MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius Tc-4-1 chromosome

Total Repeats: 68347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52118	NC_017167	TCGCC	2	10	2404003	2404012	0 %	20 %	20 %	60 %	384136244
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52122	NC_017167	ACGCC	2	10	2404186	2404195	20 %	0 %	20 %	60 %	384136244
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52202	NC_017167	CG	3	6	2407421	2407426	0 %	0 %	50 %	50 %	384136247
52203	NC_017167	AGGC	2	8	2407458	2407465	25 %	0 %	50 %	25 %	384136247
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52206	NC_017167	CGG	2	6	2407598	2407603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136247
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52213	NC_017167	CGA	2	6	2407915	2407920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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52217	NC_017167	CGT	3	9	2408091	2408099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136248
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52220	NC_017167	GAA	2	6	2408224	2408229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136248
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52229	NC_017167	C	6	6	2408629	2408634	0 %	0 %	0 %	100 %	384136248
52230	NC_017167	ACC	2	6	2408674	2408679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136248
52231	NC_017167	CCA	2	6	2408762	2408767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136248
52232	NC_017167	CG	3	6	2408777	2408782	0 %	0 %	50 %	50 %	384136248
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52349	NC_017167	GC	3	6	2415297	2415302	0 %	0 %	50 %	50 %	384136253
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52351	NC_017167	C	6	6	2415396	2415401	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52352	NC_017167	ACC	2	6	2415453	2415458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136254
52353	NC_017167	CGA	2	6	2415462	2415467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136254
52354	NC_017167	GAA	2	6	2415496	2415501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384136254
52355	NC_017167	GAT	2	6	2415524	2415529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384136254
52356	NC_017167	CAC	2	6	2415539	2415544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136254
52357	NC_017167	AC	3	6	2415607	2415612	50 %	0 %	0 %	50 %	384136254
52358	NC_017167	CCG	2	6	2415642	2415647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136254
52359	NC_017167	GCC	2	6	2415659	2415664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384136254
52360	NC_017167	ACG	2	6	2415669	2415674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136254
52361	NC_017167	GT	3	6	2415733	2415738	0 %	50 %	50 %	0 %	384136254
52362	NC_017167	GA	3	6	2415819	2415824	50 %	0 %	50 %	0 %	384136254
52363	NC_017167	CCA	2	6	2415843	2415848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136254
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52366	NC_017167	AAC	2	6	2416101	2416106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384136254
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52373	NC_017167	TCC	2	6	2416529	2416534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384136256
52374	NC_017167	CGA	2	6	2416548	2416553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136256
52375	NC_017167	CCCT	2	8	2416559	2416566	0 %	25 %	0 %	75 %	384136256
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52380	NC_017167	CTG	2	6	2416765	2416770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136256
52381	NC_017167	ACG	2	6	2416902	2416907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136256
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52384	NC_017167	CGG	2	6	2417024	2417029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384136256
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52392	NC_017167	CGA	2	6	2417517	2417522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384136256
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52403	NC_017167	CTTA	2	8	2418066	2418073	25 %	50 %	0 %	25 %	384136257
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52417	NC_017167	CCT	2	6	2418856	2418861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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52435	NC_017167	GTTC	2	8	2419596	2419603	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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52437	NC_017167	A	6	6	2419658	2419663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52450	NC_017167	TCGT	2	8	2420170	2420177	0 %	50 %	25 %	25 %	384136260
52451	NC_017167	CGT	2	6	2420190	2420195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384136260
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52462	NC_017167	CAT	2	6	2420889	2420894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384136261
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52466	NC_017167	TCT	2	6	2421002	2421007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384136261
52467	NC_017167	CAC	2	6	2421058	2421063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384136261
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