MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidaminococcus intestini RyC-MR95 chromosome

Total Repeats: 49107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_016077	TCTT	2	8	2233043	2233050	0 %	75 %	0 %	25 %	352685560
44003	NC_016077	TCT	2	6	2233063	2233068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352685560
44004	NC_016077	AGT	2	6	2233085	2233090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685560
44005	NC_016077	TCA	2	6	2233118	2233123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352685560
44006	NC_016077	CCT	2	6	2233185	2233190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44007	NC_016077	AT	3	6	2233200	2233205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44008	NC_016077	GCC	2	6	2233232	2233237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44009	NC_016077	AGGC	2	8	2233269	2233276	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44010	NC_016077	TTG	2	6	2233342	2233347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352685561
44011	NC_016077	TGG	3	9	2233388	2233396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352685561
44012	NC_016077	CAG	2	6	2233482	2233487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352685561
44013	NC_016077	CGGTA	2	10	2233544	2233553	20 %	20 %	40 %	20 %	352685561
44014	NC_016077	GAG	2	6	2233647	2233652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352685561
44015	NC_016077	GGC	2	6	2233661	2233666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352685561
44016	NC_016077	CAT	2	6	2233677	2233682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352685561
44017	NC_016077	GCC	2	6	2233719	2233724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352685561
44018	NC_016077	CAA	2	6	2233754	2233759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352685561
44019	NC_016077	CTT	2	6	2233964	2233969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352685561
44020	NC_016077	GCA	2	6	2234005	2234010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352685561
44021	NC_016077	CTT	2	6	2234019	2234024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352685561
44022	NC_016077	TCC	2	6	2234049	2234054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44023	NC_016077	GTG	2	6	2234057	2234062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44024	NC_016077	TCT	2	6	2234103	2234108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352685562
44025	NC_016077	TGC	2	6	2234122	2234127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685562
44026	NC_016077	AGC	2	6	2234153	2234158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352685562
44027	NC_016077	TCG	2	6	2234227	2234232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685562
44028	NC_016077	CAG	2	6	2234296	2234301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352685562
44029	NC_016077	GAG	2	6	2234305	2234310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352685562
44030	NC_016077	TGA	2	6	2234317	2234322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685562
44031	NC_016077	GAT	2	6	2234363	2234368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685562
44032	NC_016077	ATG	2	6	2234418	2234423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685562
44033	NC_016077	AGG	2	6	2234456	2234461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352685562
44034	NC_016077	CAG	2	6	2234479	2234484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352685562
44035	NC_016077	CTTT	2	8	2234512	2234519	0 %	75 %	0 %	25 %	352685562
44036	NC_016077	CCT	2	6	2234535	2234540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44037	NC_016077	GA	3	6	2234564	2234569	50 %	0 %	50 %	0 %	352685563
44038	NC_016077	CTG	2	6	2234625	2234630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685563
44039	NC_016077	TCG	2	6	2234632	2234637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685563
44040	NC_016077	CTTC	2	8	2234747	2234754	0 %	50 %	0 %	50 %	352685563
44041	NC_016077	GTC	2	6	2234877	2234882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685563
44042	NC_016077	CTG	2	6	2234937	2234942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685563
44043	NC_016077	GTC	2	6	2234943	2234948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685563
44044	NC_016077	ATGA	2	8	2235069	2235076	50 %	25 %	25 %	0 %	352685563
44045	NC_016077	GAC	2	6	2235171	2235176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352685564
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44050	NC_016077	CCG	2	6	2235285	2235290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352685564
44051	NC_016077	GAGT	2	8	2235307	2235314	25 %	25 %	50 %	0 %	352685564
44052	NC_016077	CTT	2	6	2235389	2235394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352685565
44053	NC_016077	TTC	2	6	2235417	2235422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352685565
44054	NC_016077	TTC	2	6	2235426	2235431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352685565
44055	NC_016077	TTG	2	6	2235489	2235494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352685565
44056	NC_016077	TA	3	6	2235548	2235553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44057	NC_016077	GACC	2	8	2235595	2235602	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44058	NC_016077	ATT	2	6	2235643	2235648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352685566
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44078	NC_016077	GTC	2	6	2236752	2236757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685566
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44081	NC_016077	TGA	2	6	2236999	2237004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44082	NC_016077	CGA	2	6	2237119	2237124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44083	NC_016077	TGG	2	6	2237152	2237157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44084	NC_016077	GGC	2	6	2237189	2237194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44085	NC_016077	GAA	2	6	2237370	2237375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44086	NC_016077	A	6	6	2237396	2237401	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44087	NC_016077	T	7	7	2237410	2237416	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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44092	NC_016077	CCA	2	6	2237686	2237691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352685567
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44102	NC_016077	TGA	2	6	2238209	2238214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685567
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44104	NC_016077	GAAA	2	8	2238345	2238352	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44105	NC_016077	T	7	7	2238401	2238407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44106	NC_016077	A	7	7	2238425	2238431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44107	NC_016077	TCC	2	6	2238495	2238500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352685568
44108	NC_016077	TGA	2	6	2238533	2238538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685568
44109	NC_016077	CTT	2	6	2238552	2238557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352685568
44110	NC_016077	AGGC	2	8	2238620	2238627	25 %	0 %	50 %	25 %	352685568
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44117	NC_016077	CGA	2	6	2239155	2239160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352685568
44118	NC_016077	CGC	2	6	2239212	2239217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352685568
44119	NC_016077	CAATGA	2	12	2239218	2239229	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	352685568
44120	NC_016077	CAT	2	6	2239266	2239271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352685568
44121	NC_016077	CTG	2	6	2239299	2239304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685568
44122	NC_016077	TGTT	2	8	2239341	2239348	0 %	75 %	25 %	0 %	352685568
44123	NC_016077	CGC	2	6	2239365	2239370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352685568
44124	NC_016077	T	7	7	2239404	2239410	0 %	100 %	0 %	0 %	352685568
44125	NC_016077	ATC	2	6	2239414	2239419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352685568
44126	NC_016077	ACG	2	6	2239487	2239492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352685568
44127	NC_016077	T	6	6	2239557	2239562	0 %	100 %	0 %	0 %	352685568
44128	NC_016077	GGAT	2	8	2239623	2239630	25 %	25 %	50 %	0 %	352685569
44129	NC_016077	GC	3	6	2239706	2239711	0 %	0 %	50 %	50 %	352685569
44130	NC_016077	ATG	2	6	2239798	2239803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685569
44131	NC_016077	AAG	2	6	2239807	2239812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352685569
44132	NC_016077	GAA	2	6	2239857	2239862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352685569
44133	NC_016077	TAA	2	6	2239881	2239886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352685569
44134	NC_016077	GCT	2	6	2239925	2239930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685569
44135	NC_016077	CAA	2	6	2239974	2239979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352685569
44136	NC_016077	CTT	2	6	2240013	2240018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352685569
44137	NC_016077	TCA	2	6	2240027	2240032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352685569
44138	NC_016077	CCT	2	6	2240053	2240058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44139	NC_016077	GTG	2	6	2240134	2240139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44140	NC_016077	T	6	6	2240151	2240156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44141	NC_016077	GGC	2	6	2240239	2240244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352685570
44142	NC_016077	GAG	3	9	2240248	2240256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352685570
44143	NC_016077	TTG	2	6	2240261	2240266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352685570
44144	NC_016077	TGT	2	6	2240397	2240402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352685570
44145	NC_016077	CCT	2	6	2240478	2240483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352685570
44146	NC_016077	CCA	2	6	2240522	2240527	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352685570
44147	NC_016077	TCA	2	6	2240558	2240563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352685570
44148	NC_016077	ATC	2	6	2240729	2240734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352685570
44149	NC_016077	ATC	2	6	2240749	2240754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352685570
44150	NC_016077	T	8	8	2240789	2240796	0 %	100 %	0 %	0 %	352685570
44151	NC_016077	AGCA	2	8	2240815	2240822	50 %	0 %	25 %	25 %	352685570
44152	NC_016077	TCC	2	6	2240849	2240854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352685570
44153	NC_016077	CCATC	2	10	2240910	2240919	20 %	20 %	0 %	60 %	352685570
44154	NC_016077	CCT	2	6	2240921	2240926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352685571
44155	NC_016077	TGA	2	6	2240943	2240948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685571
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44157	NC_016077	ACA	2	6	2241092	2241097	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352685571
44158	NC_016077	CCAT	2	8	2241143	2241150	25 %	25 %	0 %	50 %	352685571
44159	NC_016077	CAA	2	6	2241159	2241164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352685571
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44161	NC_016077	CGG	2	6	2241318	2241323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352685571
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44165	NC_016077	ACG	2	6	2241467	2241472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352685571
44166	NC_016077	TGA	2	6	2241476	2241481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685571
44167	NC_016077	TTC	2	6	2241565	2241570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352685571
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44169	NC_016077	CTT	2	6	2241737	2241742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44170	NC_016077	CTT	2	6	2241744	2241749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44171	NC_016077	GCA	2	6	2241777	2241782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352685572
44172	NC_016077	CAG	2	6	2241814	2241819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352685572
44173	NC_016077	TTC	2	6	2241827	2241832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352685572
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44179	NC_016077	CAA	2	6	2242039	2242044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352685572
44180	NC_016077	ATG	2	6	2242074	2242079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685572
44181	NC_016077	GCTC	2	8	2242090	2242097	0 %	25 %	25 %	50 %	352685572
44182	NC_016077	CCAT	2	8	2242140	2242147	25 %	25 %	0 %	50 %	352685572
44183	NC_016077	GCC	2	6	2242172	2242177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352685572
44184	NC_016077	ATG	3	9	2242197	2242205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685572
44185	NC_016077	TGC	2	6	2242276	2242281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685572
44186	NC_016077	TAG	2	6	2242374	2242379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685572
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44192	NC_016077	CGA	2	6	2242750	2242755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352685572
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44195	NC_016077	GTTA	2	8	2242970	2242977	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44196	NC_016077	TATCTA	2	12	2242978	2242989	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44197	NC_016077	TTA	2	6	2242992	2242997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44198	NC_016077	ATG	2	6	2243049	2243054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44199	NC_016077	GAA	3	9	2243073	2243081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44200	NC_016077	AGG	2	6	2243187	2243192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352685573
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44204	NC_016077	TAG	2	6	2243355	2243360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685573
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44220	NC_016077	ATAG	2	8	2244482	2244489	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44221	NC_016077	CCCT	2	8	2244502	2244509	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
44222	NC_016077	CTTC	2	8	2244535	2244542	0 %	50 %	0 %	50 %	352685574
44223	NC_016077	TGC	2	6	2244563	2244568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685574
44224	NC_016077	TGC	2	6	2244589	2244594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685574
44225	NC_016077	AGA	2	6	2244636	2244641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352685574
44226	NC_016077	GCT	2	6	2244745	2244750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685574
44227	NC_016077	GGT	2	6	2244796	2244801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352685574
44228	NC_016077	TCC	2	6	2244825	2244830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352685574
44229	NC_016077	TCA	2	6	2244849	2244854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352685574
44230	NC_016077	TGCCGC	2	12	2245015	2245026	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	352685574
44231	NC_016077	CCTT	2	8	2245133	2245140	0 %	50 %	0 %	50 %	352685574
44232	NC_016077	ATAGG	2	10	2245271	2245280	40 %	20 %	40 %	0 %	352685574
44233	NC_016077	GCC	2	6	2245322	2245327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352685574
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44245	NC_016077	CTG	2	6	2245955	2245960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685574
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44260	NC_016077	A	7	7	2246355	2246361	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44261	NC_016077	AAAG	2	8	2246377	2246384	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44262	NC_016077	GGACA	2	10	2246389	2246398	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
44263	NC_016077	TCA	2	6	2246503	2246508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352685575
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44333	NC_016077	CTG	2	6	2250299	2250304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685576
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44342	NC_016077	CTTT	2	8	2250698	2250705	0 %	75 %	0 %	25 %	352685576
44343	NC_016077	T	6	6	2250703	2250708	0 %	100 %	0 %	0 %	352685576
44344	NC_016077	CTC	2	6	2250722	2250727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44345	NC_016077	TCCT	2	8	2250734	2250741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
44346	NC_016077	GAAG	2	8	2250746	2250753	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44347	NC_016077	TGT	2	6	2250855	2250860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352685577
44348	NC_016077	TTC	2	6	2250873	2250878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352685577
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44350	NC_016077	TTTC	2	8	2250892	2250899	0 %	75 %	0 %	25 %	352685577
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