361	2470366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136310
53536	NC_017167	CGTT	2	8	2470390	2470397	0 %	50 %	25 %	25 %	384136310
53537	NC_017167	TGG	2	6	2470400	2470405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384136310
53538	NC_017167	GCAG	2	8	2470472	2470479	25 %	0 %	50 %	25 %	384136310
53539	NC_017167	CG	4	8	2470592	2470599	0 %	0 %	50 %	50 %	384136311
53540	NC_017167	TGA	2	6	2470641	2470646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136311
53541	NC_017167	ATCTCG	2	12	2470721	2470732	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384136311
53542	NC_017167	CCGT	2	8	2470733	2470740	0 %	25 %	25 %	50 %	384136311
53543	NC_017167	GCG	2	6	2470767	2470772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136311
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53545	NC_017167	GCC	2	6	2470797	2470802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136311
53546	NC_017167	CGC	2	6	2470803	2470808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136311
53547	NC_017167	GGCC	2	8	2470848	2470855	0 %	0 %	50 %	50 %	384136311
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53550	NC_017167	CGG	2	6	2471096	2471101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136311
53551	NC_017167	CGC	2	6	2471137	2471142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136311
53552	NC_017167	GTC	2	6	2471158	2471163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136311
53553	NC_017167	GGGAT	2	10	2471165	2471174	20 %	20 %	60 %	0 %	384136311
53554	NC_017167	CG	3	6	2471185	2471190	0 %	0 %	50 %	50 %	384136311
53555	NC_017167	GCG	2	6	2471226	2471231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136311
53556	NC_017167	CCGC	2	8	2471290	2471297	0 %	0 %	25 %	75 %	384136311
53557	NC_017167	ACG	3	9	2471366	2471374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136311
53558	NC_017167	GTA	2	6	2471440	2471445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136311
53559	NC_017167	CGT	2	6	2471493	2471498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136311
53560	NC_017167	CGA	2	6	2471550	2471555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136311
53561	NC_017167	AGA	3	9	2471648	2471656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53562	NC_017167	CGC	2	6	2471695	2471700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136312
53563	NC_017167	GATC	2	8	2471724	2471731	25 %	25 %	25 %	25 %	384136312
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53566	NC_017167	CG	4	8	2471886	2471893	0 %	0 %	50 %	50 %	384136312
53567	NC_017167	CAC	2	6	2471914	2471919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136312
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53570	NC_017167	ACG	2	6	2471987	2471992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136312
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53572	NC_017167	CGC	2	6	2472144	2472149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136312
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53582	NC_017167	CGG	2	6	2472477	2472482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53583	NC_017167	CGG	2	6	2472488	2472493	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53584	NC_017167	CA	3	6	2472565	2472570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53585	NC_017167	GCA	2	6	2472622	2472627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136313
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53587	NC_017167	ATC	2	6	2472726	2472731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136313
53588	NC_017167	GC	3	6	2472734	2472739	0 %	0 %	50 %	50 %	384136313
53589	NC_017167	CACCGC	2	12	2472785	2472796	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384136313
53590	NC_017167	CGGTG	2	10	2472844	2472853	0 %	20 %	60 %	20 %	384136313
53591	NC_017167	TGA	2	6	2472859	2472864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136313
53592	NC_017167	CCG	2	6	2472934	2472939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136313
53593	NC_017167	GGCGC	2	10	2472990	2472999	0 %	0 %	60 %	40 %	384136313
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53595	NC_017167	CTCG	2	8	2473244	2473251	0 %	25 %	25 %	50 %	384136313
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53598	NC_017167	AGT	2	6	2473414	2473419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136313
53599	NC_017167	CCTCGT	2	12	2473570	2473581	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384136313
53600	NC_017167	TG	3	6	2473590	2473595	0 %	50 %	50 %	0 %	384136313
53601	NC_017167	GATGTA	2	12	2473598	2473609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136313
53602	NC_017167	CGT	2	6	2473612	2473617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136313
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53605	NC_017167	GTT	2	6	2473718	2473723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384136313
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53614	NC_017167	GACGC	2	10	2474373	2474382	20 %	0 %	40 %	40 %	384136313
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53849	NC_017167	GCA	2	6	2484788	2484793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136325
53850	NC_017167	TGCG	2	8	2484849	2484856	0 %	25 %	50 %	25 %	384136325
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53954	NC_017167	CGA	2	6	2489874	2489879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136330
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53970	NC_017167	AGC	2	6	2490521	2490526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136331
53971	NC_017167	CGC	2	6	2490540	2490545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136331
53972	NC_017167	GTC	2	6	2490577	2490582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136331
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53974	NC_017167	ACGT	2	8	2490728	2490735	25 %	25 %	25 %	25 %	384136331
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53976	NC_017167	TCG	2	6	2490828	2490833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136331
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53981	NC_017167	GCATGG	2	12	2490954	2490965	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384136331
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53997	NC_017167	GCCGT	2	10	2491364	2491373	0 %	20 %	40 %	40 %	384136332
53998	NC_017167	CAATGC	2	12	2491428	2491439	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384136332
53999	NC_017167	GCG	2	6	2491451	2491456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136332
54000	NC_017167	CGT	2	6	2491503	2491508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136332

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