MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidaminococcus intestini RyC-MR95 chromosome

Total Repeats: 49107

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016077	T	6	6	29	34	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016077	TCC	2	6	104	109	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_016077	ATG	2	6	152	157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016077	GGT	2	6	163	168	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016077	TTC	2	6	192	197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352683412
6	NC_016077	A	6	6	253	258	100 %	0 %	0 %	0 %	352683412
7	NC_016077	AGA	2	6	291	296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683412
8	NC_016077	GCT	2	6	300	305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683412
9	NC_016077	AATG	2	8	315	322	50 %	25 %	25 %	0 %	352683412
10	NC_016077	ATAA	2	8	343	350	75 %	25 %	0 %	0 %	352683412
11	NC_016077	AGA	2	6	441	446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683412
12	NC_016077	GCA	2	6	472	477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683412
13	NC_016077	CAAAG	2	10	480	489	60 %	0 %	20 %	20 %	352683412
14	NC_016077	TTC	2	6	528	533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352683412
15	NC_016077	CAA	2	6	702	707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352683412
16	NC_016077	TCCA	2	8	781	788	25 %	25 %	0 %	50 %	352683412
17	NC_016077	AATA	2	8	814	821	75 %	25 %	0 %	0 %	352683412
18	NC_016077	A	6	6	867	872	100 %	0 %	0 %	0 %	352683412
19	NC_016077	GAA	2	6	886	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683412
20	NC_016077	TTC	2	6	892	897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352683412
21	NC_016077	ATC	2	6	934	939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683412
22	NC_016077	GCC	2	6	1029	1034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352683412
23	NC_016077	GAA	2	6	1062	1067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683412
24	NC_016077	CCA	2	6	1133	1138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352683412
25	NC_016077	GAA	2	6	1210	1215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683412
26	NC_016077	CAG	2	6	1285	1290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683412
27	NC_016077	ACA	2	6	1307	1312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352683412
28	NC_016077	GTAT	2	8	1376	1383	25 %	50 %	25 %	0 %	352683412
29	NC_016077	GGC	2	6	1435	1440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683412
30	NC_016077	CA	3	6	1447	1452	50 %	0 %	0 %	50 %	352683412
31	NC_016077	TAA	2	6	1572	1577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016077	CTT	2	6	1646	1651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352683413
33	NC_016077	CAA	2	6	1686	1691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352683413
34	NC_016077	CTA	3	9	1769	1777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683413
35	NC_016077	GGC	2	6	1779	1784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016077	AGG	2	6	1816	1821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016077	A	6	6	1880	1885	100 %	0 %	0 %	0 %	352683414
38	NC_016077	T	6	6	1914	1919	0 %	100 %	0 %	0 %	352683414
39	NC_016077	TTG	2	6	1959	1964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352683414
40	NC_016077	AAG	2	6	2100	2105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683414
41	NC_016077	CTG	2	6	2228	2233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683414
42	NC_016077	TGA	2	6	2272	2277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683414
43	NC_016077	A	6	6	2312	2317	100 %	0 %	0 %	0 %	352683414
44	NC_016077	GCA	2	6	2320	2325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683414
45	NC_016077	GAC	2	6	2390	2395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683414
46	NC_016077	CAT	2	6	2479	2484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683414
47	NC_016077	ATT	2	6	2562	2567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352683414
48	NC_016077	TCC	2	6	2578	2583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352683414
49	NC_016077	TCGG	2	8	2596	2603	0 %	25 %	50 %	25 %	352683414
50	NC_016077	ACA	2	6	2667	2672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352683414
51	NC_016077	CAGC	2	8	2718	2725	25 %	0 %	25 %	50 %	352683414
52	NC_016077	GAA	2	6	2771	2776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683414
53	NC_016077	TCC	2	6	2864	2869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352683414
54	NC_016077	ATG	2	6	2885	2890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683414
55	NC_016077	TGA	2	6	2896	2901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683414
56	NC_016077	TCCT	2	8	2902	2909	0 %	50 %	0 %	50 %	352683414
57	NC_016077	AGC	2	6	2947	2952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683414
58	NC_016077	CAT	2	6	2977	2982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683415
59	NC_016077	TAT	2	6	3082	3087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352683415
60	NC_016077	GCG	2	6	3088	3093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683415
61	NC_016077	TTTCG	2	10	3101	3110	0 %	60 %	20 %	20 %	352683415
62	NC_016077	ATG	2	6	3119	3124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683415
63	NC_016077	GAT	2	6	3316	3321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683415
64	NC_016077	GCG	2	6	3351	3356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683415
65	NC_016077	GCA	2	6	3432	3437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683415
66	NC_016077	CT	3	6	3514	3519	0 %	50 %	0 %	50 %	352683415
67	NC_016077	GAA	2	6	3562	3567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683415
68	NC_016077	CTATC	2	10	3628	3637	20 %	40 %	0 %	40 %	352683415
69	NC_016077	TCC	2	6	3666	3671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352683415
70	NC_016077	CTTTCT	2	12	3679	3690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352683415
71	NC_016077	GGCA	2	8	3695	3702	25 %	0 %	50 %	25 %	352683415
72	NC_016077	AAG	2	6	3710	3715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683415
73	NC_016077	GAT	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683415
74	NC_016077	AGG	2	6	3797	3802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352683415
75	NC_016077	CAG	2	6	3835	3840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683415
76	NC_016077	TATCC	2	10	3904	3913	20 %	40 %	0 %	40 %	352683415
77	NC_016077	CTT	2	6	3916	3921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352683415
78	NC_016077	GTG	2	6	4034	4039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352683415
79	NC_016077	GTTC	2	8	4057	4064	0 %	50 %	25 %	25 %	352683415
80	NC_016077	GGA	2	6	4074	4079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352683415
81	NC_016077	ATTG	2	8	4097	4104	25 %	50 %	25 %	0 %	352683415
82	NC_016077	GGC	2	6	4195	4200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683416
83	NC_016077	GCT	2	6	4300	4305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683416
84	NC_016077	TGC	2	6	4306	4311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683416
85	NC_016077	A	6	6	4333	4338	100 %	0 %	0 %	0 %	352683416
86	NC_016077	GAA	2	6	4391	4396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683416
87	NC_016077	CGCGG	2	10	4444	4453	0 %	0 %	60 %	40 %	352683416
88	NC_016077	CTG	2	6	4462	4467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683416
89	NC_016077	A	8	8	4558	4565	100 %	0 %	0 %	0 %	352683416
90	NC_016077	CAT	2	6	4765	4770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683416
91	NC_016077	AAAG	2	8	4775	4782	75 %	0 %	25 %	0 %	352683416
92	NC_016077	AAC	2	6	4815	4820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352683416
93	NC_016077	A	6	6	4829	4834	100 %	0 %	0 %	0 %	352683416
94	NC_016077	ATC	2	6	4842	4847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683417
95	NC_016077	CAA	2	6	4865	4870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352683417
96	NC_016077	CCG	2	6	4947	4952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352683417
97	NC_016077	ATC	2	6	4980	4985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683417
98	NC_016077	AGA	2	6	5079	5084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683418
99	NC_016077	GCAGA	2	10	5113	5122	40 %	0 %	40 %	20 %	352683418
100	NC_016077	CAT	2	6	5200	5205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683418
101	NC_016077	TTG	2	6	5270	5275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352683418
102	NC_016077	GTT	2	6	5365	5370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352683418
103	NC_016077	CGG	2	6	5424	5429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683418
104	NC_016077	A	6	6	5491	5496	100 %	0 %	0 %	0 %	352683418
105	NC_016077	TGA	2	6	5607	5612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683418
106	NC_016077	GAT	2	6	5710	5715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683418
107	NC_016077	AT	3	6	5772	5777	50 %	50 %	0 %	0 %	352683418
108	NC_016077	CAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352683418
109	NC_016077	AAT	2	6	5902	5907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352683418
110	NC_016077	AGA	2	6	5916	5921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683418
111	NC_016077	TGA	2	6	6027	6032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683418
112	NC_016077	GAA	2	6	6195	6200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683418
113	NC_016077	TC	3	6	6219	6224	0 %	50 %	0 %	50 %	352683418
114	NC_016077	GC	3	6	6278	6283	0 %	0 %	50 %	50 %	352683418
115	NC_016077	GAA	2	6	6337	6342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683418
116	NC_016077	TCG	2	6	6356	6361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683418
117	NC_016077	GGC	2	6	6376	6381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683418
118	NC_016077	AAC	2	6	6478	6483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352683418
119	NC_016077	ATC	3	9	6565	6573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683418
120	NC_016077	GCT	2	6	6612	6617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683418
121	NC_016077	TTC	2	6	6625	6630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352683418
122	NC_016077	GCC	2	6	6681	6686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352683418
123	NC_016077	GGA	2	6	6882	6887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352683418
124	NC_016077	CGC	2	6	6943	6948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352683418
125	NC_016077	AGG	2	6	6996	7001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352683418
126	NC_016077	GCT	3	9	7013	7021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683419
127	NC_016077	TTG	2	6	7072	7077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352683419
128	NC_016077	CTT	2	6	7107	7112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352683419
129	NC_016077	GCT	2	6	7113	7118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683419
130	NC_016077	GA	3	6	7121	7126	50 %	0 %	50 %	0 %	352683419
131	NC_016077	GGGCT	2	10	7171	7180	0 %	20 %	60 %	20 %	352683419
132	NC_016077	GGGACA	2	12	7201	7212	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	352683419
133	NC_016077	A	6	6	7234	7239	100 %	0 %	0 %	0 %	352683419
134	NC_016077	GCT	2	6	7334	7339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683419
135	NC_016077	GCG	2	6	7345	7350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683419
136	NC_016077	G	7	7	7354	7360	0 %	0 %	100 %	0 %	352683419
137	NC_016077	CGT	2	6	7427	7432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683419
138	NC_016077	TGA	2	6	7439	7444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683419
139	NC_016077	T	7	7	7459	7465	0 %	100 %	0 %	0 %	352683419
140	NC_016077	TGC	2	6	7522	7527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683419
141	NC_016077	CAA	2	6	7619	7624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352683419
142	NC_016077	TGGC	2	8	7627	7634	0 %	25 %	50 %	25 %	352683419
143	NC_016077	GGC	3	9	7781	7789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683420
144	NC_016077	CAA	2	6	7852	7857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352683420
145	NC_016077	CAC	2	6	7891	7896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352683420
146	NC_016077	TGC	2	6	7929	7934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683420
147	NC_016077	TGC	2	6	8023	8028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683420
148	NC_016077	AAG	2	6	8060	8065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683420
149	NC_016077	ATG	2	6	8151	8156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683420
150	NC_016077	T	6	6	8159	8164	0 %	100 %	0 %	0 %	352683420
151	NC_016077	CAG	2	6	8226	8231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683420
152	NC_016077	TCC	2	6	8424	8429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352683420
153	NC_016077	GTCA	2	8	8476	8483	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_016077	GC	3	6	8673	8678	0 %	0 %	50 %	50 %	352683421
155	NC_016077	CGG	2	6	8716	8721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683421
156	NC_016077	ATGA	2	8	8734	8741	50 %	25 %	25 %	0 %	352683421
157	NC_016077	CAA	2	6	8757	8762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352683421
158	NC_016077	ATC	2	6	8810	8815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683421
159	NC_016077	TGG	2	6	8885	8890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352683421
160	NC_016077	TCC	2	6	8925	8930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352683421
161	NC_016077	GCT	2	6	8932	8937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683421
162	NC_016077	ATG	2	6	9026	9031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683421
163	NC_016077	CTG	2	6	9092	9097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683421
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167	NC_016077	CAT	2	6	9507	9512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683421
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171	NC_016077	ATC	2	6	9740	9745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683421
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191	NC_016077	GTCC	2	8	10639	10646	0 %	25 %	25 %	50 %	352683421
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200	NC_016077	AAT	2	6	11069	11074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352683421
201	NC_016077	TGGA	2	8	11087	11094	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
202	NC_016077	TACC	2	8	11132	11139	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
203	NC_016077	TA	4	8	11142	11149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
204	NC_016077	G	6	6	11150	11155	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
205	NC_016077	TCT	2	6	11191	11196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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218	NC_016077	GAA	2	6	11737	11742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
219	NC_016077	AT	3	6	11812	11817	50 %	50 %	0 %	0 %	352683423
220	NC_016077	T	7	7	11838	11844	0 %	100 %	0 %	0 %	352683423
221	NC_016077	TCCTT	2	10	11850	11859	0 %	60 %	0 %	40 %	352683423
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223	NC_016077	CATTT	2	10	11938	11947	20 %	60 %	0 %	20 %	352683423
224	NC_016077	A	6	6	11959	11964	100 %	0 %	0 %	0 %	352683423
225	NC_016077	ATA	2	6	11972	11977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352683423
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230	NC_016077	GAT	2	6	12304	12309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683423
231	NC_016077	TTTC	2	8	12354	12361	0 %	75 %	0 %	25 %	352683423
232	NC_016077	CATG	2	8	12387	12394	25 %	25 %	25 %	25 %	352683423
233	NC_016077	TGAT	2	8	12413	12420	25 %	50 %	25 %	0 %	352683423
234	NC_016077	TTTC	2	8	12521	12528	0 %	75 %	0 %	25 %	352683423
235	NC_016077	TAG	3	9	12557	12565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683423
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237	NC_016077	GAT	2	6	12634	12639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683423
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239	NC_016077	GTC	2	6	12677	12682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
240	NC_016077	T	7	7	12696	12702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
241	NC_016077	GC	3	6	12739	12744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
242	NC_016077	AATT	2	8	12750	12757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_016077	CTTT	2	8	12833	12840	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
244	NC_016077	TTAC	2	8	12841	12848	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
245	NC_016077	CAT	2	6	12933	12938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
246	NC_016077	AC	3	6	13135	13140	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
247	NC_016077	CCT	2	6	13177	13182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
248	NC_016077	ATC	2	6	13216	13221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
249	NC_016077	T	6	6	13232	13237	0 %	100 %	0 %	0 %	352683424
250	NC_016077	T	6	6	13247	13252	0 %	100 %	0 %	0 %	352683424
251	NC_016077	GTAT	2	8	13277	13284	25 %	50 %	25 %	0 %	352683424
252	NC_016077	TGG	2	6	13309	13314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352683424
253	NC_016077	TTTCT	2	10	13375	13384	0 %	80 %	0 %	20 %	352683424
254	NC_016077	TCAG	2	8	13395	13402	25 %	25 %	25 %	25 %	352683424
255	NC_016077	AAG	2	6	13406	13411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683424
256	NC_016077	GCG	2	6	13433	13438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683424
257	NC_016077	CGTTC	2	10	13467	13476	0 %	40 %	20 %	40 %	352683424
258	NC_016077	AACG	2	8	13535	13542	50 %	0 %	25 %	25 %	352683424
259	NC_016077	ATA	2	6	13574	13579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352683424
260	NC_016077	TTG	2	6	13594	13599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352683424
261	NC_016077	CCTTTC	2	12	13644	13655	0 %	50 %	0 %	50 %	352683424
262	NC_016077	CCT	2	6	13940	13945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
263	NC_016077	GAC	2	6	13998	14003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683425
264	NC_016077	AAG	2	6	14043	14048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683425
265	NC_016077	AGA	2	6	14096	14101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683426
266	NC_016077	GAAAAA	2	12	14166	14177	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	352683426
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