MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p2

Total Repeats: 25658

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7003	NC_016618	CGGTGA	2	12	244789	244800	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	392383896
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7005	NC_016618	GTGC	2	8	244853	244860	0 %	25 %	50 %	25 %	392383896
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7124	NC_016618	AACGA	2	10	249742	249751	60 %	0 %	20 %	20 %	392383900
7125	NC_016618	ACCG	2	8	249797	249804	25 %	0 %	25 %	50 %	392383900
7126	NC_016618	AAG	2	6	249894	249899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392383901
7127	NC_016618	CAG	2	6	249911	249916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383901
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7131	NC_016618	GTC	2	6	250076	250081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383901
7132	NC_016618	CGGTAG	2	12	250137	250148	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	392383901
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7134	NC_016618	GAG	2	6	250245	250250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7135	NC_016618	GTC	2	6	250273	250278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7136	NC_016618	CGA	2	6	250299	250304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7138	NC_016618	GTTC	2	8	250584	250591	0 %	50 %	25 %	25 %	392383902
7139	NC_016618	CG	3	6	250728	250733	0 %	0 %	50 %	50 %	392383902
7140	NC_016618	CG	3	6	250746	250751	0 %	0 %	50 %	50 %	392383902
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7156	NC_016618	G	6	6	251288	251293	0 %	0 %	100 %	0 %	392383903
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7180	NC_016618	GGCC	2	8	252218	252225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7181	NC_016618	CGG	2	6	252265	252270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383904
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7246	NC_016618	GCA	2	6	255053	255058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383906
7247	NC_016618	TGA	2	6	255065	255070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392383906
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7249	NC_016618	GGC	2	6	255139	255144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383906
7250	NC_016618	GGCC	2	8	255159	255166	0 %	0 %	50 %	50 %	392383906
7251	NC_016618	C	7	7	255165	255171	0 %	0 %	0 %	100 %	392383906
7252	NC_016618	GC	3	6	255256	255261	0 %	0 %	50 %	50 %	392383906
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7258	NC_016618	GGA	2	6	255405	255410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7259	NC_016618	CAT	2	6	255506	255511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392383907
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7330	NC_016618	TCG	2	6	257693	257698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383909
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7332	NC_016618	CCG	2	6	257754	257759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383909
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7344	NC_016618	ATC	2	6	258154	258159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392383909
7345	NC_016618	CGG	2	6	258215	258220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383909
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7347	NC_016618	TTC	2	6	258301	258306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392383909
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7349	NC_016618	GGT	2	6	258333	258338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392383909
7350	NC_016618	GGCG	2	8	258360	258367	0 %	0 %	75 %	25 %	392383909
7351	NC_016618	GC	3	6	258394	258399	0 %	0 %	50 %	50 %	392383909
7352	NC_016618	TGACG	2	10	258407	258416	20 %	20 %	40 %	20 %	392383909
7353	NC_016618	CCG	2	6	258420	258425	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7354	NC_016618	CTC	2	6	258426	258431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7355	NC_016618	CG	3	6	258442	258447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7356	NC_016618	GCACT	2	10	258469	258478	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7357	NC_016618	GTC	2	6	258554	258559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383910
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7359	NC_016618	GC	3	6	258601	258606	0 %	0 %	50 %	50 %	392383910
7360	NC_016618	GCG	2	6	258686	258691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383910
7361	NC_016618	TGA	2	6	258698	258703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392383910
7362	NC_016618	CGG	2	6	258710	258715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7363	NC_016618	CGCGT	2	10	258728	258737	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7364	NC_016618	CAA	2	6	258786	258791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7365	NC_016618	GAC	2	6	258885	258890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383911
7366	NC_016618	GTTCAC	2	12	259088	259099	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	392383911
7367	NC_016618	TCC	3	9	259143	259151	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392383911
7368	NC_016618	CGG	2	6	259182	259187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383911
7369	NC_016618	CAT	2	6	259217	259222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392383911
7370	NC_016618	CAG	2	6	259268	259273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383911
7371	NC_016618	CAC	2	6	259292	259297	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392383911
7372	NC_016618	GTG	2	6	259307	259312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392383911
7373	NC_016618	CCG	2	6	259352	259357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383911
7374	NC_016618	CGT	2	6	259361	259366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383911
7375	NC_016618	CGG	2	6	259393	259398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383911
7376	NC_016618	CGC	2	6	259438	259443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7377	NC_016618	GGCGG	2	10	259444	259453	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
7378	NC_016618	CGG	2	6	259598	259603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383912
7379	NC_016618	CGC	2	6	259628	259633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383912
7380	NC_016618	GCC	2	6	259634	259639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383912
7381	NC_016618	CGC	2	6	259652	259657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383912
7382	NC_016618	CAG	2	6	259761	259766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383912
7383	NC_016618	GCC	2	6	259807	259812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383912
7384	NC_016618	CG	3	6	259816	259821	0 %	0 %	50 %	50 %	392383912
7385	NC_016618	CGG	3	9	259843	259851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383912
7386	NC_016618	CGGC	2	8	259916	259923	0 %	0 %	50 %	50 %	392383912
7387	NC_016618	CCG	2	6	259933	259938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383912
7388	NC_016618	C	6	6	259947	259952	0 %	0 %	0 %	100 %	392383912
7389	NC_016618	GCG	2	6	259989	259994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383912
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7391	NC_016618	GC	3	6	260116	260121	0 %	0 %	50 %	50 %	392383912
7392	NC_016618	GCC	2	6	260333	260338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383912
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7394	NC_016618	CCGA	2	8	260370	260377	25 %	0 %	25 %	50 %	392383912
7395	NC_016618	CCA	2	6	260387	260392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392383912
7396	NC_016618	ACTCCA	2	12	260393	260404	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	392383912
7397	NC_016618	G	6	6	260405	260410	0 %	0 %	100 %	0 %	392383912
7398	NC_016618	CGG	2	6	260421	260426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383912
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7400	NC_016618	GAC	2	6	260532	260537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383912
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7403	NC_016618	CGGC	2	8	260746	260753	0 %	0 %	50 %	50 %	392383912
7404	NC_016618	CAGCCG	2	12	260810	260821	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	392383912
7405	NC_016618	GC	3	6	260854	260859	0 %	0 %	50 %	50 %	392383912
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7418	NC_016618	CTG	2	6	261225	261230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383912
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7423	NC_016618	CAC	2	6	261491	261496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392383912
7424	NC_016618	CG	3	6	261547	261552	0 %	0 %	50 %	50 %	392383912
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7427	NC_016618	CCG	2	6	261643	261648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383912
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7430	NC_016618	GGAC	2	8	261734	261741	25 %	0 %	50 %	25 %	392383912
7431	NC_016618	CCG	2	6	261757	261762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383912
7432	NC_016618	CGC	2	6	261797	261802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383912
7433	NC_016618	AC	3	6	261826	261831	50 %	0 %	0 %	50 %	392383912
7434	NC_016618	TC	3	6	261876	261881	0 %	50 %	0 %	50 %	392383912
7435	NC_016618	GCTGAC	2	12	261893	261904	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	392383912
7436	NC_016618	CCG	2	6	261923	261928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383912
7437	NC_016618	TCG	2	6	261964	261969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383912
7438	NC_016618	CGG	2	6	261975	261980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383912
7439	NC_016618	C	6	6	262028	262033	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7440	NC_016618	GCGG	2	8	262041	262048	0 %	0 %	75 %	25 %	392383913
7441	NC_016618	AGC	2	6	262054	262059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383913
7442	NC_016618	GC	3	6	262058	262063	0 %	0 %	50 %	50 %	392383913
7443	NC_016618	GCA	2	6	262088	262093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383913
7444	NC_016618	CCA	2	6	262109	262114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392383913
7445	NC_016618	CGT	2	6	262133	262138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383913
7446	NC_016618	CGC	2	6	262142	262147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383913
7447	NC_016618	CGG	2	6	262168	262173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383913
7448	NC_016618	CAG	2	6	262209	262214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383913
7449	NC_016618	GTC	2	6	262239	262244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383913
7450	NC_016618	CAGGA	2	10	262267	262276	40 %	0 %	40 %	20 %	392383913
7451	NC_016618	CG	4	8	262292	262299	0 %	0 %	50 %	50 %	392383913
7452	NC_016618	CTG	2	6	262335	262340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383913
7453	NC_016618	CTC	2	6	262362	262367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392383913
7454	NC_016618	CGG	3	9	262376	262384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392383913
7455	NC_016618	CAGC	2	8	262406	262413	25 %	0 %	25 %	50 %	392383913
7456	NC_016618	CGT	2	6	262430	262435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383913
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7458	NC_016618	CG	3	6	262504	262509	0 %	0 %	50 %	50 %	392383913
7459	NC_016618	CCGCGA	2	12	262517	262528	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	392383913
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7463	NC_016618	CGC	2	6	262652	262657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383913
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7468	NC_016618	GTC	2	6	262902	262907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383913
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7470	NC_016618	CCT	2	6	262949	262954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392383913
7471	NC_016618	GCAGGC	2	12	262961	262972	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	392383913
7472	NC_016618	CCG	2	6	262979	262984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383913
7473	NC_016618	GTC	3	9	263001	263009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383913
7474	NC_016618	GC	3	6	263035	263040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7475	NC_016618	CGC	2	6	263106	263111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7476	NC_016618	CCG	2	6	263119	263124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7477	NC_016618	TCGT	2	8	263148	263155	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7478	NC_016618	GTC	2	6	263160	263165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7479	NC_016618	CGG	2	6	263189	263194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7480	NC_016618	GTC	2	6	263196	263201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7481	NC_016618	C	6	6	263249	263254	0 %	0 %	0 %	100 %	392383914
7482	NC_016618	TCC	2	6	263257	263262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392383914
7483	NC_016618	CCT	2	6	263283	263288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392383914
7484	NC_016618	GCT	2	6	263304	263309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383914
7485	NC_016618	CCG	2	6	263312	263317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383914
7486	NC_016618	CTG	2	6	263323	263328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383914
7487	NC_016618	GGGC	2	8	263337	263344	0 %	0 %	75 %	25 %	392383914
7488	NC_016618	GCT	2	6	263358	263363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383914
7489	NC_016618	GCC	2	6	263365	263370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383914
7490	NC_016618	GC	3	6	263438	263443	0 %	0 %	50 %	50 %	392383914
7491	NC_016618	CG	3	6	263505	263510	0 %	0 %	50 %	50 %	392383914
7492	NC_016618	ACG	2	6	263603	263608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392383914
7493	NC_016618	CGC	2	6	263642	263647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392383914
7494	NC_016618	GCT	2	6	263694	263699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383914
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7498	NC_016618	CG	3	6	263798	263803	0 %	0 %	50 %	50 %	392383914
7499	NC_016618	CGCT	2	8	263833	263840	0 %	25 %	25 %	50 %	392383914
7500	NC_016618	TCG	3	9	263960	263968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392383914

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