MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p4

Total Repeats: 19977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016596	CGC	2	6	19	24	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379716
2	NC_016596	GCA	2	6	42	47	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392379716
3	NC_016596	CCT	2	6	60	65	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392379716
4	NC_016596	CAC	2	6	67	72	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392379716
5	NC_016596	ATC	2	6	101	106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392379716
6	NC_016596	CGC	2	6	126	131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379716
7	NC_016596	TGT	2	6	132	137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392379716
8	NC_016596	CGG	2	6	183	188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392379716
9	NC_016596	TCG	2	6	215	220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392379716
10	NC_016596	GGC	2	6	235	240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392379716
11	NC_016596	CAG	2	6	292	297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392379716
12	NC_016596	CGC	2	6	360	365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379716
13	NC_016596	CCG	2	6	372	377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379716
14	NC_016596	CGC	2	6	436	441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379716
15	NC_016596	CCG	2	6	448	453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379716
16	NC_016596	GCC	2	6	562	567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379716
17	NC_016596	CG	3	6	600	605	0 %	0 %	50 %	50 %	392379716
18	NC_016596	CAG	2	6	610	615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392379716
19	NC_016596	CTC	2	6	625	630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392379716
20	NC_016596	CGC	2	6	657	662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379716
21	NC_016596	TGA	2	6	741	746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392379716
22	NC_016596	GCC	2	6	769	774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379716
23	NC_016596	TGG	2	6	834	839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392379716
24	NC_016596	CCG	2	6	896	901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379716
25	NC_016596	GC	3	6	937	942	0 %	0 %	50 %	50 %	392379716
26	NC_016596	GCG	2	6	958	963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392379716
27	NC_016596	TCA	2	6	978	983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392379716
28	NC_016596	CACC	2	8	1029	1036	25 %	0 %	0 %	75 %	392379716
29	NC_016596	CGG	2	6	1143	1148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392379716
30	NC_016596	TCG	2	6	1151	1156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392379716
31	NC_016596	CCG	2	6	1173	1178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379716
32	NC_016596	TCCG	2	8	1242	1249	0 %	25 %	25 %	50 %	392379716
33	NC_016596	CTT	2	6	1295	1300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016596	AGCA	2	8	1329	1336	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016596	CCGT	2	8	1397	1404	0 %	25 %	25 %	50 %	392379717
36	NC_016596	TGG	2	6	1413	1418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392379717
37	NC_016596	CGC	2	6	1457	1462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379717
38	NC_016596	TGA	2	6	1492	1497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392379717
39	NC_016596	CGGCG	2	10	1502	1511	0 %	0 %	60 %	40 %	392379718
40	NC_016596	CCA	2	6	1530	1535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392379718
41	NC_016596	TCC	2	6	1598	1603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392379718
42	NC_016596	CGC	2	6	1606	1611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379718
43	NC_016596	TGA	2	6	1662	1667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392379718
44	NC_016596	GCA	2	6	1676	1681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392379718
45	NC_016596	GGCC	2	8	1711	1718	0 %	0 %	50 %	50 %	392379718
46	NC_016596	TTGT	2	8	1735	1742	0 %	75 %	25 %	0 %	392379718
47	NC_016596	TCCA	2	8	1790	1797	25 %	25 %	0 %	50 %	392379718
48	NC_016596	CGC	2	6	1840	1845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379718
49	NC_016596	TCC	2	6	1851	1856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392379718
50	NC_016596	CGG	3	9	2026	2034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392379718
51	NC_016596	GCT	3	9	2035	2043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392379718
52	NC_016596	CGG	2	6	2047	2052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392379718
53	NC_016596	GGC	2	6	2065	2070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392379718
54	NC_016596	ATG	2	6	2075	2080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392379718
55	NC_016596	GCG	2	6	2088	2093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392379718
56	NC_016596	ATCGTG	2	12	2096	2107	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	392379718
57	NC_016596	CCA	2	6	2187	2192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392379718
58	NC_016596	GC	3	6	2218	2223	0 %	0 %	50 %	50 %	392379718
59	NC_016596	CGG	2	6	2228	2233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392379718
60	NC_016596	CTG	2	6	2255	2260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392379718
61	NC_016596	CGG	2	6	2304	2309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392379718
62	NC_016596	GTG	2	6	2318	2323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392379718
63	NC_016596	CGG	2	6	2340	2345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392379718
64	NC_016596	GCG	2	6	2427	2432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392379718
65	NC_016596	CGC	2	6	2433	2438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379718
66	NC_016596	CGG	2	6	2452	2457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392379718
67	NC_016596	ATG	2	6	2465	2470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392379718
68	NC_016596	GAT	2	6	2476	2481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392379718
69	NC_016596	CGG	3	9	2488	2496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392379718
70	NC_016596	CG	3	6	2543	2548	0 %	0 %	50 %	50 %	392379718
71	NC_016596	CGG	3	9	2556	2564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392379718
72	NC_016596	TCA	2	6	2574	2579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392379718
73	NC_016596	GCC	2	6	2631	2636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379718
74	NC_016596	CTG	2	6	2663	2668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392379718
75	NC_016596	ATGGCG	2	12	2696	2707	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	392379718
76	NC_016596	GC	3	6	2715	2720	0 %	0 %	50 %	50 %	392379718
77	NC_016596	GAT	2	6	2794	2799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392379718
78	NC_016596	CTT	2	6	2807	2812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392379718
79	NC_016596	CGC	2	6	2836	2841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379718
80	NC_016596	GCC	2	6	2845	2850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379718
81	NC_016596	CAT	2	6	2871	2876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392379720
82	NC_016596	GCCA	2	8	2880	2887	25 %	0 %	25 %	50 %	392379720
83	NC_016596	GGCC	2	8	2888	2895	0 %	0 %	50 %	50 %	392379720
84	NC_016596	CGG	2	6	2912	2917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392379720
85	NC_016596	CCG	2	6	2920	2925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379720
86	NC_016596	GGC	2	6	2930	2935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392379720
87	NC_016596	CGC	2	6	2945	2950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379720
88	NC_016596	CGT	2	6	2960	2965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392379720
89	NC_016596	CGG	2	6	2987	2992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392379720
90	NC_016596	GGCGG	2	10	3051	3060	0 %	0 %	80 %	20 %	392379720
91	NC_016596	GCCACG	2	12	3091	3102	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	392379720
92	NC_016596	GGC	2	6	3128	3133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392379720
93	NC_016596	GCCGCT	2	12	3201	3212	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	392379720
94	NC_016596	GGA	2	6	3225	3230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392379720
95	NC_016596	GCG	2	6	3348	3353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392379721
96	NC_016596	AGC	2	6	3381	3386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392379721
97	NC_016596	CGC	2	6	3394	3399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379721
98	NC_016596	GGC	2	6	3415	3420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392379721
99	NC_016596	CGC	2	6	3454	3459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379721
100	NC_016596	CGG	2	6	3468	3473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392379721
101	NC_016596	GC	3	6	3481	3486	0 %	0 %	50 %	50 %	392379721
102	NC_016596	GC	3	6	3489	3494	0 %	0 %	50 %	50 %	392379721
103	NC_016596	CGG	2	6	3504	3509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392379721
104	NC_016596	GCC	2	6	3534	3539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379721
105	NC_016596	GTCG	2	8	3547	3554	0 %	25 %	50 %	25 %	392379721
106	NC_016596	ACC	2	6	3579	3584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392379721
107	NC_016596	CGC	2	6	3585	3590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379721
108	NC_016596	TGA	2	6	3612	3617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392379721
109	NC_016596	CCGCGA	2	12	3712	3723	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	392379721
110	NC_016596	CGA	2	6	3769	3774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392379721
111	NC_016596	GGC	2	6	3793	3798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392379721
112	NC_016596	CCGCGC	2	12	3808	3819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379721
113	NC_016596	CCT	2	6	3978	3983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392379721
114	NC_016596	GGA	2	6	3994	3999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392379721
115	NC_016596	CGA	2	6	4066	4071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392379721
116	NC_016596	GCA	2	6	4077	4082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392379721
117	NC_016596	GCC	2	6	4127	4132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379721
118	NC_016596	TCT	2	6	4134	4139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392379721
119	NC_016596	GCC	2	6	4172	4177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379721
120	NC_016596	GCT	2	6	4195	4200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392379721
121	NC_016596	CGC	2	6	4267	4272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379721
122	NC_016596	GCT	2	6	4300	4305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392379721
123	NC_016596	CGC	2	6	4405	4410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379721
124	NC_016596	ACC	2	6	4431	4436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_016596	TCAAA	2	10	4450	4459	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_016596	GAC	2	6	4472	4477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016596	TGC	2	6	4503	4508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392379722
128	NC_016596	GCT	2	6	4519	4524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392379722
129	NC_016596	CGC	2	6	4594	4599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392379722
130	NC_016596	GC	3	6	4623	4628	0 %	0 %	50 %	50 %	392379722
131	NC_016596	GGA	2	6	4636	4641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392379722
132	NC_016596	CGG	2	6	4657	4662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392379722
133	NC_016596	AAG	2	6	4673	4678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392379722
134	NC_016596	ATC	2	6	4688	4693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392379722
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