MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Acidithiobacillus ferrivorans SS3 chromosome

Total Repeats: 65256

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47501	NC_015942	A	6	6	2322826	2322831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47502	NC_015942	CAT	2	6	2322939	2322944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47503	NC_015942	AG	3	6	2323000	2323005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47504	NC_015942	GTAG	2	8	2323023	2323030	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
47505	NC_015942	GCA	2	6	2323079	2323084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47506	NC_015942	TG	3	6	2323144	2323149	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47507	NC_015942	CCGCG	2	10	2323205	2323214	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
47508	NC_015942	GA	3	6	2323260	2323265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47509	NC_015942	TCAA	2	8	2323315	2323322	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47510	NC_015942	AAAT	2	8	2323341	2323348	75 %	25 %	0 %	0 %	344200440
47511	NC_015942	GCC	3	9	2323425	2323433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	344200440
47512	NC_015942	GTG	2	6	2323523	2323528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200440
47513	NC_015942	GAA	2	6	2323539	2323544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200440
47514	NC_015942	GCT	2	6	2323666	2323671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200440
47515	NC_015942	CAA	2	6	2323721	2323726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200440
47516	NC_015942	A	6	6	2323725	2323730	100 %	0 %	0 %	0 %	344200440
47517	NC_015942	TCC	2	6	2323826	2323831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	344200440
47518	NC_015942	ATT	2	6	2323862	2323867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200440
47519	NC_015942	ATG	2	6	2323901	2323906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200440
47520	NC_015942	TAT	2	6	2323909	2323914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200440
47521	NC_015942	TTA	2	6	2323942	2323947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200440
47522	NC_015942	AT	3	6	2323981	2323986	50 %	50 %	0 %	0 %	344200440
47523	NC_015942	CA	3	6	2324003	2324008	50 %	0 %	0 %	50 %	344200440
47524	NC_015942	TAA	2	6	2324028	2324033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200440
47525	NC_015942	CAA	2	6	2324039	2324044	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200440
47526	NC_015942	TAT	2	6	2324098	2324103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200440
47527	NC_015942	TGT	2	6	2324148	2324153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200440
47528	NC_015942	ATT	2	6	2324222	2324227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200440
47529	NC_015942	AGC	2	6	2324292	2324297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200440
47530	NC_015942	ATT	2	6	2324309	2324314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200440
47531	NC_015942	T	6	6	2324382	2324387	0 %	100 %	0 %	0 %	344200440
47532	NC_015942	ATT	2	6	2324420	2324425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200440
47533	NC_015942	ATA	2	6	2324444	2324449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200440
47534	NC_015942	TTC	2	6	2324538	2324543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47535	NC_015942	GT	3	6	2324556	2324561	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47536	NC_015942	TTC	2	6	2324563	2324568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47537	NC_015942	CAA	2	6	2324637	2324642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47538	NC_015942	GCA	2	6	2324697	2324702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47539	NC_015942	GCT	2	6	2324799	2324804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47540	NC_015942	TTC	2	6	2324840	2324845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47541	NC_015942	GAG	2	6	2325008	2325013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47542	NC_015942	CGA	2	6	2325045	2325050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47543	NC_015942	GCA	3	9	2325077	2325085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47544	NC_015942	GGTC	2	8	2325087	2325094	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47545	NC_015942	TGA	2	6	2325196	2325201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47546	NC_015942	GTG	2	6	2325326	2325331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47547	NC_015942	GC	3	6	2325343	2325348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47548	NC_015942	T	6	6	2325417	2325422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47549	NC_015942	ACGG	2	8	2325426	2325433	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47550	NC_015942	AGC	2	6	2325440	2325445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47551	NC_015942	TGC	2	6	2325450	2325455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47552	NC_015942	TGC	2	6	2325583	2325588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47553	NC_015942	G	6	6	2325688	2325693	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47554	NC_015942	TGT	2	6	2325740	2325745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47555	NC_015942	TAG	2	6	2325785	2325790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47556	NC_015942	TACGC	2	10	2325866	2325875	20 %	20 %	20 %	40 %	344200441
47557	NC_015942	TCG	2	6	2325913	2325918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200441
47558	NC_015942	ATG	2	6	2325933	2325938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200441
47559	NC_015942	ACT	2	6	2325954	2325959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200441
47560	NC_015942	GC	3	6	2325989	2325994	0 %	0 %	50 %	50 %	344200441
47561	NC_015942	AATG	2	8	2325995	2326002	50 %	25 %	25 %	0 %	344200441
47562	NC_015942	TTG	2	6	2326041	2326046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344200441
47563	NC_015942	TGG	2	6	2326116	2326121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200441
47564	NC_015942	AGG	2	6	2326149	2326154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200441
47565	NC_015942	GAG	2	6	2326157	2326162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200441
47566	NC_015942	GGT	2	6	2326175	2326180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200441
47567	NC_015942	GGC	2	6	2326403	2326408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200441
47568	NC_015942	GTA	2	6	2326454	2326459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200441
47569	NC_015942	GTG	2	6	2326517	2326522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200441
47570	NC_015942	ATC	2	6	2326533	2326538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200441
47571	NC_015942	GGC	2	6	2326546	2326551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200441
47572	NC_015942	ATC	2	6	2326574	2326579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200441
47573	NC_015942	TGG	2	6	2326650	2326655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344200441
47574	NC_015942	TGCC	2	8	2326659	2326666	0 %	25 %	25 %	50 %	344200441
47575	NC_015942	TCG	2	6	2326708	2326713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200441
47576	NC_015942	CT	3	6	2326726	2326731	0 %	50 %	0 %	50 %	344200441
47577	NC_015942	GGC	2	6	2326736	2326741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	344200441
47578	NC_015942	TA	3	6	2326820	2326825	50 %	50 %	0 %	0 %	344200441
47579	NC_015942	AAC	2	6	2327007	2327012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47580	NC_015942	AGT	2	6	2327032	2327037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47581	NC_015942	AGCA	2	8	2327076	2327083	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47582	NC_015942	TACA	2	8	2327109	2327116	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47583	NC_015942	GCT	2	6	2327167	2327172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47584	NC_015942	ATTAT	2	10	2327207	2327216	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47585	NC_015942	GGAG	2	8	2327234	2327241	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
47586	NC_015942	TGA	2	6	2327294	2327299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200442
47587	NC_015942	AGA	2	6	2327304	2327309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200442
47588	NC_015942	TAC	2	6	2327341	2327346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200442
47589	NC_015942	CGT	2	6	2327387	2327392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200442
47590	NC_015942	CA	4	8	2327408	2327415	50 %	0 %	0 %	50 %	344200442
47591	NC_015942	TA	3	6	2327456	2327461	50 %	50 %	0 %	0 %	344200442
47592	NC_015942	TTA	2	6	2327539	2327544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200442
47593	NC_015942	ATTT	2	8	2327709	2327716	25 %	75 %	0 %	0 %	344200442
47594	NC_015942	CAC	2	6	2327881	2327886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	344200442
47595	NC_015942	TAC	2	6	2327934	2327939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200442
47596	NC_015942	AGA	2	6	2328000	2328005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344200442
47597	NC_015942	AT	3	6	2328029	2328034	50 %	50 %	0 %	0 %	344200442
47598	NC_015942	TA	3	6	2328138	2328143	50 %	50 %	0 %	0 %	344200442
47599	NC_015942	ACA	2	6	2328187	2328192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344200442
47600	NC_015942	ATAA	2	8	2328202	2328209	75 %	25 %	0 %	0 %	344200442
47601	NC_015942	A	8	8	2328208	2328215	100 %	0 %	0 %	0 %	344200442
47602	NC_015942	CAT	2	6	2328223	2328228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344200442
47603	NC_015942	ATG	2	6	2328233	2328238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200442
47604	NC_015942	AGG	2	6	2328281	2328286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344200442
47605	NC_015942	AAAT	2	8	2328293	2328300	75 %	25 %	0 %	0 %	344200442
47606	NC_015942	A	6	6	2328321	2328326	100 %	0 %	0 %	0 %	344200442
47607	NC_015942	CTT	2	6	2328341	2328346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344200442
47608	NC_015942	AAGC	2	8	2328447	2328454	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47609	NC_015942	AGA	2	6	2328507	2328512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47610	NC_015942	AATT	2	8	2328559	2328566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47611	NC_015942	GCT	2	6	2328578	2328583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47612	NC_015942	GAG	2	6	2328593	2328598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47613	NC_015942	TGT	2	6	2328689	2328694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47614	NC_015942	ATTT	2	8	2328711	2328718	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47615	NC_015942	ATA	2	6	2328886	2328891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200443
47616	NC_015942	CTTAT	2	10	2328928	2328937	20 %	60 %	0 %	20 %	344200443
47617	NC_015942	ATG	2	6	2328964	2328969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200443
47618	NC_015942	TAA	2	6	2328983	2328988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344200443
47619	NC_015942	CAAA	2	8	2329014	2329021	75 %	0 %	0 %	25 %	344200443
47620	NC_015942	GAT	2	6	2329242	2329247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200443
47621	NC_015942	AGGC	2	8	2329261	2329268	25 %	0 %	50 %	25 %	344200443
47622	NC_015942	GAT	2	6	2329271	2329276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200443
47623	NC_015942	TAT	2	6	2329277	2329282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344200443
47624	NC_015942	ACAA	2	8	2329313	2329320	75 %	0 %	0 %	25 %	344200443
47625	NC_015942	CTG	2	6	2329339	2329344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344200443
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47630	NC_015942	TGA	2	6	2329606	2329611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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47645	NC_015942	AATA	2	8	2330361	2330368	75 %	25 %	0 %	0 %	344200444
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47653	NC_015942	A	6	6	2330810	2330815	100 %	0 %	0 %	0 %	344200445
47654	NC_015942	A	6	6	2330845	2330850	100 %	0 %	0 %	0 %	344200445
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47669	NC_015942	AATA	2	8	2331777	2331784	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47671	NC_015942	ATTA	2	8	2331815	2331822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47720	NC_015942	GGCTT	2	10	2334313	2334322	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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47725	NC_015942	AGGG	2	8	2334463	2334470	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
47726	NC_015942	CAT	2	6	2334540	2334545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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47729	NC_015942	GT	3	6	2334733	2334738	0 %	50 %	50 %	0 %	344200449
47730	NC_015942	AGC	2	6	2334779	2334784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200449
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47732	NC_015942	TG	3	6	2334844	2334849	0 %	50 %	50 %	0 %	344200449
47733	NC_015942	CATC	2	8	2334868	2334875	25 %	25 %	0 %	50 %	344200449
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47738	NC_015942	GAT	2	6	2335118	2335123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344200449
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47857	NC_015942	GGGT	2	8	2341238	2341245	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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47865	NC_015942	TCTG	2	8	2341485	2341492	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
47866	NC_015942	TGC	2	6	2341569	2341574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47867	NC_015942	CA	3	6	2341632	2341637	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47868	NC_015942	CTG	2	6	2341638	2341643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47869	NC_015942	GCG	2	6	2341737	2341742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47870	NC_015942	GTTG	2	8	2341772	2341779	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47871	NC_015942	CGGA	2	8	2341849	2341856	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47872	NC_015942	GC	3	6	2341899	2341904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47873	NC_015942	GGC	2	6	2341916	2341921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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47876	NC_015942	ACT	2	6	2342066	2342071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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47880	NC_015942	TGG	2	6	2342219	2342224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47881	NC_015942	CTG	2	6	2342229	2342234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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47893	NC_015942	CGA	2	6	2343072	2343077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344200454
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47900	NC_015942	CAGA	2	8	2343430	2343437	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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