MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p3

Total Repeats: 18098

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_016623	TGC	2	6	643394	643399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294061
18002	NC_016623	CGG	2	6	643431	643436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294061
18003	NC_016623	CGG	2	6	643476	643481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294061
18004	NC_016623	CGA	2	6	643500	643505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294061
18005	NC_016623	CCCG	2	8	643515	643522	0 %	0 %	25 %	75 %	374294061
18006	NC_016623	TCG	2	6	643541	643546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294061
18007	NC_016623	GGC	2	6	643680	643685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294061
18008	NC_016623	CGA	2	6	643728	643733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294061
18009	NC_016623	TGA	2	6	643751	643756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	374294061
18010	NC_016623	GGC	2	6	643774	643779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294061
18011	NC_016623	CGGC	2	8	643789	643796	0 %	0 %	50 %	50 %	374294061
18012	NC_016623	CGG	2	6	643827	643832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	374294061
18013	NC_016623	GATG	2	8	643863	643870	25 %	25 %	50 %	0 %	374294061
18014	NC_016623	CGA	2	6	643905	643910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294061
18015	NC_016623	ATC	2	6	643942	643947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	374294061
18016	NC_016623	ACG	3	9	644051	644059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	374294061
18017	NC_016623	GCC	2	6	644071	644076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	374294061
18018	NC_016623	A	6	6	644094	644099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18019	NC_016623	TGG	2	6	644106	644111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18020	NC_016623	A	6	6	644114	644119	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18021	NC_016623	ACG	2	6	644170	644175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18022	NC_016623	GCC	2	6	644181	644186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18023	NC_016623	CGAC	2	8	644197	644204	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18024	NC_016623	CGGG	2	8	644282	644289	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18025	NC_016623	GGC	3	9	644332	644340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18026	NC_016623	GAAC	2	8	644526	644533	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18027	NC_016623	GGC	2	6	644537	644542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18028	NC_016623	CGA	2	6	644742	644747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18029	NC_016623	GAT	2	6	644767	644772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18030	NC_016623	GCA	2	6	644816	644821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18031	NC_016623	GTGA	2	8	644869	644876	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18032	NC_016623	CGA	2	6	644911	644916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18033	NC_016623	TGA	2	6	644917	644922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18034	NC_016623	GAA	2	6	644934	644939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18035	NC_016623	CAG	2	6	644959	644964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18036	NC_016623	GTT	2	6	644990	644995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18037	NC_016623	GGC	2	6	645024	645029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18038	NC_016623	TGG	2	6	645109	645114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18039	NC_016623	GAA	2	6	645151	645156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18040	NC_016623	GGC	2	6	645170	645175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18041	NC_016623	GGAC	2	8	645181	645188	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18042	NC_016623	TGCA	2	8	645279	645286	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18043	NC_016623	CGC	2	6	645296	645301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18044	NC_016623	GA	3	6	645452	645457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18045	NC_016623	TTC	2	6	645463	645468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18046	NC_016623	TGC	2	6	645492	645497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18047	NC_016623	GTC	2	6	645504	645509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18048	NC_016623	TCGTG	2	10	645513	645522	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18049	NC_016623	CAT	2	6	645572	645577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18050	NC_016623	TGG	2	6	645592	645597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18051	NC_016623	CCG	2	6	645600	645605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18052	NC_016623	GGA	2	6	645616	645621	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18053	NC_016623	AC	3	6	645667	645672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18054	NC_016623	CGC	2	6	645805	645810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18055	NC_016623	AC	3	6	645835	645840	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18056	NC_016623	CCT	2	6	645978	645983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18057	NC_016623	GCC	3	9	646038	646046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18058	NC_016623	ACGG	2	8	646090	646097	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18059	NC_016623	TAG	2	6	646100	646105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18060	NC_016623	GC	4	8	646120	646127	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18061	NC_016623	TCC	2	6	646156	646161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18062	NC_016623	CCA	2	6	646167	646172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18063	NC_016623	AGG	2	6	646241	646246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	374294062
18064	NC_016623	TCG	2	6	646247	646252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	374294062
18065	NC_016623	CCA	2	6	646271	646276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	374294062
18066	NC_016623	GGAA	2	8	646336	646343	50 %	0 %	50 %	0 %	374294062
18067	NC_016623	GC	3	6	646373	646378	0 %	0 %	50 %	50 %	374294062
18068	NC_016623	ACGGG	2	10	646401	646410	20 %	0 %	60 %	20 %	374294062
18069	NC_016623	CTC	2	6	646452	646457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18070	NC_016623	GC	3	6	646476	646481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18071	NC_016623	CGG	2	6	646502	646507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18072	NC_016623	TGG	2	6	646606	646611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18073	NC_016623	GGA	2	6	646791	646796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18074	NC_016623	TAG	2	6	646820	646825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18075	NC_016623	GCGA	2	8	646828	646835	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18076	NC_016623	G	6	6	646974	646979	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18077	NC_016623	ACC	2	6	646980	646985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18078	NC_016623	CTC	2	6	647001	647006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18079	NC_016623	TGA	2	6	647249	647254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18080	NC_016623	GGA	2	6	647294	647299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18081	NC_016623	AATCA	2	10	647357	647366	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18082	NC_016623	G	6	6	647422	647427	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18083	NC_016623	G	6	6	647447	647452	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18084	NC_016623	CAGA	2	8	647506	647513	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18085	NC_016623	GGTG	2	8	647515	647522	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
18086	NC_016623	TCG	2	6	647533	647538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18087	NC_016623	AGG	2	6	647620	647625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18088	NC_016623	AGC	2	6	647636	647641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18089	NC_016623	AAAG	2	8	647650	647657	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
18090	NC_016623	GCC	2	6	647797	647802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18091	NC_016623	CCG	2	6	648053	648058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18092	NC_016623	GA	3	6	648115	648120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18093	NC_016623	GAA	2	6	648162	648167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18094	NC_016623	G	6	6	648197	648202	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18095	NC_016623	CA	3	6	648255	648260	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18096	NC_016623	AGAGG	2	10	648305	648314	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
18097	NC_016623	TTGAA	2	10	648323	648332	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
18098	NC_016623	CGG	2	6	648344	648349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.