MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acinetobacter baumannii 1656-2 plasmid ABKp2

Total Repeats: 175

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017164	TGAA	2	8	67	74	50 %	25 %	25 %	0 %	384133677
2	NC_017164	ACA	2	6	107	112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133677
3	NC_017164	ACA	3	9	131	139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133677
4	NC_017164	AAAG	2	8	141	148	75 %	0 %	25 %	0 %	384133677
5	NC_017164	A	6	6	220	225	100 %	0 %	0 %	0 %	384133677
6	NC_017164	ACA	2	6	288	293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133677
7	NC_017164	TGA	2	6	318	323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133677
8	NC_017164	CTA	2	6	376	381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133677
9	NC_017164	ACC	2	6	426	431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133677
10	NC_017164	T	7	7	564	570	0 %	100 %	0 %	0 %	384133677
11	NC_017164	ATT	2	6	591	596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017164	A	7	7	661	667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017164	TAT	2	6	752	757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017164	CCA	2	6	905	910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133678
15	NC_017164	TG	3	6	929	934	0 %	50 %	50 %	0 %	384133678
16	NC_017164	TCCA	2	8	937	944	25 %	25 %	0 %	50 %	384133678
17	NC_017164	A	6	6	953	958	100 %	0 %	0 %	0 %	384133678
18	NC_017164	AAT	2	6	968	973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133678
19	NC_017164	TAA	2	6	995	1000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133678
20	NC_017164	CTG	2	6	1153	1158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133678
21	NC_017164	A	7	7	1161	1167	100 %	0 %	0 %	0 %	384133678
22	NC_017164	AG	3	6	1189	1194	50 %	0 %	50 %	0 %	384133678
23	NC_017164	T	6	6	1204	1209	0 %	100 %	0 %	0 %	384133678
24	NC_017164	TAATT	2	10	1226	1235	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017164	AATA	2	8	1249	1256	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017164	ATA	3	9	1254	1262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017164	T	6	6	1284	1289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017164	ACT	2	6	1350	1355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133679
29	NC_017164	TAA	2	6	1356	1361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133679
30	NC_017164	T	6	6	1413	1418	0 %	100 %	0 %	0 %	384133679
31	NC_017164	CTT	2	6	1435	1440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384133679
32	NC_017164	AAT	2	6	1444	1449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133679
33	NC_017164	ATT	2	6	1500	1505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384133679
34	NC_017164	TA	3	6	1507	1512	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017164	T	6	6	1525	1530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017164	AGAC	2	8	1647	1654	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017164	GAA	2	6	1666	1671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017164	TGG	2	6	1715	1720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017164	TGA	2	6	1734	1739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017164	ATC	2	6	1753	1758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017164	GCAAG	2	10	1771	1780	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017164	CA	3	6	1824	1829	50 %	0 %	0 %	50 %	384133680
43	NC_017164	GCTT	2	8	1878	1885	0 %	50 %	25 %	25 %	384133680
44	NC_017164	TGA	2	6	1903	1908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133680
45	NC_017164	CAA	2	6	1991	1996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133680
46	NC_017164	CTTG	2	8	2024	2031	0 %	50 %	25 %	25 %	384133680
47	NC_017164	ATGA	2	8	2066	2073	50 %	25 %	25 %	0 %	384133680
48	NC_017164	ATGCT	2	10	2085	2094	20 %	40 %	20 %	20 %	384133680
49	NC_017164	A	6	6	2104	2109	100 %	0 %	0 %	0 %	384133680
50	NC_017164	TCA	2	6	2110	2115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133680
51	NC_017164	G	6	6	2159	2164	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017164	TAG	2	6	2186	2191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017164	TTATA	2	10	2212	2221	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017164	GTT	2	6	2239	2244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017164	TAAA	2	8	2251	2258	75 %	25 %	0 %	0 %	384133681
56	NC_017164	TAC	2	6	2327	2332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133681
57	NC_017164	TGA	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133681
58	NC_017164	ATTC	2	8	2484	2491	25 %	50 %	0 %	25 %	384133681
59	NC_017164	TAT	2	6	2522	2527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384133681
60	NC_017164	AGGA	2	8	2536	2543	50 %	0 %	50 %	0 %	384133681
61	NC_017164	AAT	2	6	2565	2570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133681
62	NC_017164	GTG	2	6	2656	2661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384133681
63	NC_017164	TAC	2	6	2762	2767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133681
64	NC_017164	CAG	2	6	2806	2811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133681
65	NC_017164	CTC	2	6	2887	2892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133681
66	NC_017164	AGA	2	6	2921	2926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133681
67	NC_017164	ATA	2	6	3025	3030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133681
68	NC_017164	ATG	2	6	3061	3066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133681
69	NC_017164	A	6	6	3149	3154	100 %	0 %	0 %	0 %	384133681
70	NC_017164	TAT	2	6	3165	3170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384133681
71	NC_017164	GATG	2	8	3179	3186	25 %	25 %	50 %	0 %	384133681
72	NC_017164	ATTA	2	8	3195	3202	50 %	50 %	0 %	0 %	384133681
73	NC_017164	TCA	2	6	3224	3229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133681
74	NC_017164	TC	3	6	3256	3261	0 %	50 %	0 %	50 %	384133681
75	NC_017164	ATG	2	6	3298	3303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133681
76	NC_017164	TA	3	6	3363	3368	50 %	50 %	0 %	0 %	384133681
77	NC_017164	ATT	2	6	3370	3375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384133681
78	NC_017164	T	6	6	3411	3416	0 %	100 %	0 %	0 %	384133681
79	NC_017164	ATA	2	6	3508	3513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133681
80	NC_017164	AAG	2	6	3538	3543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133681
81	NC_017164	ACC	2	6	3549	3554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384133681
82	NC_017164	CAG	2	6	3567	3572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133681
83	NC_017164	ACTTT	2	10	3637	3646	20 %	60 %	0 %	20 %	384133681
84	NC_017164	A	6	6	3700	3705	100 %	0 %	0 %	0 %	384133681
85	NC_017164	TAA	2	6	3731	3736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133681
86	NC_017164	A	7	7	3757	3763	100 %	0 %	0 %	0 %	384133681
87	NC_017164	TAA	2	6	3764	3769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133681
88	NC_017164	AAGA	2	8	3901	3908	75 %	0 %	25 %	0 %	384133681
89	NC_017164	CTA	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133681
90	NC_017164	AAT	2	6	4002	4007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133681
91	NC_017164	GAT	2	6	4032	4037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133681
92	NC_017164	TACT	2	8	4058	4065	25 %	50 %	0 %	25 %	384133681
93	NC_017164	TA	4	8	4083	4090	50 %	50 %	0 %	0 %	384133681
94	NC_017164	CTG	2	6	4171	4176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384133681
95	NC_017164	CT	3	6	4235	4240	0 %	50 %	0 %	50 %	384133681
96	NC_017164	CCT	2	6	4359	4364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384133681
97	NC_017164	TGA	2	6	4397	4402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133681
98	NC_017164	ATA	2	6	4447	4452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133681
99	NC_017164	CA	3	6	4527	4532	50 %	0 %	0 %	50 %	384133681
100	NC_017164	AAT	2	6	4557	4562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384133681
101	NC_017164	AT	3	6	4604	4609	50 %	50 %	0 %	0 %	384133681
102	NC_017164	GAA	2	6	4621	4626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133681
103	NC_017164	TTTAG	2	10	4629	4638	20 %	60 %	20 %	0 %	384133681
104	NC_017164	AGATA	2	10	4657	4666	60 %	20 %	20 %	0 %	384133681
105	NC_017164	TCT	2	6	4673	4678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017164	AGA	2	6	4692	4697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017164	GATTA	2	10	4713	4722	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017164	T	6	6	4759	4764	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017164	CAG	2	6	4782	4787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017164	T	7	7	4892	4898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017164	CT	3	6	4979	4984	0 %	50 %	0 %	50 %	384133682
112	NC_017164	CAA	2	6	4999	5004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133682
113	NC_017164	A	9	9	5003	5011	100 %	0 %	0 %	0 %	384133682
114	NC_017164	AAC	2	6	5024	5029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384133682
115	NC_017164	ACT	2	6	5088	5093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133682
116	NC_017164	ATG	2	6	5174	5179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133682
117	NC_017164	TGA	2	6	5211	5216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133682
118	NC_017164	GCA	2	6	5245	5250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384133682
119	NC_017164	TCA	2	6	5323	5328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384133682
120	NC_017164	TGA	2	6	5343	5348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384133682
121	NC_017164	TTGAT	2	10	5405	5414	20 %	60 %	20 %	0 %	384133682
122	NC_017164	TAAA	2	8	5498	5505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017164	AATC	2	8	5554	5561	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_017164	CAAA	2	8	5591	5598	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017164	AGC	2	6	5796	5801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017164	TG	3	6	5847	5852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017164	T	6	6	5860	5865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017164	TTA	2	6	5878	5883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017164	TGT	2	6	5907	5912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017164	TCAAT	2	10	5914	5923	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017164	GT	3	6	5993	5998	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017164	A	6	6	6002	6007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017164	T	6	6	6014	6019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017164	ATT	2	6	6035	6040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017164	TTATT	2	10	6083	6092	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017164	A	6	6	6164	6169	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017164	TG	3	6	6186	6191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017164	TA	3	6	6199	6204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017164	AAT	2	6	6205	6210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017164	AGA	2	6	6258	6263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017164	GAA	2	6	6271	6276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133683
142	NC_017164	A	7	7	6281	6287	100 %	0 %	0 %	0 %	384133683
143	NC_017164	AGA	2	6	6530	6535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384133683
144	NC_017164	TGAG	2	8	6625	6632	25 %	25 %	50 %	0 %	384133683
145	NC_017164	AT	3	6	6654	6659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017164	TCT	2	6	6678	6683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017164	A	6	6	6699	6704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017164	TAGG	2	8	6720	6727	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017164	TTA	2	6	6790	6795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017164	T	6	6	6810	6815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017164	AGCGA	2	10	6904	6913	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
152	NC_017164	A	7	7	6918	6924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017164	AGCGA	2	10	6931	6940	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
154	NC_017164	TTGCTT	2	12	6949	6960	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_017164	T	8	8	6959	6966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017164	A	6	6	6988	6993	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017164	ATT	2	6	7091	7096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017164	TAA	2	6	7268	7273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017164	TAT	2	6	7332	7337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017164	AATT	2	8	7350	7357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017164	AGCT	2	8	7381	7388	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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163	NC_017164	TTC	2	6	7419	7424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_017164	TTA	2	6	7475	7480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017164	TA	3	6	7499	7504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_017164	GATA	2	8	7571	7578	50 %	25 %	25 %	0 %	384133684
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172	NC_017164	TCA	2	6	7879	7884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_017164	AAAT	2	8	7938	7945	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_017164	A	6	6	7982	7987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_017164	A	6	6	8027	8032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.