MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_015942	CAA	2	6	2374303	2374308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200473
48502	NC_015942	GCA	2	6	2374336	2374341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200473
48503	NC_015942	CTG	2	6	2374382	2374387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200473
48504	NC_015942	T	6	6	2374396	2374401	0 %	100 %	0 %	0 %	344200473
48505	NC_015942	TG	3	6	2374409	2374414	0 %	50 %	50 %	0 %	344200473
48506	NC_015942	GCAAGG	2	12	2374431	2374442	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	344200473
48507	NC_015942	ATT	2	6	2374451	2374456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200473
48508	NC_015942	GAG	2	6	2374484	2374489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200473
48509	NC_015942	AGG	2	6	2374509	2374514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200473
48510	NC_015942	GGC	2	6	2374579	2374584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200473
48511	NC_015942	TTG	2	6	2374586	2374591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200473
48512	NC_015942	GTG	2	6	2374712	2374717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200473
48513	NC_015942	TGA	2	6	2374731	2374736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200473
48514	NC_015942	CTG	2	6	2374763	2374768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200473
48515	NC_015942	GGT	2	6	2374780	2374785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200473
48516	NC_015942	TATC	2	8	2374789	2374796	25 %	50 %	0 %	25 %	344200473
48517	NC_015942	GAA	2	6	2374835	2374840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200473
48518	NC_015942	CGG	2	6	2374851	2374856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200473
48519	NC_015942	GAA	2	6	2374859	2374864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200473
48520	NC_015942	A	6	6	2374892	2374897	100 %	0 %	0 %	0 %	344200473
48521	NC_015942	GGA	2	6	2374969	2374974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200473
48522	NC_015942	CAG	2	6	2374987	2374992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200473
48523	NC_015942	ATCC	2	8	2375131	2375138	25 %	25 %	0 %	50 %	344200473
48524	NC_015942	AGG	2	6	2375196	2375201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200473
48525	NC_015942	ATT	2	6	2375267	2375272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200473
48526	NC_015942	GCCGC	2	10	2375353	2375362	0 %	0 %	40 %	60 %	344200473
48527	NC_015942	GC	3	6	2375365	2375370	0 %	0 %	50 %	50 %	344200473
48528	NC_015942	GTT	2	6	2375416	2375421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200473
48529	NC_015942	CG	3	6	2375445	2375450	0 %	0 %	50 %	50 %	344200473
48530	NC_015942	CAA	2	6	2375500	2375505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200473
48531	NC_015942	AGG	2	6	2375508	2375513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200473
48532	NC_015942	CTAC	2	8	2375559	2375566	25 %	25 %	0 %	50 %	344200473
48533	NC_015942	GGC	2	6	2375569	2375574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200473
48534	NC_015942	CGA	2	6	2375654	2375659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200474
48535	NC_015942	GTA	2	6	2375688	2375693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200474
48536	NC_015942	CCT	2	6	2375737	2375742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200474
48537	NC_015942	CCA	2	6	2375776	2375781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200474
48538	NC_015942	TCC	2	6	2375827	2375832	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200474
48539	NC_015942	CCA	2	6	2375875	2375880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200474
48540	NC_015942	A	6	6	2375979	2375984	100 %	0 %	0 %	0 %	344200474
48541	NC_015942	TCA	2	6	2375989	2375994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200474
48542	NC_015942	GAGTAT	2	12	2376060	2376071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200474
48543	NC_015942	GC	3	6	2376159	2376164	0 %	0 %	50 %	50 %	344200474
48544	NC_015942	CTG	2	6	2376195	2376200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200474
48545	NC_015942	CTG	2	6	2376249	2376254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200474
48546	NC_015942	CGC	2	6	2376352	2376357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200474
48547	NC_015942	CGG	2	6	2376374	2376379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200474
48548	NC_015942	TGG	2	6	2376433	2376438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200474
48549	NC_015942	GTA	2	6	2376450	2376455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200474
48550	NC_015942	TGA	2	6	2376461	2376466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200474
48551	NC_015942	TGG	2	6	2376502	2376507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200474
48552	NC_015942	CAT	2	6	2376509	2376514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200474
48553	NC_015942	GAA	2	6	2376515	2376520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200474
48554	NC_015942	CAA	2	6	2376530	2376535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200474
48555	NC_015942	CG	3	6	2376544	2376549	0 %	0 %	50 %	50 %	344200474
48556	NC_015942	TACCG	2	10	2376605	2376614	20 %	20 %	20 %	40 %	344200474
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48561	NC_015942	CGCGAT	2	12	2376858	2376869	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	344200474
48562	NC_015942	CAA	2	6	2376875	2376880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200474
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48564	NC_015942	TACGC	2	10	2376952	2376961	20 %	20 %	20 %	40 %	344200474
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48569	NC_015942	CAGT	2	8	2377094	2377101	25 %	25 %	25 %	25 %	344200474
48570	NC_015942	GCG	2	6	2377116	2377121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200474
48571	NC_015942	CGGC	2	8	2377222	2377229	0 %	0 %	50 %	50 %	344200474
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48574	NC_015942	A	6	6	2377495	2377500	100 %	0 %	0 %	0 %	344200474
48575	NC_015942	TGGAC	2	10	2377616	2377625	20 %	20 %	40 %	20 %	344200474
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48588	NC_015942	CTT	2	6	2378221	2378226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200476
48589	NC_015942	GAA	2	6	2378246	2378251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200476
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48601	NC_015942	TGG	2	6	2379004	2379009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48602	NC_015942	CCGC	2	8	2379072	2379079	0 %	0 %	25 %	75 %	344200477
48603	NC_015942	CGG	2	6	2379221	2379226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200477
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48605	NC_015942	TCT	2	6	2379426	2379431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200477
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48610	NC_015942	GCC	2	6	2379721	2379726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200477
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48734	NC_015942	CGTC	2	8	2385413	2385420	0 %	25 %	25 %	50 %	344200480
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48846	NC_015942	TCG	2	6	2390786	2390791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200488
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48850	NC_015942	ATC	2	6	2390996	2391001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200488
48851	NC_015942	CGCC	2	8	2391025	2391032	0 %	0 %	25 %	75 %	344200488
48852	NC_015942	GGCG	2	8	2391115	2391122	0 %	0 %	75 %	25 %	344200488
48853	NC_015942	CT	3	6	2391131	2391136	0 %	50 %	0 %	50 %	344200488
48854	NC_015942	ATG	2	6	2391156	2391161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200488
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48877	NC_015942	CTG	2	6	2392644	2392649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200490
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48880	NC_015942	CGCC	2	8	2392731	2392738	0 %	0 %	25 %	75 %	344200490
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48887	NC_015942	AG	3	6	2393279	2393284	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48888	NC_015942	AG	3	6	2393303	2393308	50 %	0 %	50 %	0 %	344200491
48889	NC_015942	CT	3	6	2393411	2393416	0 %	50 %	0 %	50 %	344200491
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48943	NC_015942	T	7	7	2395854	2395860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48949	NC_015942	TGC	2	6	2396160	2396165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200493
48950	NC_015942	GCTG	2	8	2396208	2396215	0 %	25 %	50 %	25 %	344200493
48951	NC_015942	GGC	2	6	2396420	2396425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200493
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48954	NC_015942	TGC	2	6	2396601	2396606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200493
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48964	NC_015942	GGC	2	6	2396958	2396963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200494
48965	NC_015942	TGAG	2	8	2396964	2396971	25 %	25 %	50 %	0 %	344200494
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